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文檔簡(jiǎn)介
1、作者篩選得到一株能顯著抑制白色假絲酵母(Candida albicans)生長(zhǎng)的菌株,通過(guò)測(cè)序確定其為解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens ZJU-2011)。論文首先在5L罐中進(jìn)行發(fā)酵工藝優(yōu)化,確定發(fā)酵條件為:通氣量500 L/h,攪拌轉(zhuǎn)速500 r/min,接種量10%(v/v),裝液量為60%(v/v)??拐婢r(jià)在30h時(shí)達(dá)到了6.9×103 U/mL。進(jìn)一步對(duì)工藝進(jìn)行3T罐放大,效價(jià)達(dá)到了8.5
2、×103 U/mL。在此基礎(chǔ)上采用色譜技術(shù)對(duì)抗真菌化合物進(jìn)行分離純化,首先利用乙醇沉淀和大孔樹(shù)脂吸附去除了可溶物中約84.6%的雜質(zhì)。再通過(guò)反相層析獲得抗真菌有效部位,迸一步通過(guò)凝膠過(guò)濾層析,得到兩個(gè)高純度的組分。最后利用MS和NMR確定這兩個(gè)抗真菌化合物為bacilysin和chlorotetaine。隨后開(kāi)發(fā)了一條適合于規(guī)?;崛acilysin的低壓色譜工藝,產(chǎn)品回收率達(dá)到76%以上,純度達(dá)到95%。
體外抑菌試驗(yàn)測(cè)定
3、了bacilysin對(duì)6株常見(jiàn)病原真菌的最低抑菌濃度(MICs),結(jié)果表明他們對(duì)試驗(yàn)菌株具有明顯的抑制效果(MICs在0.9-7.8μg/mL之間),其中對(duì)克魯氏假絲酵母抑制效果最佳。急性毒性實(shí)驗(yàn)顯示bacilysin對(duì)昆明種小鼠的半致死量(LD50)達(dá)到135.3 g(bacilysin)/kg。體外肝微粒代謝實(shí)驗(yàn)擬合了bacilysin的代謝模型。
為了明確bacilysin的抑菌機(jī)理,對(duì)來(lái)源于Candida albica
4、ns的靶酶-葡萄糖胺-6-磷酸合成酶(Gfa)實(shí)現(xiàn)了高效異源表達(dá)。通過(guò)比較發(fā)現(xiàn)N末端的標(biāo)簽會(huì)嚴(yán)重影響其轉(zhuǎn)氨酶的活性,并且bacilysin對(duì)C-His Gfa的轉(zhuǎn)氨酶活性抑制效果更強(qiáng),而對(duì)N-His Gfa的抑制作用則顯著變?nèi)?。反?yīng)動(dòng)力學(xué)的研究發(fā)現(xiàn):bacilysin與靶酶之間的相互作用是一個(gè)線性混合型抑制反應(yīng)。bacilysin能夠直接與靶酶發(fā)生作用,抑制其轉(zhuǎn)氨酶活性。
進(jìn)一步,通過(guò)分子模擬對(duì)bacilysin抑菌機(jī)理進(jìn)行了
5、模擬。首先,對(duì)構(gòu)成bacilysin的非蛋白質(zhì)氨基酸-anticapsin和bacilysin的跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程進(jìn)行了模擬。通過(guò)對(duì)接發(fā)現(xiàn)bacilysin能夠以合理的構(gòu)型穩(wěn)定地存在于轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的內(nèi)部,而anticapsin不能與轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白發(fā)生有效的作用。動(dòng)力學(xué)模擬顯示,當(dāng)體系達(dá)到平衡狀態(tài)時(shí),bacilysin能與轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白形成穩(wěn)定的復(fù)合物。特別的是,僅在bacilysin與轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的復(fù)合物結(jié)構(gòu)中,發(fā)現(xiàn)了影響轉(zhuǎn)運(yùn)的鹽橋(Glu403與配體的N末端氨
6、基之間)。其次,對(duì)anticapsin和bacilysin與Gfa之間的相互作用進(jìn)行了模擬。通過(guò)對(duì)接發(fā)現(xiàn)bacilysin和anticapsin都能在Gfa轉(zhuǎn)氨酶的活性中心以一種相對(duì)合理的構(gòu)型存在。該過(guò)程的動(dòng)力學(xué)模擬顯示整個(gè)的過(guò)程中bacilysin與Gfa的相互作用更強(qiáng)。當(dāng)體系達(dá)到平衡時(shí):Gfa的催化殘基Cys會(huì)朝向bacilysin發(fā)生一定角度的偏轉(zhuǎn),然后Cys上的-SH會(huì)對(duì)bacilysin中羰基C進(jìn)行親核攻擊,形成C-S共價(jià)鍵。
7、由此可以認(rèn)為bacilysin由于更加高效的跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)效率導(dǎo)致了其比anticapsin更高的抗真菌活性。
最后,論文構(gòu)建了一個(gè)能特異性無(wú)痕敲除ZJU-2011中bacD基因的復(fù)制型質(zhì)粒-pBAC-CE以高效生產(chǎn)anticapsin。通過(guò)對(duì)ZJU-2011的感受態(tài)制備以及其電轉(zhuǎn)條件進(jìn)行優(yōu)化,確定最佳電轉(zhuǎn)條件:菌體OD6000.8-0.9,電場(chǎng)強(qiáng)度2.5 kV,電阻200 Q,復(fù)壯時(shí)間4h。在此條件下,將經(jīng)過(guò)SacI線性化的pBA
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