人類細(xì)胞周期及凋亡網(wǎng)絡(luò)的模型建立與模擬分析研究.pdf

1、系統(tǒng)生物學(xué)的發(fā)展使得生物建模和計算機(jī)模擬成為生物過程模擬中越來越重要的手段，可以有力地支持生物學(xué)家及其他研究人員在醫(yī)學(xué)和制藥等領(lǐng)域的研究。將生物實驗的機(jī)理抽象轉(zhuǎn)化為相應(yīng)的數(shù)學(xué)模型，是目前系統(tǒng)生物學(xué)與生物信息學(xué)的主要任務(wù)之一。另一方面，將這些數(shù)學(xué)模型在軟件平臺上可視化的表達(dá)與實現(xiàn)，已經(jīng)成為了模擬生物網(wǎng)絡(luò)強(qiáng)有力的輔助手段，可以進(jìn)行生物實驗中不便于展開的操作。
　　細(xì)胞周期的生物機(jī)理已經(jīng)展開了大量的研究，但是直到最近仍然有新的實驗結(jié)論出

2、現(xiàn)。一些非編碼的miRNA已經(jīng)被確認(rèn)能夠參與細(xì)胞網(wǎng)絡(luò)中的調(diào)控，例如細(xì)胞周期網(wǎng)絡(luò)。
　　本文整合最新發(fā)現(xiàn)的生物實驗結(jié)論，將這些結(jié)論結(jié)合到已有的細(xì)胞周期模型中，定性的將miRNA對靶mRNA的調(diào)控也加入其中。更進(jìn)一步的設(shè)計出定性合理的可伸縮時鐘模型，可以更好的模擬該網(wǎng)絡(luò)。然后將整合好的模型通過 CellMatlab軟件平臺模擬實現(xiàn)，驗證了該模型。并且通過一系列的模擬實驗預(yù)測了在同時受到 miRNA抑制的前提下，miRNA的靶mRNA具

3、有正協(xié)同作用；miRNA與細(xì)胞周期網(wǎng)絡(luò)的系統(tǒng)一樣，具有飽和性。
　　細(xì)胞凋亡網(wǎng)絡(luò)的機(jī)理仍在廣泛的研究中，其中p53居于其上游的核心位置。更是有研究表明，該網(wǎng)絡(luò)與細(xì)胞周期網(wǎng)絡(luò)存在著緊密聯(lián)系。二者的相互作用在醫(yī)療領(lǐng)域研究對癌癥的治療具有重要意義。本文主要考察細(xì)胞凋亡網(wǎng)絡(luò)重要轉(zhuǎn)錄因子p53與周期網(wǎng)絡(luò)重要轉(zhuǎn)錄因子E2F的關(guān)系，逐步抽象建立了關(guān)于二者的負(fù)反饋環(huán)模型。在此模型基礎(chǔ)上，通過穩(wěn)態(tài)分析，推導(dǎo)并討論了p53抑制 E2F通路對細(xì)胞狀態(tài)的