2006-2007年廣西狂犬病病毒的檢測及N、G基因的測序分析.pdf

1、目的：近年來，廣西已經(jīng)成為我國狂犬病發(fā)病數(shù)最高的省份，而犬是狂犬病病毒最主要的帶毒宿主。調(diào)查廣西犬中狂犬病病毒的帶毒情況，分析其遺傳進化特點，為制定合理的疫苗有效控制狂犬病疫情提供科學依據(jù)。 方法：本研究對2006-2007年采自廣兩12個市的485份犬腦材料、387份唾液材料，進行RT-PCR檢測和小鼠腦內(nèi)接種分離，并對病毒的核蛋白和糖蛋白基因進行測序，序列用生物軟件DNASTAR進行核苷酸和氨基酸同源性比較和遺傳進化樹分析。

2、 結(jié)果：一共分離到11株狂犬病病毒，其中腦組織11株，其中有一株從腦組織和唾液均分離到狂犬病病毒。通過生物軟件分析，11株狂犬病毒株可以分為兩十群。其中l(wèi)群毒株包括GXNND(T)、GXHXB、GXLAll、GXQZD，Ⅱ群毒株包括GXLC9、GXPL、GXLCC、GXYZD、GXAll、GXNN2、GXPXD。11株病毒N基因核苷酸同源性89．0％-99．9％，氨基酸同源性97．8％-99．8％。Ⅰ群的N蛋A主要氨基酸位點變異

3、在90、110、332、397位，而Ⅱ群則主要在42位和332位，且兩個群在這些位點的變異與同群參考毒株完全一致，具有群的特異性。11株G基因核苷酸同源性在86.9％-99．9％，氧基酸吲源性在93.9％-99．8％。G蛋白的氨基酸的變異主要發(fā)生在信號肽與成熟肽，其信號肽與成熟肽的變異也具有群的著異性，Ⅰ群主要的變異位點在第-6、-7、96、132、156、436、443、447位；Ⅱ群主要的變異位點在第-4、-5、-15、-18、90

4、、156、168、204、249、253、289、332、382、427、443、463、474、486、487位。這11株的N P主要抗原位點沒有發(fā)生變異，Ⅰ群磷酸化位點Ser389也沒有變化，且Th細胞表位的氨基酸十分保守。這11株的G P蛋白只有37位和319位兩個糖基化位點。抗原位點GⅠ、GⅡ、GⅢ僅有Ⅱ群毒株的GⅢ的332位纈氨酸變異為異亮氨酸。 從地域分布看，本研究分離的毒株大多來自南寧和柳州，Ⅱ群主要分布在的桂西一