HPV陽性和陰性宮頸癌細(xì)胞系基因表達(dá)譜的研究.pdf

1、目的：探討HPV陽性和HPV陰性宮頸癌細(xì)胞系基因表達(dá)譜的差異，篩選可能與HPV感染相關(guān)的差異表達(dá)基因。
　　 方法：常規(guī)培養(yǎng)HPV陽性宮頸癌細(xì)胞系(HeLa和Caski)和HPV陰性宮頸癌細(xì)胞系(HT-3和C-33A)，提取細(xì)胞總RNA并純化，采用Agilent人類全基因組表達(dá)譜芯片檢測基因表達(dá)水平，比較HPV陽性和HPV陰性宮頸癌細(xì)胞系基因表達(dá)譜差異，對差異表達(dá)基因進(jìn)行聚類分析、功能注釋和生物反應(yīng)通路分析，實(shí)時(shí)熒光定量PCR(

2、Real-time quantitative PCR，qRT-PCR)驗(yàn)證芯片結(jié)果。
　　 結(jié)果：①聚類熱圖和散點(diǎn)圖分析，HPV陽性和HPV陰性宮頸癌細(xì)胞系之間基因表達(dá)譜有明顯差異。②芯片檢測結(jié)果顯示，HPV陽性和HPV陰性宮頸癌細(xì)胞系之間差異表達(dá)基因721條，其中401條基因在HPV陽性富頸癌細(xì)胞系中表達(dá)上調(diào)，320條基因表達(dá)下調(diào)。與腫瘤相關(guān)的差異表達(dá)基因涉及翻譯轉(zhuǎn)錄、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞增殖和細(xì)胞死亡及凋亡等多種生物學(xué)過程。③選取

3、AKR1C3、TREX1、WNT5A、RASSF1、BCL11A、DKK3、FHIT、IGFBP2和IGF2共9條差異表達(dá)基因進(jìn)行驗(yàn)證，qRT-PCR結(jié)果與芯片結(jié)果基本一致。
　　 結(jié)論：HPV感染可導(dǎo)致HPV陽性和HPV陰性宮頸癌細(xì)胞系基因表達(dá)的差異，差異表達(dá)基因涉及多種生物學(xué)過程，提示HPV可能通過不同的生物反應(yīng)通路參與宮頸癌的發(fā)生發(fā)展。通過對全基因組水平大量差異表達(dá)基因綜合分析，可為進(jìn)一步尋找可能的HPV相關(guān)腫瘤分子標(biāo)記物