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![小麥基因組中鈣依賴型蛋白激酶家族的生物信息學(xué)分析.pdf_第1頁(yè)](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/8/14884171-3c43-465e-91f7-20344e793bc4/14884171-3c43-465e-91f7-20344e793bc41.gif)
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1、鈣依賴型蛋白激酶(Calcium dependent protein kinase,CDPK)在植物的發(fā)育、激素反應(yīng)、代謝調(diào)節(jié)、逆境脅迫以及防御反應(yīng)等過(guò)程中具有廣泛的生理功能。本研究應(yīng)用生物信息學(xué)方法,從數(shù)據(jù)庫(kù)中挖掘出與小麥CDPK相關(guān)的序列,通過(guò)尋找迭代群或EST拼接確定小麥基因組中編碼CDPK家族的UniGene;將所獲得到的核酸和蛋白質(zhì)序列與近緣物種進(jìn)行比對(duì)分析,對(duì)CDPK家族進(jìn)行分類;對(duì)所獲得的全長(zhǎng)CDPK蛋白質(zhì)構(gòu)象和生物學(xué)功能
2、進(jìn)行預(yù)測(cè)。通過(guò)以上研究,為進(jìn)一步在基因組范圍內(nèi)對(duì)小麥CDPK家族的組成、基因克隆和生物功能的研究奠定基礎(chǔ)。 所獲得的主要研究結(jié)果如下: 1、獲得了162條小麥CDPK ESTs的序列信息。 2、通過(guò)尋找迭代群或EST拼接,得到了10條UniGene相應(yīng)的全長(zhǎng)ORF序列。在氨基酸水平比對(duì)相同物種ORF編碼的蛋白質(zhì)序列和近緣物種相似蛋白序列,表明所得UniGene為小麥中未報(bào)道的cdpk基因。 3、通過(guò)蛋白質(zhì)
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