藏豬肌肉生長(zhǎng)抑制素（MSTN）基因的多態(tài)性研究及其序列分析.pdf

1、本文通過自行設(shè)計(jì)引物，利用PCR.SSCP技術(shù)分析了藏豬肌肉生長(zhǎng)抑制素(MSTN)基因3個(gè)外顯子的多態(tài)性；利用計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)技術(shù)和生物信息學(xué)方法，比較分析了藏豬與登錄在GenBank中的其它豬種以及其它物種：MSTN基因編碼區(qū)序列特點(diǎn)。本研究為藏豬遺傳資源的全面分析積累了資料，為合理利用藏豬優(yōu)良的遺傳資源提供了理論依據(jù)。 研究結(jié)果表明，藏豬MSTN基因外顯子1表現(xiàn)多態(tài)性，存在A、C兩種等位基因和AA、AC、CC三種基因型，三種基因型

2、頻率分別為20.54％、52.68％、26.78％，A、C兩種等位基因的頻率分別為46.88％和53.12％。通過序列測(cè)定，將所獲序列和GenBank中登錄的豬MSTN基因全序列(AY208121)相應(yīng)片段進(jìn)行比對(duì)，首次拼接出了藏豬MSTN基因完整的編碼區(qū)序列，共1128bp(GenBank登錄號(hào)為EF612791)，A、T、G、C四種堿基的含量分別為32.8％、25.3％、21.1％、20.8％，其中G+C的含量(41.9％)低于A+

3、T的含量(58.1％)。藏豬MSTN基因編碼區(qū)71bp處存在A→C單堿基突變，該突變導(dǎo)致編碼的第24位氨基酸由天冬酰胺改變?yōu)樘K氨酸。 藏豬和其它豬種：MSTN基因編碼區(qū)序列比較結(jié)果顯示，品種間MSTN基因編碼區(qū)序列堿基組成差異不大，品種間核苷酸多樣度Pi=0.00197，平均核苷酸差異數(shù)K=2.222；MSTN基因編碼區(qū)71bp處的突變僅在藏豬中發(fā)現(xiàn)；藏豬MSTN基因編碼的蛋白質(zhì)20種氨基酸含量不均衡，以亮氨酸含量最為豐富，組氨

4、酸和色氨酸含量最少，按極性分析，極性氨基酸的含量高于非極性氨基酸；藏豬MSTN基因?qū)νx密碼子的使用具有強(qiáng)烈的偏倚性，其它豬種也表現(xiàn)類似現(xiàn)象。 藏豬和其它物種MSTN基因編碼區(qū)序列比較結(jié)果顯示，藏豬與人、猩猩、牛、羊、狗、鼠的相似度都在90％以上，藏豬與雞和大馬哈魚的相似度分別為83.0％和56.2％；不同物種對(duì)同義密碼子使用的偏倚程度和偏愛類型各不相同，具有種屬特異性；用鄰接法構(gòu)建MSTN基因NJ系統(tǒng)發(fā)育樹，藏豬與其它哺乳綱動(dòng)