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1、群體感應(yīng)是細菌通過分泌一種稱為自誘導(dǎo)劑的信號分子(autoinducer,AI)來感應(yīng)細菌種群密度及周圍環(huán)境變化,進而調(diào)控相關(guān)基因的表達,從而協(xié)調(diào)細菌生物功能的一種信息交流機制。目前發(fā)現(xiàn)群體感應(yīng)與細菌多種行為有關(guān),如生物發(fā)光、生物膜的形成、毒力因子的釋放、抗生素的產(chǎn)生、孢子的形成、細菌的接合、細菌的群集運動等。
在當(dāng)前的抗菌藥物研發(fā)中,耐藥性已成為一個不容忽視的嚴重問題。傳統(tǒng)的抗菌藥是干擾細菌中重要的生命過程來抑制或殺死細
2、菌,此種抗菌藥的最大缺點就是容易產(chǎn)生耐藥性。因此尋找新靶點、新作用機制、開發(fā)新型抗菌藥物,是生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域的緊迫課題之一。群體感應(yīng)抑制劑與傳統(tǒng)抗菌藥的作用機制不同,它是通過抑制細菌群體感應(yīng)調(diào)控的致病行為(如毒力因子的釋放),從而降低細菌的傳染能力,但不會殺死細菌,因此細菌抗藥性的風(fēng)險會大大降低。
由于群體感應(yīng)與細菌的諸多生理活性有關(guān),故而深入了解細菌群體感應(yīng)的調(diào)控機制,可以為細菌感染疾病提供全新的治療手段或藥物。AI
3、-2廣泛存在與革蘭陽性菌和革蘭陰性菌中,被稱為細菌種間信息交流的信號分子,因此研究阻斷AI-2型細菌群體感應(yīng)的抑制劑將成為下一代廣譜抗菌藥的研究方向。值得關(guān)注的是,AI-2的受體蛋白LuxPQ蛋白只存在于細菌中,并且在哺乳動物體內(nèi)無相應(yīng)蛋白和同源家族存在,所以針對LuxPQ蛋白的抑制劑具有高度的選擇性和特異性,而且不易產(chǎn)生對人體的毒副作用。另外目前大多數(shù)抑制劑的設(shè)計主要針對LuxP蛋白而設(shè)計的,但是研究發(fā)現(xiàn)單體狀態(tài)下的LuxP在與Lux
4、Q形成復(fù)合物L(fēng)uxPQ后,其構(gòu)象會發(fā)生改變,進而觸發(fā)AI-2型群體感應(yīng),因此以LuxPQ為靶點進行AI-2型群體感應(yīng)抑制劑的設(shè)計比以LuxP為靶點更為精確,但針對LuxPQ進行藥物設(shè)計研究至今尚未見任何報道。
本課題選定AI-2型群體感應(yīng)的受體蛋白——LuxPQ蛋白為靶標(biāo),采用CHARMM分子動力學(xué)軟件,對芳基呋喃類先導(dǎo)化合物AN-465/43369623和AH-262/34399019與LuxPQ蛋白的復(fù)合物結(jié)構(gòu)進行分子
5、動力學(xué)模擬;同時運用DS/HipHop軟件進行抑制劑藥效團模型的構(gòu)建,以得到關(guān)鍵的藥效基團結(jié)合Lipinski五倍律類藥性原則和藥物的ADMET性質(zhì)等方面的依據(jù),再進行先導(dǎo)化合物結(jié)構(gòu)的合理改造與優(yōu)化,設(shè)計并合成了三氮唑、呋喃和咪唑系列共78小分子群體感應(yīng)抑制劑。
我們選用哈氏弧菌MM32型菌株對78個化合物進行活性測試,活性結(jié)果顯示大多數(shù)化合物對哈氏弧菌MM32型菌株AI-2型群體感應(yīng)具有抑制作用,其中呋喃系列中的11h和
6、11d活性超過了陽性對照KM-03009(IC50=8.9±1.7μM),其IC50分別為7.4±1.7和8.8±2.9μM。三氮唑和咪唑系列化合物相對于陽性對照活性相當(dāng),其中活性較好的化合物5k和91的IC50值為陽性對照的1.5倍,咪唑化合物19zd、19y、19o和19t的IC50值分別是陽性對照的1.23倍、1.34倍、1.35倍和1.48倍。另外我們還對呋喃系列中活性較好的化合物進行細菌毒性測試,結(jié)果顯示大部分所測化合物對細菌
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