在全基因組水平上分析t(8;21)型白血病中常見融合蛋白AML1-ETO的轉錄調控機制.pdf

1、染色體易位常見于白血病中，其中在急性髓系白血病（AML）中有12-15％的病人發(fā)生t(8;21)(q22;q22)染色體易位。由該易位產生的異常融合蛋白AML1-ETO 既能識別AML1 核心序列TGT/cGGT，又能異常招募轉錄抑制復合物，是t(8;21)型白血病發(fā)病的主要因素。
　　 本研究將染色質免疫共沉淀(Chromatin immunoprecipitation, ChIP)技術和高通量的測序技術結合，在含有t(8;2

2、1)易位的AML 病人來源的Kasumi-1 細胞株中開展研究。我們利用生物信息學方法分析AML1-ETO在全基因組上的結合位點，基因結構分析顯示AML1-ETO 傾向于結合在近端啟動子和上游增強子區(qū)，motif 分析顯示AML1 的結合位點顯著性富集。而ChIP 實驗表明AML1 和AML1-ETO 富集片段的重合率高達80％，這說明AML1-ETO 和AML1 基本占據基因組內相同的位置，它們有可能通過相互作用共同調控一些靶基因的轉

3、錄活性。接下來我們通過下游實驗證實AML1-ETO 和AML1 之間確實存在直接相互作用，其相互作用的結構域均為各自的Runt homology domain (RHD)。進一步以腫瘤發(fā)生相關的基因CST7 為例，利用熒光素酶報告基因實驗初步探索了AML1-ETO 和AML1 調控其轉錄活性的機制，發(fā)現在AML1 存在的情況下AML1-ETO 對該基因啟動子活性的抑制作用更加強烈。最后我們結合RNA 干擾技術和表達譜芯片技術在Kasum