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1、酪氨酸相關(guān)蛋白1(tyrosinase related protein1,TYP1)基因和前黑素小體蛋白(premelanosome protein,PMEL)基因是調(diào)控動(dòng)物毛色的主要候選基因,色彩多樣的毛色不僅能豐富人們的生活,其顏色的變化對(duì)自身的生長(zhǎng)速度、對(duì)抗疾病的能力和生產(chǎn)性能有重要影響。啟動(dòng)子作為基因表達(dá)調(diào)控的“指揮者”,不僅能決定轉(zhuǎn)錄起始,還能調(diào)控基因表達(dá)的強(qiáng)弱。本研究利用生物信息學(xué)、比較基因組學(xué)、分子克隆、雙酶切和雙熒光素酶
2、報(bào)告系統(tǒng)探究影響山羊黑色素形成的TYRP1和PMEL基因啟動(dòng)子區(qū)域,通過(guò)點(diǎn)突變技術(shù)對(duì)核心啟動(dòng)子區(qū)域的轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件進(jìn)行突變。結(jié)果對(duì)揭示山羊被毛顏色的分子遺傳機(jī)制具有重要作用。
本研究對(duì)山羊TYRP1基因和PMEL基因5'側(cè)翼序列為模板分別構(gòu)建不同長(zhǎng)度的缺失報(bào)告基因載體,轉(zhuǎn)染至293T細(xì)胞和A375細(xì)胞,利用雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)檢測(cè)螢火蟲(chóng)熒光素酶活性和海腎熒光素酶活性,通過(guò)T檢驗(yàn)驗(yàn)證每個(gè)待測(cè)片段的啟動(dòng)子活性,通過(guò)單因素方差分析比較不
3、同待測(cè)片段間的啟動(dòng)子活性。
結(jié)果表明山羊TYRP1基因構(gòu)建的缺失重組載體與陰性對(duì)照相比無(wú)顯著差異,提示山羊TYRP1基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)之前的1405 bp不是啟動(dòng)子區(qū)域;根據(jù)生物信息學(xué)預(yù)測(cè)和比較基因組學(xué)結(jié)果提示山羊PMEL基因在5'側(cè)翼序列可能存在4個(gè)啟動(dòng)子候選區(qū),對(duì)4個(gè)候選區(qū)域分別構(gòu)建缺失重組載體,293T細(xì)胞和A375細(xì)胞檢測(cè)結(jié)果表明-913/+76區(qū)域?yàn)閱?dòng)子區(qū)域,其中-251/+76為核心轉(zhuǎn)錄區(qū),-251/-62區(qū)域的缺
4、失造成啟動(dòng)子活性從最高到無(wú),表明該區(qū)域?qū)ι窖騊MEL基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控有重要影響,對(duì)-251/-62區(qū)域的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè),綜合多個(gè)軟件結(jié)果,提示在-206/-197、-186/-174、-151/-139、-91/-82和-82/-71存在NF-1、Sp1和CREB轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)。利用點(diǎn)突變技術(shù)對(duì)上述調(diào)控元件進(jìn)行突變、克隆和轉(zhuǎn)染,利用雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)檢測(cè)野生型及突變體在293T細(xì)胞和A375細(xì)胞內(nèi)的活性。結(jié)果提示NF-1(-20
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