LMP基因多態(tài)性與丙型肝炎病毒感染的相關(guān)性研究.pdf

1、適應(yīng)性免疫應(yīng)答是宿主控制病毒感染的重要手段。作為抗原加工和呈遞的中樞-人類白細(xì)胞抗原（human leucocyte antigen，HLA）系統(tǒng)，在對特定病毒的有效應(yīng)答中起著核心作用。病毒感染和清除是機體抗原呈遞通路聯(lián)合作用的結(jié)果。目前研究認(rèn)為:HLA(Ⅰ)類抗原呈遞通路中參與抗原肽產(chǎn)生，轉(zhuǎn)運和呈遞的基因可能存在共同進(jìn)化，共同進(jìn)化將有助于細(xì)胞因子對這些基因的調(diào)控，更好的進(jìn)行抗原呈遞。已有研究表明低分子量多肽(low molecular

2、 weight protein，LMP)基因和HLA-G基因14bp插入/缺失的多態(tài)性與一系列的感染性疾病的發(fā)生、發(fā)展有著密切的關(guān)聯(lián)。近年來，國內(nèi)外一些研究報道了LMP基因與丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus，HCV)感染的關(guān)聯(lián)研究，但是由于種族和人群的差異，結(jié)果并不完全一致。因此，對不同民族、不同樣本的研究顯得非常重要。
　　本研究以云南地區(qū)HCV感染者232名，正常健康對照362名作為研究對象，進(jìn)行第一分部分實驗

3、研究;以云南地區(qū)HCV感染者243名，正常健康對照448名作為研究對象，進(jìn)行第二部分實驗研究。第一部分為LMP基因與HCV感染的關(guān)聯(lián)研究:采用聚合酶鏈反應(yīng)直接測序(Polymerase chain reaction-sequence based typing，PCR-SBT)方法對云南漢族正常人群及HCV感染者LMP基因進(jìn)行分型，進(jìn)行HCV感染的關(guān)聯(lián)分析。第二部分為HLA-G基因14bp插入/缺失多態(tài)與HCV感染的關(guān)聯(lián)研究:采用序列特異

4、引物引導(dǎo)的PCR反應(yīng)(Polymerase chain reaction-sequence specific primer，PCR-SSP)的方法檢測云南漢族正常人群及HCV感染者HLA-G基因第八外顯子3'UTR的一個14 bp插入/缺失多態(tài)位點分布，進(jìn)行HCV感染的關(guān)聯(lián)分析。
　　結(jié)果:
　　(1)對照組和HCV病例組LMP基因6個位點和HLA-G基因14bp插入/缺失的多態(tài)性位點等位基因的頻率分布均符合HWE平衡，人群

5、具有代表性。
　　(2)共檢測出LMP基因的6個多態(tài)性位點:rs17587、rs2071477、rs2071476、rs2071542、rs2071543、rs6924102，對照組中頻率為:rs17587的A和G等位基因頻率分別為0.210和0.790，rs2071477的C和T等位基因頻率分別為0.386和0.614，rs2071476的A和G等位基因頻率分別為0.620和0.380;rs2071542的C和T等位基因頻率分別

6、為0.066和0.934，rs2071543的A和C等位基因頻率分別為0.151和0.849，rs6924102的C和T等位基因頻率分別為0.416和0.584。病例組中頻率為:rs17587的A和G等位基因頻率分別為0.258和0.742，rs2071477的C和T等位基因頻率分別為0.440和0.560，rs2071476的A和G等位基因頻率分別為0.545和0.455; rs2071542的C和T等位基因頻率分別為0.103和0.

7、897，rs2071543的A和C等位基因頻率分別為0.147和0.853，rs6924102的C和T等位基因頻率分別為0.456和0.544。
　　(3)構(gòu)建了LMP2基因SNP位點rs17587，rs2071477，rs2071476的單倍型:ACG與GTA，對照組中頻率分別為0.204和0.610;病例組中頻率分別為0.255和0.543。構(gòu)建了LMP7基因SNP rs2071542，rs2071543，rs6924102的

8、單倍型:CCT與TCT，對照組的頻率分別為0.066和0.511;病例組的頻率分別為0.097和0.437。
　　(4)病例對照關(guān)聯(lián)研究表明:對照組與HCV感染組中LMP基因位點rs2071476和rs6924102的基因型頻率差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P值分別為0.031和0.010，OR值分別為0.733和1.180)。rs2071476和rs2071542等位基因頻率差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P值分別為0.010和0.022，OR值分別為0

9、.733和1.625)。單倍型ACG和GTA在兩組人群中差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P＜0.05)，表明具有單倍型ACG的個體較之不含該單倍型的個體對于HCV感染能夠增加其患病風(fēng)險(OR=1.347，95％ CI1.020～1.779);具有單倍型GTA的個體較之不含該單倍型的個體對于HCV感染能夠降低其患病風(fēng)險(OR=0.760，95％CI0.598～0.965)。單倍型CCT和TCT在兩組人群中差異具有統(tǒng)計學(xué)意義，P值分別為0.047和0.

10、020，表明具有單倍型CCT的個體較之不含該單倍型的個體對于HCV感染能夠增加其患病風(fēng)險(OR=1.537，95％ CI:1.004～2.353);具有單倍型TCT的個體較之不含該單倍型的個體對于HCV感染能夠降低其患病風(fēng)險(OR=0.755，95％CI:0.596～0.957)。
　　(5) HLA-G基因14bp插入/缺失等位基因頻率在對照組中為0.335和0.665;在HCV感染組中為0.348和0.652。無論是基因型頻率