鵝SREBP-2基因的克隆及禽HLH轉(zhuǎn)錄因子的分類和進化分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、SREBPs屬于堿性螺旋-環(huán)-螺旋亮氨酸拉鏈(basic helix-loop-helix leucine-zipper，bHLH-zip)轉(zhuǎn)錄因子家族，是真核細胞內(nèi)調(diào)節(jié)脂質(zhì)合成的關(guān)鍵核轉(zhuǎn)錄因子。本研究測定了朗德鵝(Anser anser)與天府肉(Anser cygnoides)SREBP-2基因的部分mRNA序列，得到了bHLH-zip基序的氨基酸序列，以此為基礎(chǔ)研究了生物體內(nèi)HLH蛋自家族的特點和分類；以雞的基因組為代表，研究了鳥

2、類基因組內(nèi)HLH轉(zhuǎn)錄因子的分類和進化。 序列提交到GenBank數(shù)據(jù)庫中，登陸號為EF579754和EF579755。經(jīng)比對，兩品種鵝序列的相似性100％。 SREBP-2基因bHLH-zip基序在不同物種間保持高度的相似性，通過和其他物種的比較，發(fā)現(xiàn)發(fā)現(xiàn)5、14、23、25、28、32、54位點存在氨基酸多態(tài)位點。在和其它HLH轉(zhuǎn)錄因子比較時，發(fā)現(xiàn)鵝SREBP-2的bHLH-zip基序是一個不含脯氨酸(P)的HLH結(jié)構(gòu)

3、，這種現(xiàn)象還有待進一步研究。 利用鵝SREBP-2 bHLH-zip基序為基礎(chǔ)，對HLH蛋白進行分類。結(jié)果在基因組中搜索到18種相關(guān)結(jié)構(gòu)域，它們和HLH蛋白的功能密切相關(guān)，在進化中又保持了相對的獨立性。這是基因組進化過程中存在的一種“結(jié)構(gòu)域洗排”的機制。 以雞的基因組為代表，研究了鳥類基因組中HLH轉(zhuǎn)錄因子的分類和進化。發(fā)現(xiàn)在雞的基因組中，HLH轉(zhuǎn)錄因子包含28個蛋白家族，可以分為A、B、C、D、E五類。在進化上A和D接

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