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文檔簡介
1、計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的理論的方法不斷走向成熟,開展生物大分子(受體)與先導(dǎo)化合物(配體)的相互作用機(jī)制、蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測等前沿領(lǐng)域的研究具有重要的理論意義和實(shí)用價(jià)值,并能加快發(fā)現(xiàn)創(chuàng)新藥物的步伐。本論文圍繞這些熱點(diǎn)課題,運(yùn)用分子模擬技術(shù),進(jìn)行 HIV 蛋白酶和受體三維結(jié)構(gòu)的預(yù)測、配體-受體相互作用機(jī)制的研究及藥物分子設(shè)計(jì)。 本論文共分四章: 第一章:簡述了計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的基本方法和最新進(jìn)展。 第二章:選擇PDB
2、數(shù)據(jù)庫中HIV蛋白酶復(fù)合物為研究對象,通過分子疊合、分子對接研究,預(yù)測出了這類抑制劑與已經(jīng)上市的抗艾滋病的藥物Saquinavir之間的相似性和對HIV病毒蛋白酶的不同抑制作用。這些工作為基于HIV蛋白酶結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)莫定了基礎(chǔ)。 第三章:選取一組高活性的HIV蛋白水解酶抑制劑為研究對象,通過定量構(gòu)效關(guān)系的研究,得到了這類抑制劑的QSAR模型,建立了這類抑制劑的生物活性指標(biāo)IC<,50>的預(yù)測模型,并成功地預(yù)測了三個(gè)同類抑制劑的
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