前列腺癌相關(guān)氨基酸變異及SNP數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建與功能注釋.pdf

1、前列腺癌是一種發(fā)生在男性生殖系統(tǒng)中的十分常見的惡性腫瘤，它的遺傳機(jī)制尚未明確。最近幾十年，大量文獻(xiàn)報(bào)道了前列腺癌的分子遺傳變異信息，包括突變、缺失、插入、重復(fù)、擴(kuò)增、甲基化和多態(tài)性等，對(duì)于揭示前列腺癌的生物學(xué)機(jī)制具有重要的意義。然而，獲取這些數(shù)據(jù)卻是一個(gè)非常耗時(shí)的過程，目前還沒有一個(gè)專注于搜集前列腺癌相關(guān)變異信息的數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)，因此這類數(shù)據(jù)庫(kù)的建立就顯得尤為迫切。為了使研究人員能夠便捷的獲取前列腺癌相關(guān)的變異數(shù)據(jù)，我們閱讀了大量文獻(xiàn)，搜集

2、并整理了這些數(shù)據(jù)，最終創(chuàng)建了一個(gè)可在線訪問的數(shù)據(jù)庫(kù)“PCaMDB”（http://www.ibio-cn.org/PCAmutbase/home.php/）。該數(shù)據(jù)庫(kù)基于目前公認(rèn)的遺傳變異數(shù)據(jù)平臺(tái) LOVD系統(tǒng)，按照基因型到表型的模式，集合了文獻(xiàn)中報(bào)道的前列腺癌病人信息和變異信息。這些數(shù)據(jù)可供用戶在線查詢及本地下載，同時(shí)用戶還可以提交自己研究發(fā)現(xiàn)的新的變異信息。此外，我們還創(chuàng)建了一個(gè) SNP數(shù)據(jù)庫(kù)，用于搜集前列腺癌相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性數(shù)