粵東地區(qū)喘息性疾病患兒中人類偏肺病毒的檢出及其N蛋白編碼基因的序列分析.pdf

1、目的：了解粵東地區(qū)喘息性疾病患兒的病原體中是否存在人類偏肺病毒(Human Metapneumovirus,HMPV)并分析其N蛋白編碼基因的特征,同時探討其感染的臨床特征,為臨床防治小兒喘息性疾病提供病原學基礎(chǔ)實驗依據(jù)。
　　材料與方法：
　　材料:選取2006年6月1日至2007年6月1日期間因喘息性疾病收住院治療的2歲以下患兒(240例),采集其鼻咽吸取物或咽試子以供病毒學檢測之用,并收集其年齡、性別、癥狀、體征等臨床

2、資料以供分析研究;同時采集同時期健康體檢兒童(100例)的咽試子作為對照研究。
　　方法:1.應用多重PCR篩查呼吸道合胞病毒(RSV),腺病毒(ADV),流感病毒A型,B型(IVA,B),副流感病毒1型,3型(PIV1,3),鼻病毒(RV),博卡病毒( HBOV)。2.應用針對 HMPV的N蛋白基因的RT-PCR引物進行 HMPV基因片段檢測,隨機選取6份RT-PCR擴增陽性產(chǎn)物進行核苷酸序列測定。將所測序列與 GenBank中

3、公布的基因序列進行比較分析,通過生物信息學方法對測定的人偏肺病毒基因片段進行進化分析,分析與其它地方病毒株的同源性。同時對HMPV N蛋白基因陽性病例的臨床資料進行分析。
　　結(jié)果：
　　1.240份小兒喘息性疾病呼吸道標本中,病毒陽性101份(42％),單一病毒感染86份(85%),混合感染15例(占15%);檢出病毒中以RSV占首位,41例(占41%),其次遞減為PIV318例(占18%),RV17例(占17%), IV

4、A16例(占16%),PIV113例(占13%), HMPV12例(占12%),ADV5例(占5%), HBOV4例(占4%),未檢測到IVB。
　　2.240份標本中HMPV陽性率為5%(12/240),在其他病毒陰性標本中陽性率為7.9%(其中2例與其他病毒混合感染,分別與ADV和RV),其中3、4月份為發(fā)病高峰。陽性患兒均為年齡較小的患兒。6份 HMPV陽性標本目標基因部分核苷酸序列與 GenBank中公布的多株 HMPV

5、N基因同源性為80.8%~98.4%。核苷酸序列基因進化樹分析顯示存在2種不同的基因型。12例HMPV陽性患兒均表現(xiàn)發(fā)熱、咳嗽及喘息等臨床癥狀;臨床診斷為毛細支氣管炎8例、喘息型肺炎4例。
　　3.100份健康體檢兒童的呼吸道標本中均未檢測到HMPV特異性基因片段;檢出PIV3:1例,RSV:3例,RV:4例,其余病毒未檢出。
　　結(jié)論：HMPV是粵東地區(qū)嬰幼兒喘息性疾病的重要病毒性病原體之一;與常見呼吸道病毒感染所致疾病的