散發(fā)性帕金森病microRNA表達(dá)譜研究和靶基因預(yù)測.pdf

1、目的:通過microRNA(miRNA)芯片技術(shù)研究散發(fā)性帕金森病(PD)患者血漿中miRNA的表達(dá)譜,進(jìn)而篩選出有差異表達(dá)的miRNA并進(jìn)行靶基因預(yù)測。
　　方法:選取散發(fā)性PD患者6人,根據(jù)有無開-關(guān)現(xiàn)象將其分為T1、T2兩組,其中T1組為無開-關(guān)現(xiàn)象的患者3名,T2組為有開-關(guān)現(xiàn)象的患者3名,并按年齡性別匹配選取健康對照組3名定為C組。從9名實驗對象中采集靜脈血5ml于EDTA抗凝管中,提取總RNA,利用基因芯片技術(shù)篩選散發(fā)

2、性PD患者與健康對照組差異表達(dá)的miRNA,將數(shù)據(jù)歸一化后用T檢驗分析分化表達(dá)的miRNA的統(tǒng)計學(xué)差異。選取T<0.05,表達(dá)倍數(shù)相差兩倍或以上的miRNA進(jìn)行聚類分析和相關(guān)性分析。最后對T1、T2組共表達(dá)的miRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測。
　　結(jié)果:T1、T2與C組血漿中miRNA的表達(dá)有顯著差異,T2組差異性更大,T1和T2之間有共同表達(dá)的miRNAs,其中表達(dá)上調(diào)的是hsa-miR-589-3p和hsa-miR-302e;下調(diào)的是

3、hsa-miR-5582-3p,hsa-miR-4483,hsa-miR-4481,hsa-miR-4501,has-miR-2113,has-miR-493-3p和has-miR-5001-3p。hsa-miR-4483可以預(yù)測到靶基因LRRK2,miR-302e、-589-3p、-5582-3p、-4481、-4501、-2113、-493-3p和-5001-3p可以預(yù)測到基因GIGYF2,miR-302e、-589-3p和-448