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文檔簡介
1、研究背景
組蛋白共價修飾是一種重要的表觀遺傳模式,包括組蛋白乙?;?、甲基化、磷酸化以及泛素化等,其中乙?;c甲基化是目前研究比較多的組蛋白修飾方式。2004年Shi等人的研究組發(fā)現賴氨酸特異性組蛋白去甲基化酶(Lysine specific demethylase1,LSD1),打破了以往認為組蛋白甲基化不可逆的觀點。
在LSD1催化去甲基化反應的過程中,不同的分子伴侶可以介導LSD1作用于不同的底物,從而產生不同的
2、生物學效應。LSD1通過阻遏元素沉默轉錄因子輔阻遏物(Co-repressor of the repressor element silencing transcription factor,CoREST)復合體與靶基因結合時,可以使組蛋白H3上第4位賴氨酸(Lysine,K) H3K4去甲基化,該過程與染色質濃縮及轉錄抑制有關,此時LSD1作為轉錄抑制因子抑制基因的表達。LSD1與雄激素受體(Androgen Receptor,AR)
3、或者雌激素受體(Estrogen Receptor,ER)結合后,可以特異性的催化組蛋白H3上第位賴氨酸(H3K9)的去甲基化。H3K9的去甲基化與染色質的開放構象和基因表達相關,此時AR/ER依賴的基因表達上調,LSD1促進轉錄激活。
近年來多項功能研究發(fā)現LSD1通過調節(jié)靶基因的表達,在腫瘤的發(fā)生、胚胎分化、異染色質的形成、細胞內DNA甲基化狀態(tài)的合理維持以及誘導多能干細胞(inducedpluripotent stem
4、cell,iPS cell)形成等多方面起到重要作用。前期相關研究發(fā)現在前列腺癌、乳腺癌以及血液系統(tǒng)腫瘤等方面,普遍發(fā)現LSD1的高表達,通過敲除LSD1或抑制LSD1作用后,可以明顯抑制腫瘤細胞的增殖。另外,目前已經有多種組蛋白修飾酶抑制劑用于腫瘤的治療,如組蛋白去乙?;敢种苿?Inhibitors of histone deacetylases,HDACi),而LSD1抑制劑也有望成為抗腫瘤藥物開發(fā)的新靶點。深刻認識并揭示LSD1
5、的作用機制和組蛋白甲基化與去甲基化動態(tài)平衡機制,對于腫瘤防治藥物的開發(fā)具有重要意義。
食管癌是世界第八大腫瘤,其發(fā)生具有明顯的地域性,亞洲地區(qū)是食管癌高發(fā)區(qū)之一。早期食管癌患者手術治療后5年生存率高,隨著食管癌的進展,中晚期食管癌患者預后不良,尤其是伴有轉移的患者。同時由于食管癌的早期檢出率偏低,嚴重影響了該病的治療效果。前期研究發(fā)現,如同其他大部分惡性腫瘤一樣,食管癌的發(fā)生和發(fā)展經歷了遺傳物質及表觀遺傳修飾的雙重突變,而表觀
6、遺傳修飾的可逆性也昭示著食管癌預防和有效治療的可能性。LSD1在食管癌中的表達和作用機制目前仍不明確,本研究試闡明LSD1在食管癌的發(fā)生和發(fā)展中可能起到的作用,為食管癌發(fā)生發(fā)展機制的深入探討以及臨床診斷和治療奠定初步基礎。
研究目的
本研究通過對食管癌組織及其組織芯片,食管癌癌前病變以及正常食管黏膜中LSD1表達情況的研究,揭示LSD1表達量與食管癌惡性程度、浸潤深度、轉移等生物學性質的關系,推測LSD1的表達與食管
7、癌患者預后的可能關聯(lián)。同時通過檢測及干預食管癌細胞株內LSD1的表達和作用,觀察細胞的增殖、凋亡、浸潤以及轉移能力變化,進一步探討LSD1在食管癌發(fā)生和發(fā)展中起到的可能作用,從而為食管癌的預防和治療提供新的方案。
研究方法
一、組織標本實驗:探討LSD1在不同臨床組織標本中的表達及意義
實驗分組:正常食管黏膜組織、食管癌癌前病變組織(上皮內瘤變及不典型增生等)及其人食管鱗癌組織三組。
實驗步驟:制
8、作組織蠟塊及組織芯片,HE染色明確臨床診斷。免疫組化染色,檢測上述組織中LSD1和腫瘤增殖抗原Ki67的表達情況,TUNEL檢測食管癌組織芯片中細胞凋亡情況,由兩位病理醫(yī)師根據免疫反應積分打分法(Immnohistochemicalsemi-quantitative Remmele scoring system,IRS)對染色結果分別進行評分,即:免疫組化染色的評分同時考慮免疫反應染色強度(staining intensity,SI)和
9、陽性細胞百分比(positive percent,PP)。SI分值:0分為未見陽性細胞,1分為細胞陽性染色最強處呈現弱陽性,2分為陽性,3分為可見強陽性染色的細胞;PP分為5級:0分為無染色陽性區(qū)域,1分為陽性染色區(qū)域≤10%,2分為陽性區(qū)域介于11%~50%,3分51%~80%,當陽性染色區(qū)域>80%時為4分。IHC得分=SI×PP。最后按得分將結果區(qū)分為陰性表達、高表達與低表達三組:陰性即最終積分為0,低表達即0<積分≤4分,評分>
10、4分為高表達。
經過對食管鱗癌患者術后的隨訪,獲取患者基本資料、相關臨床治療方案及預后信息。分析LSD1表達量與食管癌患者病例資料及預后信息的關系,探討LSD1表達與細胞增殖及凋亡的關系。
二、細胞實驗:探討LSD1表達對食管癌細胞株部分生物學行為的影響
實驗分組:根據食管癌細胞株的不同,分為KYSE150、KYSE450以及EC109三組。
實驗步驟:使用Western Blot及RT-PCR檢
11、測LSD1在不同食管癌細胞株內的蛋白和RNA表達水平。Transwell及劃痕實驗檢測食管癌細胞株在不同LSD1表達水平時的侵襲及運動能力。
三、干擾實驗:敲除LSD1的表達或抑制LSD1的作用,觀察食管癌細胞株生物學行為的改變
1.慢病毒穩(wěn)定敲除食管癌細胞株KYSE450中LSD1的表達,根據敲除程度的不同分為兩組,同時轉染無敲除能力的慢病毒作為對照組。以綠色熒光蛋白(GFP)的穩(wěn)定表達作為慢病毒轉染成功的標志。<
12、br> 實驗分組:慢病毒敲除組1(KD1),慢病毒敲除組2(KD2)以及空載慢病毒轉染的對照組(Negative Control)。
實驗步驟:構建慢病毒敲除食管癌細胞株內LSD1的表達并用Western Blot及RT-PCR的方法進行驗證。檢測食管癌細胞株經LSD1敲除后,侵襲及運動能力的改變。分析細胞生物學行為的改變與LSD1表達的關系。
2.LSD1抑制劑tranylcypromine以不同濃度作用于食管癌
13、細胞株KYSE450,抑制LSD1的去甲基化作用,檢測細胞株內蛋白表達并觀察細胞株生物行為的改變。
實驗分組:根據LSD1抑制劑濃度的不同進行分組,最終作用濃度:0uM(對照),50uM以及250uM。
實驗步驟:以tranylcypromine不同濃度作用于KYSE450細胞株,培養(yǎng)24h后提取細胞株蛋白。以WB的方法檢測細胞內LSD1、H3K4me1、H3K4me2、H3K9me1以及K3K9me2的表達,確定L
14、SD1在食管癌細胞株KYSE450內可能的作用位點。同時,采用劃痕實驗、Transwell實驗等檢測抑制劑不同作用濃度時,細胞侵襲和運動能力的變化。
研究結果
1.獲取正常食管組織29例,食管癌癌前病變組織23例及食管癌組織134例。免疫組化檢測LSD1情況,發(fā)現LSD1在51.7%的正常上皮組織基底部有少量表達;在癌前病變組織內表達陽性率為73.9%,也均為低表達;腫瘤組織中表達陽性率為75.4%,其中43.7%的
15、組織內LSD1表達為強陽性。腫瘤組織中LSD1表達明顯強于正常組織(p<0.01)及處于癌前病變期的食管黏膜組織(p<0.01)。
2.LSD1表達與患者的性別、年齡等基本臨床資料無相關性,與腫瘤的生長類型、分化程度以及浸潤深度等病理資料也無明顯相關。但LSD1表達高低與食管癌的淋巴結轉移有關(p<0.05),且明顯影響患者的生存期,LSD1高表達的患者預后明顯差于LSD1低表達組(p<0.01)。
3.LSD1表達
16、與Ki67均表達在增殖能力比較強的正常食管上皮基底部,且在食管癌組織中LSD1的表達與Ki67具有顯著相關性(p<0.01),LSD1高表達時Ki67的表達也明顯增多。LSD1表達與食管癌腫瘤細胞凋亡無顯著相關性,在食管癌組織切片中凋亡細胞很少,無論LSD1表達高或者低。
4.食管癌細胞株KYSE450,KYSE150及EC109內,LSD1表達量不同,其中KYSE450及KYSE150細胞株內LSD1表達水平明顯高于EC10
17、9細胞(p<0.01)。
5.劃痕實驗及Transwell實驗證實KYSE450及KYSE150細胞的運動能力和侵襲能力均較EC109細胞強(p<0.01)。
6.慢病毒轉染敲除KSE450細胞內LSD1的表達后,得到兩株敲除水平不同的KYSE450細胞,與對照細胞比,敲除LSD1的KYSE450細胞運動和侵襲能力明顯降低,且與LSD1表達水平有關。
7.LSD1抑制劑tranylcypromine作用于K
18、YSE450細胞后,細胞內H3K4me1表達量隨作用濃度增高而降低,H3K4me2隨作用濃度增高而增高,H3K9甲基化水平未出現明顯變化。
8.Tranylcypromine可以明顯抑制KYSE450細胞的運動和侵襲能力,且抑制強度隨藥物作用濃度的升高而增加。
研究結論
1.LSD1在食管癌中表達明顯高于正常食管組織及食管癌癌前病變組織,且LSD1的表達增多與食管癌患者的淋巴結轉移相關,并能影響患者預后。L
19、SD1表達增多與Ki67表達增多正相關,可能與食管癌的增殖能力有關,但與食管癌細胞凋亡無關。
2.不同食管癌細胞株表達LSD1的水平不同,其中侵襲和運動能力較強的KYSE450和KYS150細胞株中LSD1表達較高。
3.慢病毒敲除KYSE450中LSD1的表達后,細胞運動和侵襲能力明顯下降。LSD1抑制劑Tranylcypromine處理KYSE450細胞,可以明顯抑制細胞的侵襲和轉移,同時發(fā)現H3K4的甲基化狀態(tài)
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