PTEN基因SNP及單體型在西南地區(qū)漢族人群的分布及與2型糖尿病的關(guān)系.pdf

1、2型糖尿病(T2DM)是由多種病因引起的具有異質(zhì)性的疾病?，F(xiàn)已認(rèn)識(shí)胰島素抵抗導(dǎo)致外周組織對(duì)葡萄糖的利用減少和胰島B細(xì)胞功能損害是其主要病理機(jī)制。本文通過(guò)對(duì)胰島素作用相關(guān)基因多態(tài)性的研究，旨在明確它們與T2DM的相關(guān)性。 與張力蛋白在10號(hào)染色體上同源缺失的磷酸酶(phosphataseandtensinhomologydeletedonchromosometen，PTEN)基因，起初被作為抑癌基因加以研究。近年來(lái)，研究表明PTE

2、N作為磷脂酶參與胰島素信號(hào)傳導(dǎo)通路的調(diào)控：PTEN可使細(xì)胞內(nèi)的PI(3,4,5)P3濃度下降，從而抑制PI(3,4,5)P3下游蛋白激酶B(P13B)的激活。而在胰島素介導(dǎo)的葡萄糖攝入和糖原合成這一過(guò)程中，3一磷酸脂肌醇激酶(P13K)和P13B的活化是其必備條件，從而推測(cè)PTEN可能參與2型糖尿病的致病，因此將PTEN作為2型糖尿病的一個(gè)候選基因進(jìn)行研究。 本研究旨在了解西南地區(qū)漢族人群PTEN基因SNPs及單體型頻率分布，探

3、討SNP及其3個(gè)位點(diǎn)組成的單體型與2型糖尿病的關(guān)系，積累PTEN基因SNPs在中國(guó)漢族人中的數(shù)據(jù)，有利于T2DM發(fā)病機(jī)理研究。 研究目的 研究中國(guó)漢族人PTEN基因3個(gè)位點(diǎn)的SNP等位基因頻率、基因型頻率及其分布特征。研究PTEN基因SNP及其單體型頻率與2型糖尿病的相關(guān)性。 研究方法 (1)通過(guò)美國(guó)國(guó)家生物信息中心(NCBI)的GeneBank獲取PTEN基因序列及其相應(yīng)位點(diǎn)的SNP信息。利用Prime

4、r5．0軟件設(shè)計(jì)相應(yīng)引物，并經(jīng)NCBI的Blast2．0軟件檢驗(yàn)其特異性。 (2)利用雙向等位特異性PCR技術(shù)檢測(cè)T2DM患者及對(duì)照PTEN基因3個(gè)位點(diǎn)的SNP。 (3)應(yīng)用聚類分析方法分析基因多態(tài)性特征。P值≤O．05具有顯著性差異。 研究結(jié)果 (1)證實(shí)應(yīng)用雙向等位特異性PCR技術(shù)體系檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性，具有操作簡(jiǎn)便、費(fèi)用低廉、結(jié)果穩(wěn)定的優(yōu)點(diǎn)。 (2)rs9651492、rs2673835、r

5、s¨2025902三位點(diǎn)的優(yōu)勢(shì)等位基因(Allele1)的頻率在病人組及正常對(duì)照組分別為：0．68I／0．750、0．828／0．853、0．657／0．612，兩組等位基因頻率分布無(wú)顯著性差異(P值分別為0．2135lO、0．47182l、0．570045)。 (3)rs9651492、rs2673835、rsll2025902三位點(diǎn)等位基因型頻率在病人組及正常對(duì)照組分別為：rs9651492C／C型為0．440／0．559、

6、C／G型為0．483／0．382、G／G型為0．078／0．059，兩組等位基因型頻率分布無(wú)顯著性差異(P值為0．213510)。rs2673835A／A型為0．68I／0．72、A／G型為0．293／0．255、G／G型為0．026／0．020，兩組等位基因型頻率分布無(wú)顯著性差異(P值為0．765997)。rs112025902C／C型為O．112／0．088、C／G型為0．552／0．51O、G／G型為0．336／0．402，兩組等

7、位基性型頻率分布無(wú)顯著性差異(P值為0．570045)。 (4)三個(gè)位點(diǎn)的SNP可以組成八種單體型，在中國(guó)漢族人群中最常見(jiàn)的是¨1(C-A-G)、112(C-A-C)和212(G-A-C)型，它們?cè)诓∪私M及正常對(duì)照組的頻率分別分別為0．42I／0．54l、O．142／0．109、O．128／0．138(P值分別為O．1247、0．309、0．776)，單體型111及211在病人組及正常對(duì)照組分別為0．42I／0．541及O．13

8、7／0．065(P值分別為0．012及0．014)統(tǒng)計(jì)有顯著差異性。提示111及211單體型與中國(guó)西南地區(qū)漢族人2型糖尿病可能存在關(guān)聯(lián)。 結(jié)論 (1)雙向等位特異性引物PCR技術(shù)是一種較為簡(jiǎn)便、特異性較高、費(fèi)用少、便于推廣的SNP檢測(cè)方法，特別是在已知單核苷酸多態(tài)性研究中較有優(yōu)勢(shì)。 (2)本研究首次揭示了中國(guó)漢族人群PTEN基因的3個(gè)位點(diǎn)的SNPs基因單體型分布特征，為進(jìn)一步研究其SNPs基因單體型與生理功能和疾