通過(guò)生物信息學(xué)方法分析microRNA在皰疹病毒和宿主相互作用過(guò)程中所起的作用.pdf

1、MicroRNA是一類(lèi)長(zhǎng)度為22個(gè)堿基左右的，能夠在轉(zhuǎn)錄后水平上調(diào)控基因表達(dá)的非編碼RNA。最近的研究表明，病毒和宿主分別利用microRNA來(lái)實(shí)現(xiàn)免疫逃避或者免疫應(yīng)答。使用microRNA調(diào)控基因表達(dá)對(duì)于病毒來(lái)說(shuō)有著非同尋常的意義，可以使它們通過(guò)一種非免疫原性的方式調(diào)控胞內(nèi)環(huán)境。通過(guò)microRNA調(diào)控自身和對(duì)方的靶基因從而實(shí)現(xiàn)病毒的存活策略和宿主的反制策略，構(gòu)成了受microRNA調(diào)節(jié)的病毒與宿主互作網(wǎng)絡(luò)的核心。宿主編碼的micro

2、RNA可以作用于自身的轉(zhuǎn)錄物或者病毒的轉(zhuǎn)錄物，反之亦然。宿主的microRNA作用于病毒的靶基因是迄今為止研究最為透徹的microRNA介導(dǎo)的病毒防御機(jī)制之一。病毒的microRNA作用于宿主的轉(zhuǎn)錄物可以創(chuàng)造出比較適合病毒存活并復(fù)制的胞內(nèi)環(huán)境。病毒編碼的microRNA可以調(diào)節(jié)病毒自身的轉(zhuǎn)錄物，從而延遲疾病發(fā)生。由這些microRNA調(diào)控的宿主基因有可能在病毒潛伏過(guò)程中的病理生理學(xué)有關(guān)。對(duì)宿主和病毒在分子水平上的相互作用的研究有助于我們

3、發(fā)現(xiàn)病毒潛伏感染的機(jī)制。
　　 根據(jù)miRBase發(fā)布的最新數(shù)據(jù)，有26個(gè)病毒物種能夠編碼microRNA，并且其中大部分是皰疹病毒科病毒。皰疹病毒科病毒是一類(lèi)能夠在動(dòng)物中導(dǎo)致各種疾病，并能導(dǎo)致人類(lèi)疾病的DNA病毒。皰疹病毒科包含3個(gè)亞科，17個(gè)屬和90個(gè)物種。皰疹病毒極可能通過(guò)免疫逃避的方式建立終生感染。在本研究中，我們?cè)噲D從非編碼基因的角度闡釋皰疹病毒和宿主的互作（病毒的免疫逃避和宿主的免疫應(yīng)答）。通過(guò)預(yù)測(cè)靶基因和miRNA