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
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文檔簡介
1、家蠶細小病毒樣病毒(Bombyx mori Parvo-like virus,BmDLV)原稱為家蠶濃核病毒Ⅱ型(Bombyx mori Densovirus typeⅡ,BmDNV-Ⅱ),是首例動物二分病毒,它是引起家蠶濃核癥的重要病原微生物之一。它與家蠶濃核病毒(BmDNV-Ⅰ)一樣,都感染家蠶的中腸組織圓筒形細胞,病毒粒子無囊膜,基因組都為單鏈線性的DNA并且都含末端重復序列。不同的是,該病毒的基因組分為兩個單鏈DNA分子(VD1
2、,6.6 kb;VD2,6.1 kb)且分別獨立包裝在不同的衣殼中;兩條鏈的末端重復序列中無回文序列;并且含有自身編碼的DNA聚合酶;該病毒的復制機制還未知。為了進一步了解該病毒的特性,本研究構建了家蠶細小病毒樣病毒中國鎮(zhèn)江株(BmPLV-Z)的基因組克隆及含報告基因eGFP的重組質(zhì)粒,并對克隆質(zhì)粒的感染性進行了鑒定;另外,對病毒基因編碼的非結(jié)構蛋白NS2進行了序列分析及細胞定位鑒定。
本研究中,主要對BmPLN-Z進行了
3、以下四方面的研究:(1)克隆病毒的基因組,構建穩(wěn)定增殖的VD1和VD2基因組克隆質(zhì)粒,并繪制BmPLV-Z基因組的結(jié)構圖;(2)檢測克隆質(zhì)粒在BmN細胞和家蠶幼蟲中的復制及其感染性;(3)構建帶有報告基因eGFP的重組質(zhì)粒,轉(zhuǎn)染BmN和Sf9細胞,并檢測重組質(zhì)粒的復制和病毒基因的表達;(4)分析病毒非結(jié)構蛋白2(NS2)序列特征,并通過瞬時表達和免疫熒光檢測NS2在BmN細胞中的定位。
1家蠶細小病毒樣病毒中國鎮(zhèn)江株基因組
4、克隆的構建及基因組結(jié)構圖的繪制
根據(jù)病毒基因組末端序列特征,設計帶唯一酶切位點的引物,以裂解的病毒粒子作模板進行基因組全長PCR擴增。VD1全長克隆pT-VD1,經(jīng)全長引物一次PCR擴增產(chǎn)物克隆獲得;VD2全長克隆pUC-VD2,則由基因組中的SacⅠ酶切位點分兩段擴增、克隆,拼接重構形成完整基因組全長克隆。對克隆質(zhì)粒的穩(wěn)定傳代和保存作了培養(yǎng)菌種和溫度的篩選,建立了穩(wěn)定繁殖和保存質(zhì)粒的方法;對克隆基因組進行測序和結(jié)構分析,
5、繪制了較完善的病毒基因組結(jié)構圖。
2基因組克隆的轉(zhuǎn)染及其感染性鑒定
脂質(zhì)體包埋基因組克隆轉(zhuǎn)染BmN細胞和家蠶幼蟲,對克隆基因組的復制及感染性進行檢測。轉(zhuǎn)染的細胞無形態(tài)變化,家蠶幼蟲也正常生長;收集轉(zhuǎn)染后96 h的細胞和家蠶中腸組織,對其DNA和cDNA進行PCR鑒定,結(jié)果未檢測到病毒基因組的復制。
3重組質(zhì)粒pVD1-VPGFP和pVD1-AVPGFP的構建
將基因組克隆pT-VD
6、1用作載體,在vp基因后面插入報告基因eGFP和用eGFP替換vp基因進行重組質(zhì)粒的構建;將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染Sf9和BmN細胞進行基因復制與表達檢測。通過上述實驗,成功地構建了兩個含報告基因的重組質(zhì)粒pVD1-VPGFP和pVD1-ΔVPGFP,并間接地檢測了病毒基因組克隆在細胞中的復制和表達。
4 BmPLV-Z-NS2的序列分析及細胞定位
非結(jié)構蛋白NS2是由VD1-ORF1編碼的。生物信息學分析表明BmPL
7、V-Z-NS2與細小病毒的NS2無同源性,而與染色體復制起始蛋白dnaA和DNA-binding反應調(diào)節(jié)子有一定的同源性。NS2含有1個天冬酰胺-N-糖基化位點、3個酪蛋白激酶C磷酸化位點和3個蛋白激酶C磷酸化位點等可能的功能位點。這些結(jié)構特征顯示NS2可能是一個多功能蛋白。基因轉(zhuǎn)錄分析表明NS2在病毒感染的初期表達量低而后期表達量升高。通過構建的瞬時表達質(zhì)粒pFastBacHTb-ie1p-ns2,轉(zhuǎn)染BmN細胞,用anti-NS2多
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