家蠶和野桑蠶粗肌絲結(jié)構(gòu)基因的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、昆蟲綱在生物多樣性中有著重要地位,它在進化中的成功與飛行能力的獲得有著密切的關(guān)系。而有著水解ATP并將化學能轉(zhuǎn)換為動能的重要功能的粗肌絲是飛行的基礎(chǔ)。昆蟲的粗肌絲主要由肌球蛋白/肌球桿蛋白、副肌球蛋白/小副肌球蛋白、Myofilin和Flightin等蛋白組成。 肌球蛋白是由一對重鏈和兩對輕鏈組成的六聚體蛋白,有著將化學能轉(zhuǎn)變成機械能和形成粗肌絲的雙重作用。肌球蛋白重鏈在大多數(shù)昆蟲中由單基因編碼,通過選擇性編輯產(chǎn)生所有亞型的肽鏈

2、。肌球桿蛋白和肌球蛋白重鏈有同一基因編碼,它僅包括肌球蛋白重鏈的桿狀區(qū)域和一個與輕鏈1同源的較小的N-末端。副肌球蛋白和小副肌球蛋白由同一基因編碼,通過選擇性啟動子的使用產(chǎn)生的2個有著相同C-末端的蛋白。副肌球蛋白同源二聚體在肌肉的組裝過程中,有著形成肌原纖維核心的作用,小副肌球蛋白的作用尚不明確。Fligbtin是僅在間接飛行肌中存在的一個小分子量的粗肌絲結(jié)構(gòu)蛋白,可以調(diào)節(jié)間接飛行肌的性能。Myofilin是最近確認的一個粗肌絲結(jié)構(gòu)蛋

3、白,它可能位于肌原纖維的表面,功能尚不明確。 隨著家蠶基因組測序的完成,必將極大地促進家蠶分子生物學的研究,確立家蠶在鱗翅目昆蟲研究中的地位。而粗肌絲結(jié)構(gòu)的研究,無論是對于探討昆蟲飛行機制的理論基礎(chǔ),還是在害蟲擴散、遷移的預(yù)測,或資源昆蟲的養(yǎng)殖馴化中,都有著重要的意義。但家蠶飛行能力的喪失,使它不能有效代表野外昆蟲,因此以家蠶和與家蠶有著共同祖先的野桑蠶為材料,研究其粗肌絲結(jié)構(gòu)基因。 在本試驗中,通過RT-PCR、PCR

4、、RACE和基因步移技術(shù),對家蠶和野桑蠶的粗肌絲結(jié)構(gòu)基因進行了研究,克隆到家蠶和野桑蠶肌球蛋白重鏈長度分別為22710 bp和23055 bp的基因組序列,包含轉(zhuǎn)錄起始位點上游約1.8 kb和poly(A)信號下游約1.0 kb。并通過生物信息學方法,確定了相關(guān)基因的結(jié)構(gòu)。結(jié)果顯示家蠶和野桑蠶肌球蛋白重鏈由單一基因編碼,該基因在家蠶和野桑蠶中分別存在37和38個外顯子,家蠶中的外顯子24在野桑蠶中被1個大小約為300 bp的內(nèi)含子分割。

5、翻譯起始密碼子位于外顯子2,在末端和次末端外顯子中各有一個終止密碼子。其中外顯子3、8、11、14、17和22是含有多個外顯子的相互排斥型選擇性外顯子組,在mRNA中存在且僅存在這些選擇性編輯外顯子組中的1個;可能含有,也可能排除次末端外顯子。通過選擇性編輯,這一基因最多可以轉(zhuǎn)錄780個亞型。其中在外顯子13和選擇性外顯子3a、8b中存在導(dǎo)致氨基酸序列變化的差異。 副肌球蛋白/小副肌球蛋白基因含有17個外顯子,在使用最上游啟動子

6、時轉(zhuǎn)錄編碼副肌球蛋白的mRNA,而在使用位于外顯子10后面的外顯子時轉(zhuǎn)錄編碼小副肌球蛋白的mRNA,兩者共用3’-末端的7個外顯子??寺〉降募倚Q和野桑蠶副肌球蛋白mRNA長度分別為3250bp和3321 bp,可以編碼877個氨基酸殘基,其中第106和135位氨基酸不同。 家蠶Myofilin基因含有9個外顯子,可以產(chǎn)生3’-末端不同的5個亞型。所有這5個亞型的都使用5’-末端的3個外顯子,且翻譯起始密碼子位于外顯子2中。本實驗

7、從家蠶和野桑蠶成蟲中分別獲得3個亞型,分別編碼113、193和345個氨基酸殘基,其中家蠶和野桑蠶在亞型A和B中的125位存在一個氨基酸殘基得差異。在成蟲中野桑蠶可以產(chǎn)生2個不同的5’-末端,而家蠶僅使用其中的1個轉(zhuǎn)錄起始位點。家蠶的Flightin基因與黑腹果蠅基本相似,都是由4個外顯子組成,且翻譯起始密碼子位于外顯子2中??寺〉降募倚Q和野桑蠶cDNA長度分別為661 bp和663 bp,編碼158個氨基酸殘基,其中在53位存在一個氨

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