快和慢骨骼肌差異表達基因的研究.pdf

1、骨骼肌分為快肌和慢肌2種肌纖維類型，這2種肌纖維類型在結(jié)構(gòu)和功能上有很大的差異。本試驗利用Affymetrix公司的編號為AFF-900623的豬基因組mRNA表達譜芯片檢測快肌(背最長肌)和慢肌(比目魚肌)2種極端類型肌肉中基因的差異表達，希望以此來更深入的了解導致肌纖維類型差異的分子機制。AFF-900623芯片：包含23937個探針組，可以檢測在豬中表達的20201個基因。分別取3頭5月齡梅山母豬的背最長肌和比目魚肌，即3個生物學

2、重復共6個肌肉組織樣品。分別用3個背最長肌和3個比目魚肌的總cDNA與6個芯片雜交，然后用Genespring10.0軟件分析芯片雜交數(shù)據(jù)。結(jié)果顯示：在背最長肌和比目魚肌中差異表達倍數(shù)(foldchange)大于1.5倍，p＜0.05的差異基因共有550個。其中，在比目魚中上調(diào)表達的基因較多，共323個，在背最長肌中上調(diào)表達的基因較少，共227個。在背最長肌和比目魚肌中差異表達倍數(shù)(foldchange)大于2倍，p＜0.05的差異基因

3、共有159個。其中，在比目魚中上調(diào)表達的基因共107個，在背最長肌中上調(diào)表達的基因共52個。利用熒光實時定量PCR(QRT-PCR)對其中的12個基因(α-Actin、ART3、FHL1C、GATA-6、HMOX1、HSP、MYBPH、OCA2、SLC12A4、TGFβ1、TGFβ3和TNX)進行了驗證，證實12個基因在芯片結(jié)果和QRT-PCR結(jié)果中的表達趨勢是完全一致的，2種結(jié)果的相關(guān)性是顯著的，說明芯片的結(jié)果是可信的。利用MAS3.