基于snp的捻轉血矛線蟲(h.contortus)遺傳多樣性分析及p糖蛋白基因核苷酸差異位點篩選

1、 School Code:10270 CLC:Q95 Student Number:122200858 Shanghai Normal University Master Thesis Genetic variability and SNP screening in P-glycoprotein gene of Haemonchus Contortus Department College of Life and Env

2、ironment Science Major Zoology Specialty Zoological biotechnology Athor Ge Cheng Supervisor Feng Xin Gang Date April, 2015II 國的抗藥蟲株、澳大利亞的標準蟲株為研究對象，通過第二代測序技術 2b-RAD對不同種群蟲株進行測序， 獲得不同種群的 SNP 位點，通過比較

3、不同地區(qū)或不同株系捻轉血矛線蟲的 SNP 數據，分析這些實驗蟲株的種群遺傳多樣性特征， 發(fā)現抗伊維菌素蟲株 P-糖蛋白基因的抗藥性相關位點。結果表明：種群內部存在較低程度的遺傳分化；中國地區(qū) 4 個現場株種群間處于中等遺傳分化程度，中國地區(qū)4 個現場株種群、澳大利亞標準株種群及英國抗藥株種群之間處于較大的遺傳分化程度。說明不同國家地理起源的種群，由于受地理隔離的影響，遺傳分化水平較高；而我國國內的不同地理株種群，由于地理隔離水平受限，遺

4、傳分化水平適中； 且西藏種群由于特殊的地理、 氣候條件， 與其他國內株的遺傳差異水平略高。同時，通過基于對敏感蟲株種群和抗藥蟲株種群的 SNP 抗藥標記位點的篩選研究， 找到了與抗伊維菌素相關的兩個標記位點， 一個為 P-糖蛋白基因的 SNP 標記位點(該位點在基因組上的位置為， scaffold HF967529.1,NO.84514， 位于 P-糖蛋白基因的內含子區(qū)域)，堿基突變類型為由胞嘧啶(C)突變?yōu)橄汆堰?A)；另一個為與P-