反應(yīng)路徑研究中的“分子中的原子”理論以及應(yīng)力張量理論觀點.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、一、前言
  量子化學(xué)是通過應(yīng)用物理學(xué)中的量子力學(xué)方法和原理來研究化學(xué)體系中的結(jié)構(gòu),組成,變化和反應(yīng)性質(zhì)的學(xué)科,它是理論化學(xué)的一個分支,目前正成為化學(xué)結(jié)構(gòu)理論的基礎(chǔ)。量子化學(xué)中所應(yīng)用到的方法大概可分為兩種,原子軌道法(Atomic Orbital Theory)和分子軌道法(Molecular Orbital Theory)。原子軌道法的優(yōu)點在于化學(xué)家能夠方便闡述,然而,缺點在于隨著分子的增大,分析處理及其復(fù)雜。相反,對于分子軌道

2、法,可以通過計算機進行處理,隨著計算機的快速發(fā)展,對復(fù)雜分子的處理也簡便起來,所以,目前分子軌道法廣為應(yīng)用。此外,分子軌道理論,價鍵理論和配位場理論是量子化學(xué)描述分子結(jié)構(gòu)的三大基本理論;量子化學(xué)的計算方法也隨著計算機技術(shù)的發(fā)展而快速發(fā)展,如半經(jīng)驗法,從頭算法,密度泛函理論以及分子力學(xué)等方法。
  上世紀六十年代,加拿大化學(xué)家理查德·貝德(Richard Bader)和他的合作者首次提出了“分子中原子”量子理論(QTAIM),由此Q

3、TAIM方法在化學(xué)鍵的研究方面引起了強烈的反響,同時對電子密度的研究提供了重大理論貢獻。QTAIM創(chuàng)造性地將量子力學(xué)和拓撲學(xué)結(jié)合起來,通過使用拓撲學(xué)工具將化學(xué)、物理、數(shù)學(xué)結(jié)合起來來研究分子的結(jié)構(gòu)及化學(xué)反應(yīng)機理。電子密度可以將量子化學(xué)與經(jīng)典化學(xué)聯(lián)系起來,從而對離子鍵與共價鍵,單鍵與雙鍵的區(qū)分更加簡便。此外,量子化學(xué)的另一個特點就是能將理論與實驗結(jié)合起來進行對比,在理論上我們可以通過計算得到分子體系的電子密度分布函數(shù),在實驗上,我們可以利用

4、X-衍射技術(shù)獲得晶體中實際電子密度分布,從而將理論與實驗結(jié)合起來進行分析研究以獲得大量信息。
  由Born-Oppenheimer近似可知,分子基電子態(tài)的能量可用核坐標的函數(shù)表示出來,體系的能量變化可認為是在一個多維面上的不斷運動,這個多維面即我們所熟知的勢能面。勢能面是一個由勢能相對于體系中所有原子的可能位置構(gòu)成的一個超平面,勢能面中的“山谷”是極小值點,與它相對應(yīng)的是體系的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)。
  QTAIM理論的核心是電子電荷

5、密度分布ρ(r),分子中電荷密度分布的拓撲性質(zhì)主要是由電荷密度的一階導(dǎo)數(shù)▽ρ(r)和電荷密度的二階導(dǎo)數(shù)Laplacian值▽2ρ(r)的梯度向量場所決定的。臨界點是電荷密度一階導(dǎo)數(shù)▽ρ(r)=0時的點,從該點的Hessian(3×3)矩陣中可得到三個本征值(λ1,λ2,λ3),其中Laplacian值▽2ρ(r)λ1+λ2+λ3。若▽2ρ(r)<0,勢能占主導(dǎo)地位,負電荷在該處集中,則原子核為開殼相互作用,且其值越小,化學(xué)鍵的共價性越強

6、;相反,若▽2ρ(r)>0,則動能占主導(dǎo)地位,負電荷在該處分散,原子核之間為閉殼相互作用,且其值越大,化學(xué)鍵的離子性越強。閉殼相互作用通常存在于離子鍵、氫鍵以及范德華力的分子中。
  臨界點可用(ω,σ)來描述,其中∞代表Hessian(3×3)矩陣的秩,且ω=3。符號σ是三個本征值(λ1,λ2,λ3)的正負號數(shù)目的代數(shù)和,由此可得到4種類型的臨界點,本征值全為負的核臨界點NCP,(3,-3);一正二負的鍵臨界點BCP,(3,-1

7、);本征值二正一負的環(huán)臨界點RCP,(3,+1);以及本征值全為正的籠臨界點CCP,(3,+3)。對于一個穩(wěn)定的分子結(jié)構(gòu),四個臨界點的個數(shù)滿足Poincaré-Hopf關(guān)系式:n-b+r-c=1,其中n為核臨界點NCP,以此類推。我們定義橢圓率為ε=λ1/λ2-1,橢圓率可用來衡量鍵徑的彎曲度,當ε值越大,化學(xué)鍵將越明顯的顯示出π鍵特性;當ε值接近于0時,化學(xué)鍵則表現(xiàn)σ鍵的性質(zhì)。
  在QTAIM中,我們對分子維度進行了新的定義,

8、把含有CCP的分子定義為3-DQT(三維);含有RCP但不含CCP的分子定義為2-DQT;含有BCP但不含RCP和CCP的分子定義為1-DQT;只含NCP的分子定義為0-DQT。最后,我們構(gòu)建了量子拓撲相圖,它的優(yōu)點在于能直觀地將同分異構(gòu)體的拓撲量進行可視化。
  二、對S4N4分子做大振幅運動提出的QTAIM和應(yīng)力張量的觀點
  在1835年首次發(fā)現(xiàn)S4N4之后的時間里,由實驗獲得了大量該類硫氮化合物,其中包括長鏈的硫氮聚

9、合物SxNy以及其裂解出來的各種小分子化合物。在溫度為(0.26±0.03)K的條件下,硫氮聚合物(SN)x晶體變成超導(dǎo)體,這是第一個被發(fā)現(xiàn)具有超導(dǎo)性質(zhì)的多聚物體系。對S4N4分子進行了大量的理論研究,發(fā)現(xiàn)它是一個非同尋常的環(huán)狀化合物,晶體中的S4N4分子構(gòu)型接近于D2d對稱,可以認為它的分子結(jié)構(gòu)是一個折疊起來的八元環(huán),從而形成了兩個跨環(huán)的S--S鍵。但這兩個跨環(huán)的S--S鍵之間的距離比范德華半徑之和要小,卻比普通的S-S鍵之間的距離要

10、大。因此這個特殊的跨環(huán)S--S鍵也正是本論文的研究重點。
  化學(xué)結(jié)構(gòu)的靈活性,也就是說分子在做大振幅運動的同時還保持相同的化學(xué)計量數(shù),這一點在化學(xué)反應(yīng)中是非常重要的。對分子做大振幅運動的研究很廣泛,包括光譜學(xué),動力學(xué),振動勢能面以及熱力學(xué)性質(zhì)等。分子的靈活性一般會引起低頻率的非簡協(xié)振動,分子做大振幅非簡協(xié)振動時將會引起分子內(nèi)的弛豫過程,因此運動將會受到分子內(nèi)鍵相互作用的影響。
  從二次組態(tài)相互作用理論水平的自然價鍵軌道分

11、析了解到,S4N4分子中S--S鍵之間的距離相比典型的S-S單鍵長度是被拉長的,這是由于非常強的和復(fù)雜的電子相關(guān)效應(yīng)所引起的。在該工作中,我們對鍵之間的相互作用進行了更深層次的研究,并使用QTAIM理論對鍵與鍵之間強的相互作用進行了解釋。
  用Gaussian09對S4N4分子進行計算,得到18種標準模型。我們以每個模型的振幅為基準,從-2.0到+2.0,以0.1為步長,對18種振動模型進行計算,從而得到一系列QTAIM數(shù)據(jù)。在

12、這18中模型中,我們選擇了具有代表性的5種模型來具體研究,分別是非簡協(xié)振動模型2,13和簡諧振動模型3,4,18。
  對QTAIM的數(shù)據(jù)進行比較分析,我們發(fā)現(xiàn)當模型2的振幅為負時,因出現(xiàn)了NNAs,從而破壞了原有的拓撲結(jié)構(gòu),將原有的S1--S3BCP和S2--S4BCP移除掉了,這個現(xiàn)象可以很清楚的從圖2.3(a)-2.7(a)中看出。對于模型13的負振幅部分,模型18的所有振幅以及模型3除了振幅±2.0的所有振幅,它們不同類型

13、的臨界點數(shù)目始終保持不變。對于簡協(xié)振動模型4和18,S1--S3 BCP和S2--S4BCP的一系列性質(zhì),如鍵徑長度BPL,橢圓率ε,剛度S,總局部能量H(rb)和應(yīng)力張量剛度Sσ,均隨著振幅的變化而出現(xiàn)分離的現(xiàn)象。對于模型2,3,13,S1--S3 BCP和S2-S4 BCP的QTAIM和應(yīng)力張量性質(zhì)是保持簡并的,而對于模型18,其相關(guān)性質(zhì)是關(guān)于全局最小值點鏡像對稱的。
  我們可以通過測定BCP處的鍵徑剛度來衡量總的電子電荷密

14、度分布,這里所說的剛度可以是QTAIM剛度S=λ2/|λ3|,也可以是應(yīng)力張量剛度Sσ=|λ1σ|/|λ3σ|。從物理直覺的角度,我們期望S或Sσ的值出現(xiàn)最大、最小值時,總局部能量值H(rb)有最小、最大值,見圖2.6。對于QTAIM剛度S,這種現(xiàn)象可以很清楚的從模型3,4,13以及18上看到,見圖2.5(b-e),2.6(b-e)。然而,應(yīng)力張量Sσ與總局部能量H(rb)出現(xiàn)相反的現(xiàn)象,見圖2.6(b-e)與補充材料圖S2。另外,從物

15、理直覺角度我們期望S和Sσ會隨著鍵徑長度BPL的增大而減小,例如,在模型3中S隨振幅的增大而減小,因此也隨鍵徑長度的增大而減小,見圖2.5(b),2.3(b),然而Sσ與振幅之間并不遵從這個規(guī)律,見補充材料圖S2。模型3的S--S BCPs橢圓率的最大值在全局最小值點處,這個表明從全局最小值點到振幅為±1.2時,BCP的鍵徑變得容易扭轉(zhuǎn),見圖2.4(b)。這個現(xiàn)象同樣可以從模型2的正振幅部分看到,剛度S的值隨振幅的變化趨勢同樣被其他模型

16、所證實。
  剛度的倒數(shù)定義為極化率P,是測定極化率的一種新方法,對于所研究的5種模型,鍵徑的極化率P隨著鍵徑長度的變化而改變,例如,隨著鍵徑長度的增大鍵徑的極化率也隨之增大。應(yīng)力張量剛度Sσ與BPL之間的規(guī)律不遵從物理直覺的方式,但是Sσ會隨著金屬率ξ(rb)的增大而減小,見圖S3。而QTAIM剛度S相對于金屬率ξ(rb)沒有這種規(guī)律,見圖S4.
  對于閉殼BCPs若出現(xiàn)總局部能量值H(rb)<0的情況,則表明該BCPs

17、從附近的σ共價BCPs處獲得了一定程度的共價特性。模型3,4,13,其S--S閉殼層BCPs的H(rb)性質(zhì)可以由相關(guān)能ΔE反映出來。對于模型2,在其負振幅部分有數(shù)值的缺失,這是由于NNAs的出現(xiàn)所引起的,因此,這種情況的出現(xiàn)使得相關(guān)能ΔE與H(rb)之間的關(guān)系復(fù)雜化。最后對于模型18來說,ΔE與H(rb)之間的關(guān)系更加復(fù)雜。
  當振幅為-0.3時,我們可以觀察到模型2的S--S BCPs的金屬率值ξ(rb)<0,同時其▽2ρ(

18、r)<0,此時S--S閉殼層BCPs轉(zhuǎn)化為開殼層BCPs。模型2中負振幅部分出現(xiàn)NNAs可用來解釋S--S BCPs的金屬率值ξ(rb)在正負振幅之間不同的現(xiàn)象。
  對于較高頻率的模型,初始分子較小振幅的扭曲將會使N-SBCPs的金屬率值ξ(rb)≥1,見圖2.7。模型13負振幅部分的所有N-SBCPs以及模型18全部振幅的部分N-S BCPs,他們的化學(xué)性質(zhì)在振幅為1.0附近從開殼層轉(zhuǎn)化為閉殼層,這個現(xiàn)象可以解釋模型18缺少拓

19、撲量變動的原因,但是對于模型13負振幅部分卻不可以解釋,因此我們需要尋找其它方法來探索拓撲量不變的原因,在接下來的章節(jié)中我們會解決這個問題。
  三、利用量子拓撲相圖提出關(guān)于S4N4分子做大振幅運動的QTAIM觀點
  在本章節(jié)中我們將尋找解釋模型缺乏拓撲量變化的原因,例如模型3除了±2.0的所有振幅,模型18的所有振幅以及模型13的負振幅部分。
  在上個章節(jié)中我們已經(jīng)提到對S4N4分子計算得到了18種標準模型,我們

20、對這18種模型的拓撲量進行了分析研究,并根據(jù)模型是否存在NNA分別繪制了3-D量子拓撲相圖和2-D量子拓撲相圖,其中每個模型繪制兩個相圖,正、負振幅各一個,由于模型18沒有拓撲量的改變,所以只繪制一個拓撲相圖。S4N4分子的3-D量子拓撲相圖包含NNAs,其中模型1,7,8的正、負振幅均包含有NNAs;相反的,模型3-6,9,11-18僅有2-D量子拓撲相圖;另外,模型2和模型10是由2-D和3-D量子拓撲相圖混合構(gòu)成的。因此,在這個研

21、究中我們詳細探討了模型2和13。
  我們在2-D相圖上確定了17種新的QTAIM S4N4分子拓撲學(xué)結(jié)構(gòu),相圖中箭頭的方向指向振幅增大的方向,見圖3.1。另外,我們在相圖上找到了7個“遺漏”拓撲學(xué)結(jié)構(gòu)。在3-D相圖中,我們發(fā)現(xiàn)了11種特殊的QTAIM拓撲學(xué)結(jié)構(gòu),這些結(jié)構(gòu)包含1-4個NNAs,見圖S1,其中全局最小值點接近位于相圖的中心。
  在拓撲相圖與相關(guān)能ΔE之間沒有發(fā)現(xiàn)明顯的聯(lián)系,除了全局最小值點的位置關(guān)系。模型3,

22、4,18的振動頻率分別為279.67 cm-1,347.67 cm-1和1000.77 cm-1,這三個模型的ΔE之間有很大的差別,隨著振幅的增大,非簡諧振動模型的臨界點數(shù)目相較于原始模型有強烈的減小趨勢,我們可以從模型2,13中看出。
  對于模型18,由于臨界點的數(shù)目始終未變,使得其相關(guān)能的值特別大,同時它的金屬率值也較高ξ(rb)>1,這些現(xiàn)象均可解釋模型18臨界點數(shù)目不變的原因。但是金屬率ξ(rb)卻不能解釋模型3以及模型

23、13中臨界點數(shù)目不變的原因,因此我們又嘗試考慮最小的應(yīng)力張量本征值λ3σ,觀察λ3σ>0或λ3σ<0是否可以決定一個BCP或一個NNA符號的出現(xiàn)。前面討論過一個BCP擁有NNA的符號時將會導(dǎo)致應(yīng)力張量Poincaré-Hopf關(guān)系式破裂,也就是說此關(guān)系式的和不再是1,具有應(yīng)力張量NNA本征值符號的S--S BCPs在圖2.2中已用有顏色的符號標記出來。
  在該研究中,我們發(fā)現(xiàn)所有模型的所有振幅的分子圖,均有應(yīng)力張量Poincar

24、é-Hopf關(guān)系式破裂的現(xiàn)象,一部分原因是由于所有的RCPs和CCPs的λ3σ<0,也就是說它們擁有NNAs的符號,但這并不是唯一的原因。應(yīng)力張量Poincaré-Hopf關(guān)系式破裂的現(xiàn)象是不常見的,對于S--S BCPs符合這種現(xiàn)象,但是對于開殼的S-N BCPs或N-N BCPs是不符合這種現(xiàn)象的。對于模型3除了±2.0的所有振幅,模型18的所有振幅以及模型13的負振幅部分,我們發(fā)現(xiàn)S--S BCPs的應(yīng)力張量本征值沒有出現(xiàn)λ3σ<

25、0的情況,因此,我們可以說當出現(xiàn)S--S BCPs的λ3σ>0時,可以解釋上述模型臨界點數(shù)目不變的原因。
  四、關(guān)于(H2O)5勢能面的QTAIM和應(yīng)力張量觀點
  液態(tài)水一般不被視作是一種向同性的的介質(zhì),而被看作是氫鍵團簇的集合。相對于化學(xué)鍵來說,氫鍵的作用力較弱,但是這種弱的作用力卻有它的重要性,較弱的氫鍵相對于σ共價鍵容易形成與斷裂,這為氫鍵穩(wěn)定體系創(chuàng)建了詳細的構(gòu)象空間,因此這種體系的氣相和液相可以由不同結(jié)構(gòu)和尺寸的

26、團簇構(gòu)成。氫鍵的精確性質(zhì)尚不明確,部分原因是由于氫鍵復(fù)雜的能量分解方案難以用精確的理論模型來處理。氫鍵相互作用的核心是協(xié)同極化效應(yīng),另外共用電荷的轉(zhuǎn)移也是部分原因。在之前的研究工作中我們證實了泡利的猜想,即水中氫鍵的性質(zhì)并不是純粹的靜電作用,而另一部分原因是由于氫鍵可以從相鄰的σ共價鍵處獲得該鍵的相關(guān)性質(zhì),從而具備一些σ共價鍵的特性。
  在之前的工作中,我們使用量子拓撲相圖發(fā)現(xiàn)了(H2O)4,(H2O)5,(H2O)6新的拓撲結(jié)

27、構(gòu),尤其是發(fā)現(xiàn)(H2O)5有兩個新的拓撲結(jié)構(gòu)是MP2勢能面上的鞍點。在本研究中,我們通過研究(H2O)5的勢能面來進一步完善其拓撲相圖,并通過研究QTAIM數(shù)據(jù)來探索水團簇中氫鍵的相關(guān)性質(zhì)。
  在該研究中,我們先構(gòu)建起始過渡態(tài)分子,并對這些過渡態(tài)分子(TS)結(jié)構(gòu)進行優(yōu)化,其后查看MP2 TS結(jié)構(gòu)確保它們存在一個虛頻,使用IRC方法計算出相應(yīng)的反應(yīng)路徑,然后對IRC路徑兩端的能量極小值點也進行結(jié)構(gòu)的優(yōu)化,接下來計算出沿IRC路徑每

28、個步驟所產(chǎn)生的分子結(jié)構(gòu),最后使用AIMALL對上一步所產(chǎn)生的結(jié)果進行分析。
  我們首先找到了11種過渡態(tài)結(jié)構(gòu),并確定了反應(yīng)路徑兩端的兩個極小值點,分別記作點(f)和點(r)。在這11種結(jié)構(gòu)中,結(jié)構(gòu)00_0046,04_0028和09_0021的兩個極小值點的分子形態(tài)關(guān)于過渡態(tài)結(jié)構(gòu)相互對稱,見圖4.1(a),4.1(d)和4.1(f),這種對稱現(xiàn)象在相關(guān)能ΔE圖中也可反映出來。對于結(jié)構(gòu)00_0046和04_0028的ΔE圖是有規(guī)律

29、且對稱的,而結(jié)構(gòu)09_0021的ΔE圖對稱但無規(guī)律,因為在反應(yīng)座標±30時,可以看到一些小的波動,這是由于存在一些鍵拓撲結(jié)構(gòu)的變化引起的。我們研究了(H2O)5五聚環(huán)的全局能量最小值,最小值點出現(xiàn)在11_0001過渡態(tài)分子的反應(yīng)路徑中,見圖4.1(i)和圖4.2(i),其中這個五聚環(huán)具有盡可能簡單的拓撲結(jié)構(gòu)。
  由于ΔE圖不能對11種反應(yīng)路徑提供一個相關(guān)概述,所以我們通過構(gòu)建量子拓撲相圖來解決這個問題。在早期的工作中已發(fā)現(xiàn)了3個

30、MP2勢能面上的能量最小值點和另外兩個Poincaré-Hopf關(guān)系式的解,這兩個解是MP2勢能面上的兩個鞍點(18,5)和(19,7)。在本研究中我們試圖獲得一個完整的拓撲相圖(QTPD),在新的QTPD上,我們發(fā)現(xiàn)了5個Poincaré-Hopf關(guān)系式的解,其中兩個新的能量最小值點分別是(16,3)和(17,3)。對反應(yīng)路徑的分析表明,在早期工作中所預(yù)測到的“遺漏”拓撲結(jié)構(gòu)(17,4)在這五種過渡態(tài)的反應(yīng)路徑中得到確認。先前工作中的

31、兩個“遺漏”點(19,5),(19,6)與鞍點關(guān)聯(lián),并不是MP2勢能面上的能量最小值點,這兩種拓撲結(jié)構(gòu)對MP2的勢能面不重要。
  過渡態(tài)結(jié)構(gòu)00_0046,01_0001,04_0028和10_0002在整個反應(yīng)路徑中,其Poincaré-Hopf關(guān)系式的解始終保持不變,且兩個極小值點均具有最簡單的2-DQT拓撲結(jié)構(gòu)。應(yīng)力張量Poincaré-Hopf關(guān)系式有時是不成立的,BCPs會將其符號從(3,-1)改變?yōu)?3,-3)。正如

32、以前所觀察到的,在應(yīng)力張量Poincaré-Hopf關(guān)系式中,擁有NNA符號的RCPs通常會與擁有NNA符號的BCPs相互抵消,然而,由于擁有NNA符號的CCPs與擁有NNA符號的RCPs數(shù)量不等,不能相互抵消,因此將會導(dǎo)致應(yīng)力張量Poincaré-Hopf關(guān)系式不成立。對于應(yīng)力張量Poincaré-Hopf關(guān)系式不成立的QTAIM BCPs經(jīng)常會出現(xiàn)在過渡態(tài)附近,并且具有較高的橢圓率值,然而有的時候這種情況也會出現(xiàn)在最小值點附近。

33、r>  過渡態(tài)結(jié)構(gòu)10_0002和01_0001的反應(yīng)路徑的能壘最低,同時H(rb)值的變化幅度最小。在整個反應(yīng)路徑中,H(rb)與ΔE是相互聯(lián)系的,例如對于11_0001f反應(yīng)路徑部分,最小值點是全局最小值點,5個閉殼BCPs的H(rb)值均小于0,見圖4(i)。這個現(xiàn)象表明具有H(rb)<0的氫鍵BCPs可以確定特定構(gòu)象的能量穩(wěn)定性。
  前面提到當閉殼BCP的H(rb)<0時表明該BCP具有一定程度的共價特性,這個共價特性來

34、源于與其共用一個H NCP的開殼BCP。若一個開殼BCP出現(xiàn)一定程度的氫鍵性質(zhì)則H(rb)的負值會較小。與一個氫鍵BCP共用一個H NCP的開殼BCPs和普通開殼BCPs的H(rb)圖上,我們可以看到明顯的差別,也就是說普通開殼BCPs的H(rb)值更負,同時我們發(fā)現(xiàn)有較小H(rb)值的閉殼BCPs與具有較小負值的開殼BCPs是一一對應(yīng)的,見圖4.5,換言之就是氫鍵BCPs中出現(xiàn)共價特性的程度越大,則與其共用一個H NCP的開殼BCP將

35、會擁有更多的氫鍵特性,同時缺乏共價特性的氫鍵BCPs的H(rb)值變動很小。
  從表4.2我們可以看到,11種反應(yīng)路徑的振動伸縮帶上邊緣的頻率基本不變,水分子間σ共價鍵與氫鍵的耦合將會把振動伸縮帶的下邊緣拉低,這是由于σ共價鍵獲得了一定程度的氫鍵特性。振動伸縮帶較低邊緣頻率的變化是由于氫鍵BCPs具有一定程度的共價特性。例如04_0020r反應(yīng)路徑所包含的H8--O1氫鍵BCP具有最高程度的共價特性,同時在伸縮帶的較低邊緣具有最

36、小的振動頻率,見圖4.5(c)。相反地,04_0028r和09_0021r反應(yīng)路徑所有的H(rb)值均大于0,也就是說沒有氫鍵BCPs具有共價特性,那么在伸縮帶的較低邊緣具有最高的振動頻率。由上述現(xiàn)象可以知道,氫鍵BCPs是否具有一定程度的共價特性是伸縮帶較低邊緣不同的原因。
  閉殼BCPs剛度S沿反應(yīng)路徑的變化與橢圓率和H(rb)值的變化是有關(guān)系的,例如,對于反應(yīng)路徑00_0046r,H2--O7 BCP的橢圓率值隨著過渡態(tài)的

37、接近顯著增大,同時相應(yīng)的鍵徑平緩地轉(zhuǎn)變成O1---O7 BCP,見圖4.4(a);相反地,剛度S與H(rb)的值在H2--O7 BCP轉(zhuǎn)化為O1---O7 BCP時降低。然而也有閉殼BCPs的剛度S隨著過渡態(tài)的接近卻呈增大的現(xiàn)象,例如對于04_0020r反應(yīng)路徑中O1---O4BCP轉(zhuǎn)化為H5--O1 BCP的過程,見圖4.6(c)。剛度S的值為BCP的極化率提供了一個衡量標準,剛度S的值越大則極化率的P值越小,當一個氫鍵BCP轉(zhuǎn)化為一

38、個O---O BCP時,剛度S的值通常會減小,那么極化率P的值將會增大。
  五、總結(jié)與展望
  在本論文中,首先對S4N4分子做大振幅運動的體系進行了研究,在2-D拓撲相圖上找到了17種新的拓撲結(jié)構(gòu),并預(yù)測出7種“遺漏”結(jié)構(gòu);此外,在3-D相圖上,找到了11種含有NNAs的拓撲結(jié)構(gòu)。接下來的工作中,我們使用S--S BCPs的應(yīng)力張量本征值λ3σ解釋了S4N4分子某些振動模型中臨界點類型和數(shù)目始終不變的原因。同時介紹了兩個

39、新的定義,分別是QTAIM極化率P和應(yīng)力張量極化率Pσ。
  最后,對水團簇(H2O)5的反應(yīng)路徑進行了研究,在其MP2勢能面上發(fā)現(xiàn)了5個能量極小值點。通過對總局部能量H(rb)的數(shù)據(jù)分析,我們發(fā)現(xiàn)氫鍵BCPs可以從σ鍵BCPs處獲得一定程度的共價鍵性質(zhì),其中這個σ鍵是與該氫鍵共用一個H NCP的共價鍵。
  在接下來的工作中,我們會繼續(xù)探究QTAIM臨界點數(shù)目和類型在相應(yīng)的反應(yīng)路徑中始終保持不變的原因,來驗證應(yīng)力張量本征值

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