水稻重大害蟲二化螟線粒體基因組學(xué)研究.pdf

1、二化螟(Chilo suppressalis)是水稻危害最大的幾種害蟲之一,屬于螟蛾科昆蟲的一種,又稱鉆心蟲。本文首次報(bào)道二化螟的線粒體全基因組序列,比較二化螟線粒體基因組序列與其它鱗翅目昆蟲的差異,為進(jìn)一步研究鱗翅目類昆蟲分子系統(tǒng)演化建立了基礎(chǔ)。為了測(cè)定二化螟線粒體基因組序列,設(shè)計(jì)了10對(duì)適合于二化螟線粒體擴(kuò)增的引物,采用LA-PCR方法擴(kuò)增了二化螟線粒體基因組不同片斷,克隆后或利用PCR產(chǎn)物測(cè)序,把不同片斷拼接后獲得二化螟的線粒體全

2、基因組序列。
　　 二化螟線粒體基因組全長(zhǎng)15465bp,包含了37個(gè)基因和1個(gè)非編碼的AT富含區(qū)。37個(gè)基因包括13個(gè)蛋白編碼基因、22個(gè)tRNA基因、2個(gè)rRNA基因。二化螟線粒體基因堿基組成具有明顯的A+T的偏向性,A+T含量為79.70％,結(jié)果表明線粒體基因組具有很強(qiáng)的從GC向AT的進(jìn)化選擇性。二化螟的13個(gè)PCGs中coxl的起始密碼為CGA,其他12個(gè)基因的起始密碼為ATN。除trnSl(AGM)外,二化螟線粒體基因

3、組其余21個(gè)tRNA編碼基因的二級(jí)結(jié)構(gòu)為典型的三葉草型。二化螟的AT富含區(qū)被確定位于rrnS和trnM之間,長(zhǎng)度為329 bp。
　　 已經(jīng)測(cè)定的22種鱗翅目昆蟲線粒體基因組AT含量的平均值為80.46％:22種鱗翅目昆蟲線粒體基因組AT富含區(qū)的平均長(zhǎng)度為426bp,草原毛蟲的AT區(qū)最短319bp,野蠶的AT富含區(qū)最長(zhǎng),達(dá)到747bp。22種鱗翅目昆蟲線粒體基因組AT富含區(qū)中,桑尺蠖的A+T含量最高98.25％,黑紋粉蝶的A+T