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簡介:泰山醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文散發(fā)性、遲發(fā)性帕金森病PARKIN基因分子遺傳學(xué)研究姓名張盼盼申請學(xué)位級別碩士專業(yè)老年醫(yī)學(xué)指導(dǎo)教師曹霞201203結(jié)果所有樣本經(jīng)聚合酶鏈反應(yīng)后,均出現(xiàn)擴(kuò)增產(chǎn)物,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分析并在紫外燈下觀察,所有樣本均出現(xiàn)目的產(chǎn)物,未發(fā)現(xiàn)異常條帶,未發(fā)現(xiàn)PARKIN基因外顯子缺失或重復(fù)插入;所有擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行基因測序分析,經(jīng)與基因庫相比對,未發(fā)現(xiàn)基因突變。結(jié)論所有病例組和對照組樣本經(jīng)PCR擴(kuò)增及瓊脂糖電泳分析,發(fā)現(xiàn)均在目標(biāo)范圍內(nèi)出現(xiàn)目的條帶;經(jīng)基因比對分析,發(fā)現(xiàn)所有被檢測的散發(fā)性、遲發(fā)性帕金森病患者均未發(fā)現(xiàn)缺失、重復(fù)、插入及點(diǎn)突變;PA凼N基因突變在山東地區(qū)的散發(fā)性、遲發(fā)性帕金森病人中的突變率較低。關(guān)鍵詞帕金森病;散發(fā)性;遲發(fā)性;聚合酶鏈反應(yīng);基因測序;PARKIN基因
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簡介:當(dāng)前在全球范圍內(nèi)結(jié)核病治療面著非常嚴(yán)峻的形勢。一方面新藥研發(fā)耗費(fèi)大周期長另一方面細(xì)菌耐藥性問題愈發(fā)嚴(yán)重。尋找新的藥物作用靶點(diǎn)是解決上述問題的關(guān)鍵。本論文以化學(xué)基因組學(xué)為基礎(chǔ)借鑒“高拷貝抑制技術(shù)”在恥垢分枝桿菌MYCOBACTERIUMSMEGMATIS中過表達(dá)其基因組的各個基因通過篩選對活性化合物抗性增加的克隆尋找可能的作用靶點(diǎn)。將來自穿梭質(zhì)粒PMV261的IM和APH基因插入到PCC1FOS載體而獲得穿梭載體PEMAC并用該載體住ECOLI構(gòu)建了MSMEGMATIS基因組文庫。在將該載體及文庫質(zhì)粒導(dǎo)入MSMEGMATIS后發(fā)現(xiàn)這些質(zhì)粒在MSMEGMATIS中不能穩(wěn)定存在。為解決質(zhì)粒不穩(wěn)定問題先后嘗試用PMINDCOS1載體構(gòu)建文庫和使用PMV261載體構(gòu)建小片段文庫插入片段35~45KB同時通過敲除MSMEGMATISRECA基因以及對文庫質(zhì)粒去甲基化等手段試圖提高質(zhì)粒穩(wěn)定性。本學(xué)位論文研究結(jié)果表明文庫質(zhì)粒在MSMEGMATIS中的穩(wěn)定性可能與插入片段基因序列有關(guān)。
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簡介:目的研究惡性高熱家族的遺傳學(xué)特點(diǎn),篩查中國人惡性高熱家族的基因突變位點(diǎn),為臨床診斷提供重要的證據(jù)。方法在遵守知情同意原則的基礎(chǔ)上,一共收集了2個MH家族,分別為家族Ⅰ、家族Ⅱ。每個家族的臨床確診者均在麻醉中出現(xiàn)典型的MH表現(xiàn),符合MH的臨床診斷標(biāo)準(zhǔn)。分別提取患者及其家族成員外周血中自細(xì)胞基因組DNA,通過PCR擴(kuò)增其RYR1基因部分外顯子,測序分析。根據(jù)基因測序結(jié)果,了解患者是否有基因突變,并對其臨床確診者及其家族成員基因突變情況進(jìn)行分析。結(jié)果家族Ⅰ中MH患者及其母親的PCR產(chǎn)物測序結(jié)果表明RYR1基因第6724位堿基C突變?yōu)門C6724C>T,所編碼2206位氨基酸由蘇氨酸變?yōu)榧琢虬彼酨T2206M。限制酶分析確認(rèn)臨床確診者及其母親為該錯義突變攜帶者,為MH易感者。家族Ⅱ中的臨床確診者及其家族成員的RYR1基因熱點(diǎn)區(qū)外顯子均未發(fā)現(xiàn)突變。結(jié)論中國人中部分MH易感者攜帶RYR1基因突變,但中國人MH家族分子遺傳學(xué)特點(diǎn)尚需要進(jìn)一步研究。基因檢測可以作為MH的輔助診斷之一。
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簡介:分類號R71單位代碼10752密級公開學(xué)號2010165寧夏醫(yī)科大學(xué)夏醫(yī)科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文碩士研究生學(xué)位論文寧夏寧夏人群人群卵巢早衰患者與卵巢早衰患者與GDFGDF9BMP9BMP1515基因的遺傳學(xué)研究基因的遺傳學(xué)研究RESEARCHONSNPSOFGDF9BMP15GENEINNINGXIAWOMENWITHPREMATUREOVARIANFAILURE學(xué)位申請人馬麗麗馬麗麗指導(dǎo)教師徐仙合作指導(dǎo)教師劉春蓮劉春蓮申請學(xué)位門類級別醫(yī)學(xué)專業(yè)名稱婦產(chǎn)科學(xué)婦產(chǎn)科學(xué)研究方向生殖內(nèi)分泌生殖內(nèi)分泌所在學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)院論文完成日期二〇一三年二〇一三年四月寧夏醫(yī)科大學(xué)研究生學(xué)院寧夏醫(yī)科大學(xué)研究生學(xué)院寧夏醫(yī)科大學(xué)學(xué)位論文獨(dú)創(chuàng)性聲明寧夏醫(yī)科大學(xué)學(xué)位論文獨(dú)創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明所呈交的學(xué)位論文,是個人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下,獨(dú)立進(jìn)行研究工作所取得的成果,無抄襲及編造行為。除文中已經(jīng)特別加以注明引用的內(nèi)容外,本論文不含任何其他個人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的作品成果。對本文的研究做出重要貢獻(xiàn)的個人和集體,均已在文中以明確方式標(biāo)明并致謝。本人完全意識到本聲明的法律結(jié)果由本人承擔(dān)。論文作者簽名_____論文導(dǎo)師簽名_____年月日年月日寧夏醫(yī)科寧夏醫(yī)科大學(xué)大學(xué)關(guān)于學(xué)位論文使用授權(quán)的聲明關(guān)于學(xué)位論文使用授權(quán)的聲明寧夏醫(yī)科大學(xué)有權(quán)保留使用本人學(xué)位論文,同意學(xué)校按規(guī)定向國家有關(guān)部門機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版,允許被查閱和借閱。本人授權(quán)寧夏醫(yī)科大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索,可以采用影印、縮印或其他復(fù)印手段保存和匯編本學(xué)位論文??梢怨迹ò牵┱撐牡娜炕虿糠謨?nèi)容。(保密論文在解密后應(yīng)遵守此規(guī)定)論文作者簽名_____論文導(dǎo)師簽名_____年月日年月日
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簡介:論文作者簽名..二丑囊L指導(dǎo)教師簽名蘭壘望翌論文評閱人1瑟囪降壟評閱人2丞自隱壘評閱人3丞囪隱壘評閱人4叢囪隱壘評閱人5區(qū)囪隱壘答辯委員會主席疊建盎Z熬援么逝婆太堂委員1疊建蠱』塾拯』逝江太堂委員2睦至Z熬拯Z逝婆太堂委員3周煌盔么塾援么浙江太堂委員4疊直雖么塾援Z浙逛太堂委員5扭越盜Z數(shù)拯Z浙江太堂浙江大學(xué)研究生學(xué)位論文獨(dú)創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外,論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果,也不包含為獲得逝姿態(tài)鱟或其他教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我一同工作的同志對本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示謝意。學(xué)位論文作者簽名≯蓯.√簽字日期矽7弓年;月,夕日學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者完全了解逝婆盤堂有權(quán)保留并向國家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交本論文的復(fù)印件和磁盤,允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)澎鋈盤堂可以將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索和傳播,可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。保密的學(xué)位論文在解密后適用本授權(quán)書學(xué)位論文作者簽名專一、鈰簽名堋導(dǎo)師簽名丫ⅥV協(xié)簽字日期矽J弓年≥月,羅日簽字日期弘I弓年弓月/鄉(xiāng)日
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簡介:一、目的1研究健康漢族人中ABCB1基因多態(tài)性與啟動子區(qū)域甲基化程度的分布特征及兩者間的相關(guān)性。2研究健康漢族人ABCB1基因多態(tài)性和啟動子區(qū)域甲基化水平對P糖蛋白功能的影響。3比較選擇不同劑量的探藥對P糖蛋白功能評價的影響。4初步探討人外周血ABCB1基因多態(tài)性和啟動子區(qū)域甲基化程度對抗癲癇藥物穩(wěn)態(tài)腦脊液濃度的影響。二、方法1健康漢族志愿者ABCB1基因多態(tài)性分析方法的建立207名健康受試者參加了本試驗(yàn)。采集受試者外周靜脈全血2ML,利用本試驗(yàn)室改良的少量血樣DNA快速抽提法提取GENOMICDNA,采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)限制性片段長度多態(tài)性PCRRFLP方法對位于ABCB1基因11、12、21和26號外顯子區(qū)域的G1199A、C1236T、G2677TA以及C3435T幾個重要位點(diǎn)進(jìn)行基因多態(tài)性分析,并通過DNA直接測序來確認(rèn)基因分型結(jié)果。2健康漢族人ABCB1啟動子區(qū)域甲基化檢測用結(jié)合重亞硫酸鹽的限制性內(nèi)切酶法COBRA對前述207名健康漢族人進(jìn)行ABCB1啟動子區(qū)域甲基化分析。12ΜGDNA稀釋至50ΜL,變性后經(jīng)亞硫酸氫鈉硫化處理,使DNA中未甲基化的胞嘧啶轉(zhuǎn)化為胸腺嘧啶,經(jīng)PCR擴(kuò)增、限制性內(nèi)切酶酶切后非變性聚丙烯酰胺凝膠分離,EB染色后再進(jìn)行灰度掃描。3ABCB1基因多態(tài)性和啟動子區(qū)域甲基化程度對P糖蛋白功能的影響及不同劑量的探討對P糖蛋白功能評價的影響以P糖蛋白經(jīng)典探藥地高辛為模型藥物,研究ABCB1基因多態(tài)性和啟動子區(qū)域甲基化程度對P糖蛋白功能的影響;并同時觀察了不同劑量水平的地高辛對P糖蛋白功能評價的影響。地高辛血漿藥物濃度采用雅培微粒子酶免疫試劑盒DIGOXINⅡ5B73進(jìn)行定量測定。本試劑盒的標(biāo)準(zhǔn)曲線范圍為03~40NGML1,最低定量限為03NGML1,對超過40NGML1的樣本稀釋后再進(jìn)行測定。4ABCB1基因多態(tài)性和啟動子區(qū)域甲基化程度對苯妥英鈉、苯巴比妥穩(wěn)態(tài)腦脊液濃度的影響35名服用苯妥英鈉和40名服用苯巴比妥的神經(jīng)外科住院患者參與了本實(shí)驗(yàn)。在患者持續(xù)規(guī)律給藥達(dá)到7~10天后,同時采集其下次給藥前的血標(biāo)本6ML和腦脊液標(biāo)本2ML;其中2ML全血用于DNA抽提,另外4ML離心后保留血漿用于血中藥物濃度測定。分析ABCB1基因多態(tài)性和啟動子區(qū)域甲基化程度與患者穩(wěn)態(tài)血漿、腦脊液藥物濃度及腦脊液血漿藥物濃度比值間的相關(guān)性,考察ABCB1基因多態(tài)性和啟動子區(qū)域甲基化對苯妥英鈉和苯巴比妥穩(wěn)態(tài)腦脊液濃度的影響。5統(tǒng)計方法所有統(tǒng)計均使用SPSS130軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)的分析。HARDYWEINBERG檢驗(yàn)采用卡方檢驗(yàn)。不同基因型之間的藥代動力學(xué)參數(shù)和啟動子區(qū)域甲基化程度差異使用KRUSKALWALLISMETHOD和MANNWHITHEYU檢驗(yàn),藥代動力學(xué)參數(shù)與啟動子區(qū)域甲基化程度的相關(guān)性分析使用SPEARMAN法。P005被認(rèn)為有統(tǒng)計學(xué)意義。三、結(jié)果1ABCB1基因多態(tài)性在健康漢族人群中的分布盡管在白種人中的突變發(fā)生頻率為65%~11%最近,體外實(shí)驗(yàn)已經(jīng)證實(shí)G1199A的突變可以改變蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)活性,但在207個健康漢族人中并沒有發(fā)現(xiàn)G1199A的突變等位基因存在。本研究進(jìn)一步證實(shí)了ABCB1的3個主要SNPS在中國人群中的基因頻率和單倍體型頻率。ABCB1C1236T、G2677TA和C3435T在健康漢族志愿者中的突變發(fā)生頻率分別為666%、416%、163%和404%,這些等位基因的發(fā)生頻率符合HARDYWEINBERG平衡。在健康漢族志愿者中,ABCB1的C3435T單核苷酸多態(tài)性的野生型純合子CC的頻率為351%,突變型純合子TT的頻率為159%,突變型雜合子CT的頻率為490%;ABCB1的C1236T單核苷酸多態(tài)性的野生型純合子CC的頻率為144%,突變型純合子TT的頻率為476%,突變型雜合子CT的頻率為380%;ABCB1的G2677TA單核苷酸多態(tài)性的野生型純合子GG的頻率為163%,突變型純合子中TT的頻率為168%,TA的頻率為106%,AA的頻率為48%,突變型雜合子GT的頻率為389%,GA的頻率為125%。利用SHESIS和PHASE211軟件對C1236T、G2677TA和C3435T位點(diǎn)進(jìn)行連鎖不平衡分析和單倍體型構(gòu)建發(fā)現(xiàn)位于26號外顯子的C3435T位點(diǎn)與12號外顯子C1236T位點(diǎn)和21號外顯子G2677T位點(diǎn)之間存在明顯的連鎖不平衡關(guān)系;在健康漢族人中以TTT、CGC、TGC和CAC這四個單倍體型為主,占到90%以上。2健康漢族人ABCB1啟動子區(qū)域甲基化程度在207個健康漢族人中,ABCB1啟動子區(qū)域甲基化水平中位數(shù)為132%32%~287%,男女之間沒有發(fā)現(xiàn)性別差異。此外,3435CC、3435CT和3435TT。型個體間ABCB1啟動子區(qū)域甲基化水平存在明顯差異,3435CC型個體甲基化水平較低,3435TT個體最高;而G2677TA野生型純合子個體相對于突變型純合子TT、AA、TA和雜合子GT、GA個體均表現(xiàn)出較低的甲基化水平,但在后兩者之間沒有明顯差異。在不同的單倍體型個體中,TTT攜帶者顯示出較非TTT攜帶者較高的甲基化程度,而TGC攜帶者顯示出較非TGC攜帶者較低的甲基化程度。3ABCB1基因多態(tài)性對不同劑量地高辛藥動學(xué)的影響受試者在口服低025MG、中05MG、高075MG三個劑量水平的探藥后,其AUC04、CMAX和TMAX除與劑量水平相關(guān)外,在不同ABCB1SNPS的個體中沒有明顯差異。然而,在將受試者按照所構(gòu)建的ABCB1單倍體型分組后,在025MG劑量組內(nèi),TGCCGC個體內(nèi)地高辛AUC04、CMAX明顯降低于TTTTTT的個體。4ABCB1啟動子區(qū)域甲基化水平對不同劑量地高辛藥動學(xué)的影響在對ABCB1啟動子區(qū)域甲基化程度與不同劑量地高辛的AUC04、CMAX和TMAX進(jìn)行相關(guān)性分析后,同樣發(fā)現(xiàn)ABCB1啟動子區(qū)域甲基化水平僅與025MG劑量組的AUC04和CMAX呈正相關(guān),但沒有發(fā)現(xiàn)ABCB1啟動子區(qū)域甲基化水平與05MG和075MG劑量組AUC04和CMAX存在相關(guān)性。5ABCB1基因多態(tài)性和啟動子區(qū)域甲基化水平對苯妥英鈉穩(wěn)態(tài)腦脊液濃度的影響在35名服用苯妥英鈉的住院患者中發(fā)現(xiàn)ABCB1啟動子區(qū)域甲基化程度與患者苯妥英鈉穩(wěn)態(tài)腦脊液血漿濃度比值存在負(fù)相關(guān),但并沒有發(fā)現(xiàn)ABCB1單核苷酸多態(tài)性或其單倍體型對苯妥英鈉穩(wěn)態(tài)腦脊液或血漿濃度及兩者比值存在明顯影響。6ABCB1基因多態(tài)性和啟動子區(qū)域甲基化水平對苯巴比妥穩(wěn)態(tài)腦脊液濃度影響在40名使用苯巴比妥的住院患者中,沒有發(fā)現(xiàn)ABCB1SNPS、單倍體型或者其啟動子區(qū)域甲基化水平對苯巴比妥的穩(wěn)態(tài)腦脊液、血漿藥物濃度及腦脊液血漿藥物濃度比值存在明顯影響。四、結(jié)論本研究首次發(fā)現(xiàn)位于11號外顯子的G1199A在中國健康志愿者中不存在突變,說明該位點(diǎn)的突變存在明顯的地域或種族差異。實(shí)驗(yàn)所得中國漢族人ABCB1基因常見SNPS和主要單倍體型的發(fā)生頻率與其他實(shí)驗(yàn)室在中國人群中的研究結(jié)果基本一致,各等位基因頻率的分布符合HARDYWEINBERG平衡,研究資料具有群體代表性。本研究首次對健康漢族志愿者ABCB1啟動子區(qū)域甲基化水平進(jìn)行了大樣本檢測,并發(fā)現(xiàn)ABCB1不同SNPS和單倍體型個體中啟動子區(qū)域甲基化水平存在明顯差異。這提示ABCB1基因多態(tài)性和表觀遺傳學(xué)差異間存在某種關(guān)聯(lián),為探索ABCB1同義突變導(dǎo)致P糖蛋白表型差異的機(jī)制提供了新的思路。本研究觀察了地高辛給藥劑量的不同對P糖蛋白功能評價的影響,并從基因多態(tài)性和表觀遺傳學(xué)差異兩方面證實(shí)了低劑量地高辛能夠更好的體現(xiàn)個體間P糖蛋白功能的差異。這對以前研究所得的矛盾結(jié)果及以后的研究具有提示和借鑒意義。本研究初步探討了ABCB1遺傳多態(tài)性和表觀遺傳學(xué)差異對苯妥英鈉、苯巴比妥穩(wěn)態(tài)腦脊液濃度的影響,僅發(fā)現(xiàn)患者ABCB1啟動子區(qū)域甲基化程度與苯妥英鈉穩(wěn)態(tài)腦脊液血漿藥物濃度比值存在負(fù)相關(guān),并沒有發(fā)現(xiàn)ABCB1的基因多態(tài)性和啟動子區(qū)域甲基化水平對苯巴比妥穩(wěn)態(tài)腦脊液濃度的影響。由于缺乏患者血腦屏障和腦組織局部P糖蛋白表達(dá)和功能的直接依據(jù),還不能就P糖蛋白對此類藥物的腦內(nèi)濃度的影響做出明確結(jié)論。但通過本試驗(yàn),也說明了在體研究人藥物轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白對中樞神經(jīng)系統(tǒng)藥物體內(nèi)處置和反應(yīng)差異的試驗(yàn)難度和復(fù)雜性。
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簡介:分類號UDCL73‘‘68密級編號串I初大擎CENTRALSOUTHUNIVERSITY碩士學(xué)位論文論文題目單細(xì)胞比較基因組雜交技術(shù)及其在學(xué)科、專業(yè)研究生導(dǎo)師姓名及其專業(yè)技術(shù)職稱胚胎植入前遺傳學(xué)篩查中的應(yīng)用遺傳學(xué)譚珂譚躍球研究員中南大學(xué)二OO年五月分類號VDC碩士學(xué)位論文密級單細(xì)胞比較基因組雜交技術(shù)及其在胚胎植入前遺傳學(xué)篩查中的應(yīng)用一●●●●‘●一一一一●BLNGLECELLCOMPARATIVEGENOMLCHYBRIDIZATIONAND1TSAPPLICATIONINPREIMPLANTATIONGENETICSCREENING作者姓名學(xué)科專業(yè)學(xué)院系、所指導(dǎo)教師譚珂遺傳學(xué)生殖與干細(xì)胞工程研究所譚躍球論文答辯日期墊曼答辯委員會主席中南大學(xué)二。一。年五月
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簡介:分類號VDC密級碩士學(xué)位論文聯(lián)合運(yùn)用測序及MLPA技術(shù)對結(jié)節(jié)性硬化癥患者進(jìn)行遺傳學(xué)診斷DIAGNOSISOFPATIENTSWITHTUBEROUSSCLEROSISCOMPLEXBYDIRECTSEQUENCINGANDMLPA作者姓名嚴(yán)愷學(xué)科專業(yè)遺傳學(xué)學(xué)院系、所醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室指導(dǎo)教師鄔玲仟教授導(dǎo)師小組梁德生教授潘乾副教授,/一?釁?一?夠中南大學(xué)二O一二年六月原創(chuàng)性聲明LYLL2LLILL911715LLLI9LLL2L本人聲明,所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。盡我所知,除了論文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外,論文Q,不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果,也不包含為獲得中南大學(xué)或其他單位的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我共同工作的同志對本研究所作的貢獻(xiàn)均己在論文中作了明確的說明。作者簽名觸日期盟年上月_L日學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本人了解巾南大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,即學(xué)校有權(quán)保留學(xué)位論文并根據(jù)國家或湖南省有關(guān)部門規(guī)定送交學(xué)位論文,允許學(xué)位論文被查閱和借閱;學(xué)校可以公布學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容,可以采用復(fù)印、縮印或其它手段保存學(xué)位論文。同時授權(quán)中國科學(xué)技術(shù)信息研究所將本學(xué)位論文收錄到中國學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫,并通過網(wǎng)絡(luò)向社會公眾提供信息服務(wù)。作者簽名導(dǎo)師簽名姓開期出,蘭年上日
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簡介:生物信息學(xué)是在生命科學(xué)的研究中,以計算機(jī)為工具對生物信息進(jìn)行儲存、檢索和分析的科學(xué)。序列比對是生物信息學(xué)中一種基本的信息處理方法,對于發(fā)現(xiàn)核酸和蛋白質(zhì)序列功能、結(jié)構(gòu)和進(jìn)化的信息具有非常重要的意義。隨著生物序列數(shù)據(jù)庫中序列數(shù)據(jù)的激增,開發(fā)兼有高度生物敏感性和高效率的算法就顯得非常迫切。本文研究了生物信息學(xué)中的雙序列比對算法。論文敘述了序列比對算法領(lǐng)域從70年代到現(xiàn)在的發(fā)展過程,討論了NEEDLEMAN和WUNSCH最早提出的生物序列比對算法全局比對動態(tài)規(guī)劃算法,同時分析了目前雙序列比對動態(tài)規(guī)劃算法及啟發(fā)式算法存在的問題。遺傳算法是模擬自然界生物進(jìn)化過程來求解最優(yōu)極值問題的一類自組織、自適應(yīng)人工智能技術(shù),它通過對當(dāng)前群體施加選擇、交叉、變異等一系列遺傳操作,從而產(chǎn)生新一代的群體,并逐漸使群體進(jìn)化到包含或接近最優(yōu)解的狀態(tài)。由于其具有易于實(shí)現(xiàn)、應(yīng)用效果明顯等優(yōu)點(diǎn)而被眾多應(yīng)用領(lǐng)域所接受,在自適應(yīng)控制、組合優(yōu)化、模式識別、機(jī)器學(xué)習(xí)、人工智能等領(lǐng)域得到了廣泛的應(yīng)用。但許多仿真和應(yīng)用結(jié)果都表明遺傳算法還存在群體易陷入“早熟”現(xiàn)象,局部搜索能力弱等問題。模擬退火算法剛好可以補(bǔ)充遺傳算法這一不足,模擬退火算法是模擬物理退火過程的一種隨機(jī)優(yōu)化搜索算法。算法以優(yōu)化過程的求解與物理退火過程的相似性為基礎(chǔ),通過接受準(zhǔn)則和對下降溫度的控制,能夠有效的克服優(yōu)化過程陷入局部極小從而獲得全局最優(yōu)解。論文將遺傳算法結(jié)合模擬退火思想用于雙序列比對問題,建立了相應(yīng)的數(shù)學(xué)模型。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,對于雙序列比對問題,算法是有效的合理的。
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簡介:第一部分研究背景左心室肥厚LVH是心血管疾病發(fā)病率和死亡率的獨(dú)立預(yù)測危險因素。目前已知年齡、性別、絕經(jīng)、生活方式與糖尿病等均是LVH的重要危險因素。雖然高血壓的主要并發(fā)癥是LVH,但是高血壓繼發(fā)LVH的患者其LVH的程度與高血壓病史的長短、血壓水平及降壓后肥厚逆轉(zhuǎn)的程度并不呈比例,提示有高血壓以外的因素參與心肌肥厚進(jìn)程。研究表明,遺傳因素對左心室重量的影響約占非血壓因素的60%。內(nèi)皮型一氧化氮合酶ENOS可催化L精氨酸生成NO,NONOS途徑參與心肌肥厚的病理、生理過程。在動物模型中,長期給予NOS抑制劑LNAME或者NOS3小鼠均會出現(xiàn)LVH、心肌纖維化和心功能異常;建立NOS3小鼠主動脈弓縮窄TAC壓力超負(fù)荷左心室肥厚的動物模型,向心臟內(nèi)注射ENOS后可以緩解LVH以及由此導(dǎo)致的心功能異常。此外,ENOS還可以抑制心梗后小鼠的心肌肥厚,保護(hù)其心臟的功能。心衰病人心室肌中ENOS基因NOS3的表達(dá)是增加的。關(guān)于NOS3與高血壓繼發(fā)LVH的關(guān)聯(lián)研究目前僅一篇報道,其結(jié)果表明NOS3基因多態(tài)性與左室肥厚相關(guān)聯(lián)。但是這種關(guān)聯(lián)在其他人群中尚未得到證實(shí)。研究目的本研究擬在中國人群中驗(yàn)證NOS3多態(tài)性與高血壓繼發(fā)左心室肥厚的關(guān)聯(lián)。對象和方法本研究選擇兩個獨(dú)立的高血壓繼發(fā)左室肥厚的病例和對照人群2179和343人,采用聚合酶鏈反應(yīng)限制性片段長度多態(tài)性PCRRFLP法研究ENOS基因的三個功能性多態(tài)性位點(diǎn)T786CRS2070744、ENOS4AB和G894TRS1799983多態(tài)性與原發(fā)性高血壓繼發(fā)左室肥厚遺傳易感因素的關(guān)系。所有入選者均進(jìn)行心臟超聲的檢測。研究結(jié)果結(jié)果顯示只有G894TGLU298ASP位點(diǎn)與高血壓繼發(fā)左室肥厚的易感相關(guān)第一個人群167,95%CI119236,P005;第二個人群141,95%CI101228,P005,并呈隱性遺傳模式。在兩個獨(dú)立樣本中,與攜帶G等位基因GTGG的相比,攜帶TT基因型的患者的室間隔厚度、左室后壁厚度、左室重量指數(shù)和相對室壁厚度均增加分別增加162%和117%、83%和71%、140%和251%、131%和162%且均有統(tǒng)計學(xué)意義P001。結(jié)論ENOS基因G894T多態(tài)可能是高血壓繼發(fā)左室肥厚遺傳易感性的標(biāo)記之一。這為高血壓繼發(fā)左室肥厚遺傳易感性提供了循證醫(yī)學(xué)依據(jù),同時也為在中國開展G894T多態(tài)性與高血壓繼發(fā)左室肥厚關(guān)系的研究提供了基礎(chǔ)。第二部分研究背景左心室肥厚LVH是心血管疾病發(fā)病率和死亡率的獨(dú)立預(yù)測危險因素。目前已知年齡、性別、絕經(jīng)、生活方式與糖尿病等均是LVH的重要危險因素。雖然高血壓的主要并發(fā)癥是LVH,但是高血壓繼發(fā)LVH的患者其LVH的程度與高血壓病史的長短、血壓水平及降壓后肥厚逆轉(zhuǎn)的程度并不呈比例,提示有高血壓以外的因素參與心肌肥厚進(jìn)程。研究表明,遺傳因素對左心室重量的影響約占非血壓因素的60%。非對稱性二甲基精氨酸ADMA是一種內(nèi)源性一氧化氮和酶NOS的抑制劑,研究顯示ADMA與左心質(zhì)量呈顯著正相關(guān),與射血分?jǐn)?shù)呈顯著負(fù)相關(guān)。NO可以調(diào)節(jié)心肌的生長,ADMANO途徑對于心肌肥厚的病理過程是重要的。二甲基精氨酸二甲胺水解酶DDAH2存在于表達(dá)內(nèi)皮型一氧化氮合酶的組織中,可以代謝大部分的ADMA。關(guān)于DDAH2與高血壓繼發(fā)LVH的關(guān)聯(lián)研究目前還沒有相關(guān)報道。研究目的本研究擬在大樣本人群中研究DDAH2多態(tài)性與高血壓左心室肥厚的關(guān)聯(lián)性。對象和方法研究對象為河南信陽高血壓基地收集的2,274例高血壓患者,其中包括1,135例高血壓伴LVH患者,1,139例高血壓不伴有LVH患者及767例健康對照者。所有入選者均進(jìn)行心臟超聲的檢測。使用單倍體型TAGGINGSNPS的方法,研究DDAH2基因TAGSNPS與原發(fā)性高血壓繼發(fā)左室肥厚遺傳易感因素的關(guān)系。并進(jìn)一步運(yùn)用螢光素酶分析研究DDAH2變異對基因表達(dá)的影響效應(yīng)。研究結(jié)果本研究發(fā)現(xiàn)DDAH2只有一個TAGSNP,是位于啟動子區(qū)的變異449CGRS805305,其與其他SNPSRS707916,RS805304完全連鎖。對于449CG變異,與攜帶GG基因型的患者相比,攜帶C等位基因GCCC的高血壓左室肥厚患者的左室重量指數(shù)620±157GM27VS599±131GM27,P005、左室后壁厚度620±157GM27,VS599±131GM27,P005以及相對室壁厚度479±129%VS。460±110%,P001均增加。此外,449位攜帶C等位基因GCCC增加高血壓左心室肥厚的易感度126,95%CI103153,P001。含有SNP449C的DDAH2啟動子區(qū)明顯降低轉(zhuǎn)錄活性495%。結(jié)論DDAH2449CG變異可能是高血壓繼發(fā)左室肥厚遺傳易感性的基因標(biāo)記之一。這為高血壓繼發(fā)左室肥厚遺傳易感性提供了循證醫(yī)學(xué)依據(jù),同時也為在世界上開展449CG多態(tài)性與高血壓繼發(fā)左室肥厚關(guān)系的研究提供了基礎(chǔ)。
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簡介:中山大學(xué)碩士學(xué)位論文視網(wǎng)膜色素變性大家系的臨床研究和分子遺傳學(xué)研究姓名趙麗娜申請學(xué)位級別碩士專業(yè)眼科學(xué)指導(dǎo)教師夏小平20060518查堂堡主堡蘭塑旦墮魚莖壅堡查窒至塑些墮型塞塑坌蘭竺堂翌窒CLINICALANDMOLECULARGENETICSSTUDYOFALARGERETINITISPIGMENTOSAFAMILYLINAZHAOOPHTHALMOLOGYDIRECTEDBYPROFXIAOPINGXIAABSTRACTPURPOSETOINVESTIGATETHECLINICALANDGENETICCHARACTERISTICSOFALARGECHINESERETINITISPIGMENTOSARPFAMILYMETHODSALARGECHINESERPFAMILYHADBEENIDENTIFIEDTHEFAMILYMEMBERSAREALLHANNATIONALITYAFTERINFORMEDCONSENT,THEFAMILYTREEWASPICTUREDACCORDINGTOCLINICALFINDINGSCLINICALFEATURESWEREDETERMINEDBYVISUALACUITY,SLITLAMPBIOMIEROSCOPY,ELECTRORETINOGRAPHYKINETICVISUALFIELDTESTINGANDFUNDUSPHOTOGRAPHY8ML10MLOFVENOUSBLOODWASCOLLECTEDFROMLARGEPARTOFTHEFAMILYMEMBERS,ANDGENOMICDNAWASEXTRACTEDFROMTHEBLOODMICROSATELLITEMARKERSWERESELECTEDFROMTHEREGIONSWHICHHARBORALLKNOWNLOCI如RADRP,INCLUDINGCA4FSCN2,IMPDHI,NRL,RDS,RHOROML,RPI,RP9,PRPF3,PRPF8,PRPF3I,CRX,RP31,GUCAIB,SEMA4A,RP33GENESTHEMARKERSWEREAMPLIFIEDBYPOLYMERASECHAINREACTIONPCRTWOPOINTLODSCORESWERECALCULATEDUSINGTHESUBROUTINEMLINKOFTHELINKAGEPACKAGERESULTSTHEREARESEVENTHFIVECONSANGUINEOUSINDIVIDUALSWITHTWENTYTHREEAFFECTEDMEMBERSINTHEFAMILYTHESEAFFECTEDMEMBERSHAVESOMECLINICALFEATURES。SUCHASNIGHTBLINDNESS,HIGHMYOPIA,VASCULARATTENUATIONINRETINA,PIGMENTATIONINPERIPHERALRETINANARROWINGOFVISUALFIELDTUNNELVISIONANDABNORMALITIESINTHEELECTRORETINOGRAMERGTHEFAMILYHASFIVEGENERATIONSWITH110PATIENTSINEACHGENERATIONEXCEPTTHEFIFTHGENERATIONTHEPERCENTAGEOFSUFFERERSINTHEFAMILYIS3067%ANDRATEOFMALEONFEMALEISABOUT1ALLKNOWNLOCIFORADRPINCLUDINGCA4,F(xiàn)SCN2,IMPDHL,NRL,RDS,RHO,ROML,RPL,RP9PRPF3,PRPF8,PRPF3I,CRX,RP3L,GUCAIB,SEMA4A,RP33WEREEXCLUDEDTHEMAXIMUMLODSCORESARENEGATIVEATALLMARKERSCONCLUSIONSITISAPRIMARYTYPICALRETINITIS
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簡介:南京醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文MMMSNHLOSPCNAPIAPWMRBLSAPSCD23TFSTKMULTIPLEMYELOMA多發(fā)性骨髓瘤MEDIATLSURVIVAL申位生存期NONHODGLDN’SLYMPHOMA非霍奇金淋巴瘤OVERALLSURVIVAL總的生存率PROLIFERATINGCELLNUCLEARANTIGEN增殖細(xì)胞核抗原PHYTOHEMAGGLUTININAPOKEWEEDMITOGENRETINOBLASTOMA1STREPTAVIDINALKALINEPHOSPHATASESOLUBLECD23TREATMENTFREESTLRVIVAL植物血凝素美州商陸視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤基因1鏈霉菌抗生物素蛋白一堿性磷酸酶可溶性CD23無治療生存期THYMIDINEKINASE胸腺嘧啶核苷酸激酶ZAP70ZETAASSOCIATEDPROTEIN一70TCR‘相關(guān)的70KDA蛋白3
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簡介:復(fù)旦大學(xué)碩士學(xué)位論文雄性激素不敏感綜合征的分子遺傳學(xué)研究姓名儲建華申請學(xué)位級別碩士專業(yè)遺傳學(xué)指導(dǎo)教師羅澤偉200161ABSTRACTANDROGENINSENSITIVITYSYNDROMEAISISADISORDEROFMALESEXUALDEVELOPMENTCAUSEDBYANABSENTORDYSFUNCTIONALANDROGENRECEPTORAFFECTEDINDIVIDUALSUSUALLYHAVEA46,XYKARYOTYPE,AFEMALEORPARTIALLYMASCULINIZEDEXTERNALGENITALPHENOTYPE,GYNECOMASTIAANDINFERTILITY.FERTILECASESWITHMILDAISANDSLIGHTLYIMPAIREDARACTIVITYHADBEENREPORTEDINLITERATURE,ANDTHEIREXTERNALGENITALIAWEREDOCUMENTEDTOBEUSUALLYNORMALORSUBNORMAL.WEREPORTEDHEREANAR9840CYSSUBSTITUTIONINTHEARGENEINALARGECHINESEPEDIGREEAFFECTEDWITHAIS.THEMUTANTGENEMAYRESULTININFERTILITYFORSOMEAFFECTEDMALESWITHORWITHOUTHYPOSPADIAS.HOWEVER,ITWASALSOOBSERVEDTHATTHEMUTATIONDIDNOTAFFECTFERTILITYOFTHEOTHERPATIENTS.THEMECHANISMOFPRESERVEDMALEFERTILITYASWELLASTHEPHENOTYPICVARIATIONREMAINSTOBEEXPLAINED.TOFURTHERINVESTIGATETHEFUNCTIONALALTERATIONOFTHEMUTANTANDROGENRECEPTOR,WEHAVESETOUTTOESTABLISHGENITAISKINFIBROBLASTSTRAINSFROMDIFFERENTPATIENTS.2
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