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文檔簡介
1、青島大學碩士學位論文EB病毒相關胃癌組織中EB病毒基因亞型的檢測與分析姓名:紀靜申請學位級別:碩士專業(yè):病原生物學指導教師:羅兵20080601DetectionandanalysisofEpstein—BarrvirusgenotypesinEBVassociatedgastriccarcinomasAbstractobjective:ToelucidatevariationsoftypeslandII,BamHIFand£BamHI
2、IandiandthepolymorphismofEBVLMP1geneinEBVassociatedgastriccarcinomas(EBVaGC),andtoexplorethecorrelationbetweenthegenevariationsandEBVaGCMethods:EBVDNAgenomewastestedin185gastriccarcinomatissuesandcorrespondingadjacenttis
3、suesbypolymerasechainreaction(PCR)一SouthernblottingEBVencodedsmallRNAl(EBER1)inPCRpositivesampleswastestedbyinsituhybridization(ISH)inparaffin—embeddedsectionsGastriccarcinomawithpositiveEBERlsignalswasconfirmedEBVaGCcas
4、esPCRandrestrictionfragmentlengthpolymorphism(RFLP)analysiswasusedtodetectthevariationsoftypes1and2,BamHIF‘andfandBamHIIandiinchineseEBVaGCcasesfromShandongProvinceTheC—terminiofLMP1in12and8EBVaGCcasesfromShandongProvinc
5、eandJapanrespectivelywereanalyzedbyPCRandsequencingThesequenceswerecomparedwithpreviouslypublishedstrainsandwerecharacterizedonaphylogenetictreeThedifferencebetweenChineseandJapaneseisolateswascharacterizedResults:QThere
6、were13EBVpositivesamplesin185gastriccarcinomas(703%),butnoEBVpositivesampleincorrespondingpara—carcinomasThedifferenceofEBVpositiveratebetweengastriccarcinomaandcorrespondingparacarcinomatissueswassignificant()C2=110769,
7、P=O0009)Inourseries,age,pathologicaldifferentiation,clinicalstages,lymphnodemetastasisandlocationofcancerwerenotdifferentbetweenEBVnegativegastriccarcinomas(EBVnGC)andEBVaGC(P=0669,O141,0259,0818,0064,respectively),while
8、sexwassignificantlydifferentbetweenthetwogroups(∥=39404,t9=_00471)②A1lof12EBVaGCweregroupedintotype1andprototypeE11outof12EBVaGCcasesbelongedtotypei,andonlyonebelongedtotypeI③lOof12ChineseGCisolates(833%)andallofthe8(100
9、%)JapaneseEBVaGCisolatesbelongedtotheChina1strainAlso,B95—8typeisolateswerefoundin2of12ChineseGCInthe18China1typeisolates,additionalmutationsoutsidethesignaturesequencechangeswerefoundAllJapaneseisolates(1oo%)hadtwoormor
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