植物內(nèi)含子進化模式研究.pdf

1、福建農(nóng)林大學碩士學位論文植物內(nèi)含子進化模式研究姓名：金谷雷申請學位級別：碩士專業(yè)：作物遺傳育種指導教師：吳為人20070401福建農(nóng)林大學碩士論文摘要內(nèi)含子是真核生物基因組中重要的組成元件，關于內(nèi)含子的起源、進化動力和變化機制的爭論已經(jīng)持續(xù)了2 0 多年，然而我們對于這些問題的認識仍然有限。進入基因組時代后，大量的基因組序列信息推動了內(nèi)含子研究的進展，但是植物內(nèi)含子的進化的研究才剛剛開始．本研究對不同植物物種的內(nèi)含子進行了大規(guī)模的分析，

2、并的到如下的結(jié)果：1 、 通過分析3 2 個植物物種的內(nèi)含子位點和長度信息，發(fā)現(xiàn)植物內(nèi)含子的平均長度通常較短，即便在基因組巨大的物種中內(nèi)含子的平均長度仍然比動物的內(nèi)含子長度短，藻類和高等植物有著明顯不同的內(nèi)含子密度．2 、 通過新的內(nèi)含子獲得丟失分析算法，發(fā)現(xiàn)整個植物界內(nèi)含子的獲得率較低，同時以數(shù)量減少為主，個別物種出現(xiàn)較高的內(nèi)含子獲得率。此外通過分析1 2 個不同植物物種相互之間的內(nèi)含子位點的保守性，發(fā)現(xiàn)在高等植物的基因組內(nèi)內(nèi)含予位置

3、保守，部分內(nèi)含子位點與藻類內(nèi)含子位點相同。這些結(jié)果表明在植物祖先的早期進化過程中新內(nèi)含子大量出現(xiàn)，在藻類中發(fā)生了大量的丟失。3 、 為了解內(nèi)含子長度與內(nèi)含子丟失所受到的進化動力和選擇以及基因表達對其的影響，我們分析了基因表達量和表達寬度于它們之間的相關性，發(fā)現(xiàn)內(nèi)含子長度和丟失是受不同的因素影響的，兩者相對獨立。4 、 進一步研究發(fā)現(xiàn)，在水稻和擬南芥旁系同源基因中內(nèi)含子的變化速率要高于物種間的同源基因的內(nèi)含子變化，內(nèi)含子丟失和獲得比率近似