SARS冠狀病毒進(jìn)化與起源的生物信息學(xué)分析.pdf_第1頁
已閱讀1頁，還剩58頁未讀， 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明：本文檔由用戶提供并上傳，收益歸屬內(nèi)容提供方，若內(nèi)容存在侵權(quán)，請進(jìn)行舉報或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡介

1、SARS-CoV基因組為單正鏈RNA,全長約30kb,具有感染性.其基因組結(jié)構(gòu)為:5′-帽狀結(jié)構(gòu)-病毒酶-刺突糖蛋白(S)-包膜蛋白(E)-基質(zhì)膜蛋白(M)-核衣殼蛋白(N)-3′polyA尾.運用NJ法和PHYLIP軟件包,對SARS冠狀病毒和其他14種冠狀病毒進(jìn)行了系統(tǒng)發(fā)育分析.確定SARS冠狀病毒是不同于已知冠狀病毒的一種新型冠狀病毒,在系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系上也不屬于現(xiàn)有的三個類群,而獨立成為一支.根據(jù)兩個假定:1、核苷酸的變異是隨機的;

2、2、存在分子鐘即存在恒定的進(jìn)化速率,應(yīng)用SAS的回歸分析軟件估計SARS病毒起源時間.在對31條確定取樣時間的SARS病毒S基因序列分析后,估算出SARS病毒的起源時間為2002年11月10日,95﹪的置信區(qū)間是2002年10月11日至2002年12月13日.這與目前報導(dǎo)的首例SARS病人的發(fā)病時間基本一致.依據(jù)DIVERT算法,編寫了Sequence Compare程序,以檢測SARS病毒序列中是否存在重組事件.結(jié)果表明:SARS病毒

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明，都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等，如果需要附件，請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙，網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽，若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間，僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理，對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯，并不能對任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容，請與我們聯(lián)系，我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論