胞外多肽的生物信息學(xué)分析與應(yīng)用.pdf

1、長期以來人們一直認為植物的細胞壁是支持植物細胞和植物體的剛性結(jié)構(gòu)，大分子的多肽類分子不可能作為細胞間信使存在。但研究發(fā)現(xiàn)植物和動物一樣也可能利用多肽類激素來調(diào)節(jié)植物的生長發(fā)育和逆境防御反應(yīng)。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了多種植物胞外多肽信號分子，但其中關(guān)于受體和細胞內(nèi)信號通路研究比較明確的只有四種?；蚪M研究發(fā)現(xiàn)模式動物的基因組中含有編碼RLKs基因數(shù)分別為人類70個、線蟲43個、果蠅25個，并有大量的胞外多肽類信號分子與之對應(yīng)，在植物中擬南芥的基因組

2、中編碼RLKs的基因數(shù)為417個，在水稻的基因組中數(shù)量更大于600個，應(yīng)當(dāng)存在更多的胞外多肽信使與之對應(yīng)。本文通過運用生物信息學(xué)的方法，利用豐富的動物胞外多肽的信息，分析比較了已知的植物、動物及微生物的胞外多肽的氨基酸序列和結(jié)構(gòu)特征，發(fā)現(xiàn)這些來自不同種的胞外多肽具有共同的氨基酸偏好特征、結(jié)構(gòu)特征和相似的疏水性特征，并利用在線工具對胞外多肽的氨基酸偏好特征進行了驗證，利用這些共同特征對植物中新的胞外多肽進行了推斷，推斷了已知植物胞外多肽的