mba論文模式植物cle多肽基因家族的生物信息學分析與鑒定pdf

1、 模式植物 模式植物 CLE 多肽基因家族的生物信息學分析與鑒定多肽基因家族的生物信息學分析與鑒定 Bioinformatics analysis and identification of CLE peptide gene family of model plants 學科專業(yè)：遺傳學 研 究 生：張 宇 指導教師：王潔華 教授 天津大學環(huán)境科學與工程學院 二零一五年五月 摘 要 CLE(CLAVATA3/Embryo surroun

2、ding region-related)多肽激素是近十年來研究最熱的植物多肽激素， 也是迄今為止最大的植物多肽分子家族， 主要通過編碼一小段分泌蛋白來參與細胞間的信號轉導， 進而在植物生長發(fā)育過程中維持干細胞增殖與分化間的平衡，特別是在莖尖分生組織(shoot apical meristem, SAM)、根尖分生組織(root apical meristem, RAM)以及原形成層(procambium)等組織的發(fā)育調控中起著關鍵的作用

3、。盡管 CLE 基因家族在擬南芥和水稻等模式植物中已有一定的研究，但在木本模式植物楊樹與肉果類模式植物番茄中，有關 CLE 多肽基因家族的研究尚屬空白。 本文以模式植物楊樹和番茄作為研究對象， 利用擬南芥全部 32 個 CLE 基因的序列在 Phytozome 等數(shù)據(jù)庫中進行基因的檢索與挖掘，共獲得 50 個楊樹 CLE候選基因(PtCLE)和 15 個番茄 CLE 候選基因(SlCLE)。 隨后利用生物信息學手段，分別對楊樹和番茄的

4、CLE 基因進行了基因理化性質分析、信號肽預測、基因結構分析、染色體定位、多序列比對、蛋白全長和 CLE 12 肽進化樹的構建、上游調控區(qū)順式作用元件的查找以及表達熱圖譜的繪制等。 在楊樹中， 本文還挑選出了 3 個與 AtCLV3 同源， 6 個與 AtCLE41/44 同源的楊樹 CLE 基因， 對這 9 個 PtCLE基因進行了克隆與表達載體的構建等，并通過實時定量 PCR 技術對其組織特異性的表達進行了驗證。在番茄中，本文對全部

5、 15 個番茄 CLE 基因進行了實時定量組織特異性表達驗證， 并挑選出了 3 個特異性表達的基因 SlCLE10、 12 和 13。對上述 3 個 SlCLE 基因的 CLE 12 肽進行人工合成后， 通過體外添加多肽的方法來處理番茄，發(fā)現(xiàn)這 3 種 12 肽均能抑制番茄主根的伸長，其中 SlCLE12 對根的抑制作用最為明顯，而且在下胚軸伴有花青素的大量積累。 本文利用生物信息學、 比較基因組學等方法， 首次對楊樹和番茄這兩種模式植