番茄WRKY轉(zhuǎn)錄家族生物信息學(xué)分析及部分抗逆相關(guān)基因鑒定.pdf

1、番茄具有豐富的營養(yǎng)價值、較強的適應(yīng)能力、栽培很容易以及很高的產(chǎn)量等特點，因此，番茄是一種重要的世界性蔬菜，在蔬菜生產(chǎn)中占有主要地位。但是番茄在生長的過程中，通常會受惡劣自然環(huán)境的影響，導(dǎo)致產(chǎn)量的下降，因此研究逆境脅迫對番茄生長的影響，有著重要的意義。本文主要對番茄與抗逆相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子WRKY家族進行了全基因組挖掘及生物信息學(xué)分析，并且通過對部分基因在逆境脅迫下的表達(dá)模式進行研究，獲得了該家族中與番茄抗逆應(yīng)答相關(guān)的基因。
　　1通過

2、生物信息學(xué)分析，鑒定出了番茄WRKY家族包含81個成員，按其WRKY結(jié)構(gòu)域及鋅指結(jié)構(gòu)分為3族，第二族按其氨基酸順序又可以分為5個亞族。除番茄的11號染色體沒有WRKY轉(zhuǎn)錄因子，其他染色體上均有分布。僅SlWRKY19，SlWRKY20倆個家族成員不含內(nèi)含子，其他成員都含有2～5個內(nèi)含子。番茄WRKY結(jié)構(gòu)域是高度保守的，僅有10個WRKYGQK發(fā)生了變異，占WRKY家族的10％。
　　2對6個典型WRKY轉(zhuǎn)錄因子進行組織特異性表達(dá)模

3、式分析，發(fā)現(xiàn)這些基因在根、莖、葉、花、果中均有表達(dá)，但不同基因在同一組織中的表達(dá)量存在差異，同一基因在不同組織中的表達(dá)量也存在差異，SlWRKY13和SlWRKY24在根和花中的表達(dá)量較高，在莖中幾乎不表達(dá);SlWRKY31在根、莖、葉中的表達(dá)量大于花和果;SlWRKY50在根、葉、花中的表達(dá)量較高，在莖中幾乎不表達(dá);SlWRKY62在根、葉、果中的表達(dá)量較高，在莖中幾乎不表達(dá);SlWRKY63在根中的表達(dá)量最高，在莖和果中幾乎不表達(dá)。

4、
　　3在鹽脅迫處理中，SlWRKY13、SlWRKY31、SlWRKY50、SlWRKY62和SlWRKY63基因的表達(dá)水平呈現(xiàn)先上升，然后逐漸下降的趨勢，而SlWRKY24基因的表達(dá)則顯著下調(diào);在干旱脅迫處理中，SlWRKY13、SlWRKY31、SlWRKY62和SlWRKY63基因表達(dá)上調(diào)，SlWRKY24和SlWRKY50基因表達(dá)下調(diào);在低溫脅迫處理中，SlWRKY13、SlWRKY31、SlWRKY50、SlWRKY6