睢寧白山羊和其他幾種山羊的遺傳多樣性分析及GDF9基因與山羊繁殖性能的相關(guān)性研究.pdf

1、本研究采用9個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記對睢寧白山羊及我國其他7個(gè)地方山羊品種群體進(jìn)行遺傳多樣性分析,并以睢寧白山羊?yàn)橹饕芯繉ο?以GDF9基因作為候選基因,檢測了該基因在睢寧白山羊群體中的多態(tài)情況,分析了其與山羊繁殖性能(產(chǎn)羔數(shù)、窩產(chǎn)羔重)的相關(guān)關(guān)系。結(jié)果如下:
　　 1.9個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)在8個(gè)山羊品種中共檢測到了143個(gè)等位基因,平均每個(gè)位點(diǎn)達(dá)15.9個(gè)。X2檢驗(yàn)表明:除了長江三角洲白山羊在BMS1724和MB067位點(diǎn)上處于Hardy-W

2、einberg平衡,其余各位點(diǎn)的品種群體均處于遺傳不平衡狀態(tài)。
　　 2.9個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)均為高度多態(tài)位點(diǎn),其雜合度在0.6674-0.8928之間,多態(tài)信息含量在0.7128-0.8338之間;睢寧白山羊的平均雜合度和多態(tài)信息含量分別為0.7861和0.7557。
　　 3.在這9個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)中,MAF70位點(diǎn)的基因分化系數(shù)(GST值)最大,為0.2098;BMS1248位點(diǎn)上的GST值最小,為0.0699。群體總GST

3、值為0.1062,說明有10.62％的遺傳多樣性是分布于群體間的,其余89.38％則分布于群體內(nèi)。
　　 4.根據(jù)遺傳距離Ds和DA分別進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)生樹的UPGMA法聚類和N-J法聚類。相對而言,根據(jù)DA遺傳距離以UPGMA方法構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)生樹較為合理可靠,睢寧白山羊與黃淮山羊首先聚為一類,長江三角洲白山羊與宜昌白山羊依次加入,馬頭山羊與湘東黑山羊聚為一類加入,最后福清山羊與戴云山羊單獨(dú)聚為一類。
　　 5.對GDF9基因

4、全部5'端側(cè)翼區(qū)及第一、第二外顯子區(qū)的序列進(jìn)行SSCP分析,結(jié)果表明:引物P1、P4、Ex1-2擴(kuò)增產(chǎn)物各檢測出3種基因型,引物P8和Ex2-3擴(kuò)增產(chǎn)物各檢測出2種基因型;引物Ex2-4擴(kuò)增產(chǎn)物檢測出6種基因型。測序表明:5'端側(cè)翼區(qū)的-1569bp處發(fā)生G→C的突變,-1054 bp處發(fā)生G→A的突變,-34bp處發(fā)生T→C的突變;外顯子1的+183 bp處發(fā)生C→A的突變,未導(dǎo)致氨基酸改變;外顯子2的+1943bp處發(fā)現(xiàn)C→T的突變

5、,導(dǎo)致Ala→Val;+2314bp、+2315bp處均發(fā)生G→A的突變,前者為沉默突變,后者導(dǎo)致Val→Ile。
　　 6.群體遺傳特性分析表明:引物P8和引物Ex2-3擴(kuò)增產(chǎn)物上檢測到的多態(tài)為低度多態(tài)位點(diǎn),遺傳變異較小;其余檢測到的均為中度多態(tài)位點(diǎn)。X2檢驗(yàn)表明,所有突變位點(diǎn)均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。
　　 7.對不同基因型與睢寧白山羊的頭胎產(chǎn)羔數(shù)及窩產(chǎn)羔重進(jìn)行最小二乘分析。引物P1和P4所擴(kuò)增片段

6、不同基因型間頭胎產(chǎn)羔數(shù)及窩產(chǎn)羔重的最小二乘均值差異不顯著(P＞0.05)。引物Exl-2擴(kuò)增片段中GG基因型與HH基因型間頭胎產(chǎn)羔數(shù)差異顯著(P＜0.05),GH基因型與GG、HH基因型問差異均不顯著(P＞0.05);該片段各基因型間窩產(chǎn)羔重差異不顯著(P＞0.05)。引物Ex2-4擴(kuò)增的片段中MM基因型頭胎產(chǎn)羔數(shù)與KL、LL基因型差異顯著(P＜0.05),其余各組差異不顯著(P＞0.05);MM基因型頭胎窩產(chǎn)羔重KK、KL、LL基因型