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文檔簡介
1、胃癌是全球高發(fā)的惡性腫瘤之一。我國胃癌發(fā)病率和死亡率仍高居世界第二位。胃癌的發(fā)生發(fā)展涉及微環(huán)境和基因改變,癌基因的活化是其重要機(jī)制。尋找新的癌基因并驗(yàn)證其對胃癌的作用,對確定生物學(xué)靶標(biāo)、干預(yù)癌變具有重要意義。
課題組前期通過胃癌組織基因芯片篩選可能與胃癌相關(guān)的候選基因,HoxC6是其中的一個候選促癌基因。HoxC6屬同源盒基因家族(簡稱:Hox家族)成員,含有兩個啟動子,轉(zhuǎn)錄兩條mRNA(HoxC6-1和HoxC6-2),其表
2、達(dá)產(chǎn)物是重要的轉(zhuǎn)錄因子,在胚胎發(fā)育過程中對細(xì)胞分化和形態(tài)發(fā)育控制起重要作用,近年來研究發(fā)現(xiàn),Hox家族基因與多種惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展及預(yù)后密切相關(guān)。HoxC6與胃癌發(fā)生發(fā)展的關(guān)系值得深入研究。
本研究將通過檢測胃癌組織及胃癌細(xì)胞株中HoxC6、HoxC6-1及HoxC6-2的表達(dá)水平,分析三者與患者臨床病理資料之間的相關(guān)性;通過siRNA干擾技術(shù),特異性降低HoxC6、HoxC6-1及HoxC6-2表達(dá),觀察其對胃癌細(xì)胞惡性生物
3、學(xué)行為(細(xì)胞增殖、遷移、侵襲等)的影響,同時運(yùn)用生物信息學(xué)技術(shù)篩選HoxC6潛在調(diào)控的基因、核酸并進(jìn)行初步驗(yàn)證。
內(nèi)容:
1、HoxC6、HoxC6-1及HoxC6-2在胃癌中的表達(dá),及其與胃癌臨床資料之間的相關(guān)性
?、賹?shí)時定量PCR(qRT-PCR)檢測比對47對胃癌組織與配對正常胃組織中HoxC6、HoxC6-1及HoxC6-2mRNA表達(dá)水平;
?、诮Y(jié)合胃癌患者臨床、病理資料,分析HoxC6、H
4、oxC6-1及HoxC6-2mRNA表達(dá)水平與各臨床、病理資料之間的相關(guān)性;
?、踧RT-PCR和Western Blot檢測7株胃癌細(xì)胞及1株正常胃粘膜上皮細(xì)胞中HoxC6、HoxC6-1及HoxC6-2的表達(dá)情況。
2、特異性siRNA干擾HoxC6、HoxC6-1及HoxC6-2后胃癌細(xì)胞惡性生物學(xué)行為的變化
?、俨捎眉?xì)胞活性實(shí)驗(yàn)(MTS)觀察siRNA干擾HoxC6、HoxC6-1及HoxC6-2對SG
5、C-7901和BGC-823細(xì)胞增殖的影響;
②Transwell遷移和侵襲實(shí)驗(yàn)研究siRNA干擾HoxC6、HoxC6-1及HoxC6-2對SGC-7901和BGC-823細(xì)胞遷移、侵襲的影響;
?、鄄捎昧魇郊?xì)胞儀檢測siRNA干擾HoxC6、HoxC6-1及HoxC6-2后SGC-7901和BGC-823細(xì)胞的凋亡和細(xì)胞周期變化。
3、HoxC6潛在調(diào)控基因、核酸的篩選及初步驗(yàn)證
運(yùn)用生物信息學(xué)
6、技術(shù)(TFSEARCH、TRANSFEC、MEME等軟件)預(yù)測HoxC6可能調(diào)控的基因或核酸,聯(lián)合genecards、pubmed、文獻(xiàn)等綜合得出基因、核酸的功能,結(jié)合前期實(shí)驗(yàn)中HoxC6在增殖、遷移、侵襲等方面的作用,篩選出HoxC6可能調(diào)控的有功能的基因、核酸,并分別在轉(zhuǎn)染HoxC6 siRNA的SGC-7901和BGC-823細(xì)胞中進(jìn)行qRT-PCR驗(yàn)證。
結(jié)果:
1、HoxC6、HoxC6-1及HoxC6-2
7、在胃癌組織中表達(dá)量明顯增加,表達(dá)水平與胃癌患者腫瘤分期及淋巴結(jié)浸潤等呈不同程度相關(guān)
①胃癌組織中HoxC6、 HoxC6-1及HoxC6-2 mRNA水平較正常胃組織顯著上調(diào)(p<0.01);
?、贖oxC6、HoxC6-1及HoxC6-2 mRNA水平與胃癌患者腫瘤分期及淋巴結(jié)浸潤等呈不同程度相關(guān);
?、跦oxC6、HoxC6-1及HoxC6-2在SGC-7901、BGC-823胃癌細(xì)胞株中表達(dá)量均相對較高(
8、用升高倍數(shù)folds±方差SD表示)。HoxC6:2.76±0.02、4.21±0.06;HoxC6-1:2.39±0.35、1.81±0.07; HoxC6-2:2.65±0.29、5.41±0.21。
2、siRNA干擾HoxC6、HoxC6-1及HoxC6-2能不同程度抑制胃癌細(xì)胞增殖,siRNA干擾HoxC6-2能顯著抑制胃癌細(xì)胞的遷移和侵襲。
①建立了分別成功干擾HoxC6、HoxC6-1及HoxC6-2的
9、胃癌細(xì)胞株系SGC-7901和BGC-823,通過qRT-PCR和Western Blot檢測進(jìn)行了驗(yàn)證;
②siRNA分別干擾HoxC6、HoxC6-1及HoxC6-2能顯著抑制胃癌細(xì)胞的增殖(p<0.01)(SGC-7901:抑制率IR依次為12.7%、9.76%、29.54%;BGC-823:IR依次為41.16%、38.08%、44.86%);
③與空載組相比,干擾HoxC6-2能顯著抑制胃癌細(xì)胞的遷移(SG
10、C-7901:抑制率IR=65.62%、p<0.01;BGC-823: IR=56.75%、p=0.04)和侵襲(SGC-7901:IR=55.72%、p=0.03;BGC-823: IR=46.07%、p<0.01);總凋亡較空載組顯著增加( SGC-7901:5%±0.18%/7.94%±0.52%, p<0.01; BGC-823:5.2%±0.47%/10.25%±0.58%,p<0.01)、顯著影響細(xì)胞周期(SGC-7901:
11、G2期增加,p=0.02;BGC-823:G1期增加,p<0.01);而干擾HoxC6、HoxC6-1時,胃癌細(xì)胞的上述生物學(xué)行為受到影響,但沒有統(tǒng)計學(xué)差異(p>0.05)。
3、HoxC6潛在調(diào)控基因、核酸的篩選及初步驗(yàn)證
①運(yùn)用生物信息學(xué)技術(shù)預(yù)測到HoxC6可能調(diào)控的基因53個、micRNA和lncRNA共22個;
②篩選出重要的基因7個(JunD、BMP7、Bcl-2、 MKI67、 WIF1、CAS
12、P1、Spl);qRT-PCR證實(shí)siRNA干擾HoxC6后,JunD、BMP7、MKI67、CASP1、Sp1 mRNA水平顯著升高,而WIF1、Bcl-2 mRNA水平明顯下降。
③同時篩選到一個重要的長鏈非編碼RNA HOTAIR,發(fā)現(xiàn)HOTAIR在胃癌組織及多種胃癌細(xì)胞株中表達(dá)升高。siRNA干擾HoxC6后,HOTAIR的表達(dá)水平顯著降低。
結(jié)論:
1、HoxC6、HoxC6-1及HoxC6-2在
13、人胃癌組織中表達(dá)量增加;
2、HoxC6、HoxC6-1及HoxC6-2的表達(dá)與胃癌患者腫瘤分期及淋巴結(jié)浸潤等呈不同程度相關(guān);
3、干擾HoxC6、HoxC6-1及HoxC6-2可明顯抑制胃癌細(xì)胞的增殖,尤以干擾HoxC6-2時抑制作用最明顯,且對胃癌細(xì)胞遷移和侵襲有明顯抑制作用。研究結(jié)果提示HoxC6在胃癌的發(fā)生中可能扮演促癌基因的角色;
4、HoxC6可能通過與長鏈非編碼RNA HOTAIR互作,從而促
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