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文檔簡介
1、目的:
EDF是2007年在大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)的一種群體感應(yīng)信號分子,為一個線性的五肽,其氨基酸序列為NNWNN。報道認為EDF參與mazEF介導的細胞程序性死亡途徑。然而,EDF在細胞間的傳遞方式和“信號通路”尚不明確。本論文將研究EDF可能的作用靶點和作用機制,以及EDF對大腸桿菌存活的影響。
方法:
1、用Amp處理大腸桿菌,得到裂解液,通過親和柱層析和SDS-PAGE電泳得到與EDF親和的主要條帶,經(jīng)串
2、聯(lián)質(zhì)譜鑒定和 Mascot檢索對比鑒定與 EDF親和的蛋白。
2、SDS法提取OmpC并純化;Ni-螯合親和色譜純化出N-端融合了His-tag的重組GS;構(gòu)建重組質(zhì)粒的方法誘導表達GDH,用His TrapHP鎳柱純化GDH;驗證EDF及其突變體對GS的作用,驗證EDF對GDH的作用。
3、合成 EDF及其一系列丙氨酸和甘氨酸替換的類似物,檢測了 EDF對DPPH、超氧自由基和羥自由基的清除作用。
4、驗
3、證EDF抵御羥自由基誘導的脂質(zhì)、蛋白質(zhì)和DNA損傷的作用。
5、驗證EDF與Amp聯(lián)用時的殺菌效果。
結(jié)果:
1、我們將質(zhì)譜檢測得到的多肽片段指紋圖譜在線檢索,與大腸桿菌的蛋白數(shù)據(jù)庫進行比對,結(jié)果顯示,EDF能夠與大腸桿菌的外膜孔蛋白(OmpC)、谷氨酰胺合成酶(GS)和谷氨酸脫氫酶(GDH)結(jié)合。
2、EDF及其不同的突變體均對GS的活力有不同程度的抑制作用,對GDH則沒有作用。
3、
4、EDF不能清除DPPH自由基,能夠清除超氧自由基和羥自由基,尤其是對于羥自由基的清除作用非常顯著。
4、EDF能夠保護蛋白質(zhì)、脂質(zhì)和DNA免受羥自由基的破壞。
5、EDF與抗生素聯(lián)用會抑制抗生素氨芐青霉素(Amp)的抗菌作用。
結(jié)論:
1、EDF可能是通過OmpC進入大腸桿菌細胞內(nèi)的。
2、EDF可以通過抑制 GS的活性來影響大腸桿菌對氮源的使用,從而行使其信號分子的作用,導致細菌的細胞
5、程序性死亡。
3、EDF能特異清除羥自由基,中間的色氨酸殘基對EDF的羥自由基清除能力至關(guān)重要。
4、EDF能保護脂質(zhì)、蛋白質(zhì)和 DNA免受羥自由基的損傷,這種保護呈現(xiàn)劑量依賴效應(yīng)。
5、EDF在很低的生理濃度下能抑制Amp的抗菌作用,結(jié)合Cell雜志2007年報道的Amp類抗生素的通用殺菌機制有可能是由于能夠刺激E. coli產(chǎn)生羥自由基(.OH),我們認為EDF除了作為群體感應(yīng)因子導致細菌的死亡外,還可
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