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文檔簡介
1、目的:定義NRXN1β基因的最小啟動子區(qū)和調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄的功能元件。
方法:首先通過構(gòu)建含有NRXN1β基因上游調(diào)控區(qū)不同區(qū)域基因組序列的熒光素酶報告基因質(zhì)粒,利用雙熒光素酶報告基因?qū)嶒灆z測報告基因的轉(zhuǎn)錄活性以確定 NRXN1β基因最小啟動子區(qū)域,再進(jìn)一步篩選出相應(yīng)的顯著增強或抑制報告基因活性的功能區(qū);然后利用基因定點突變技術(shù)對功能區(qū)內(nèi)和功能區(qū)臨近DNA序列進(jìn)行連續(xù)的堿基突變,并分析這些突變對報告基因活性的作用;最后結(jié)合在線轉(zhuǎn)錄
2、因子預(yù)測軟件PROMO,對功能區(qū)內(nèi)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控位元件進(jìn)行初步分析。
結(jié)果:成功構(gòu)建了含有不同啟動子區(qū)域和含有突變的兩個系列的NRXN1β啟動子-熒光素酶報告基因,相對熒光素酶活性結(jié)果顯示p4NRXN1β-88/+668(9.63±1.46)與p4NRXN1β-73/+668(2.08±0.51)相比、p4NRXN1β-106/+156(27.07±3.90)與 p4NRXN1β-106/+149(4.99±0.79)相比、p4N
3、RXN1β-106/+229(25.20±4.67)與p4NRXN1β-106/+419(12.53±1.51)相比,3組數(shù)據(jù)前者的熒光素酶活性都高于后者,具有統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.05);為了評估-88/-73功能區(qū)及臨近堿基,利用基因定點突變技術(shù)成功構(gòu)建了一系列的含有突變堿基的質(zhì)粒,雙熒光素酶報告基因?qū)嶒灆z測結(jié)果發(fā)現(xiàn),-84/-63區(qū)域內(nèi)突變的質(zhì)粒與未突變相比活性降低,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),應(yīng)用生物信息學(xué)技術(shù)對該區(qū)域內(nèi)可
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