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1、首都師范大學(xué)碩士學(xué)位論文小立碗蘚(Physcomitrellapatens)植物micrNA結(jié)合靶位預(yù)測姓名:陳文新申請學(xué)位級別:碩士專業(yè):細胞生物學(xué)指導(dǎo)教師:吳群英20080506英文摘要PredictionofplantmicroRNAtargetsinPhyscomitrellapatensBryophytesincludethreegroups:liverworts(Marchantiophyta),homworts(Antho
2、cerotophyta)andmosses(Bryophyta)PhyscomitrellapatensbelongstoFunariaceae,PhyscomitrellaPpatenshasahighfrequencyofhomologousrecombinationItpossessesauniquepositionintheevolutionfromalgatohigherplantBesidesPpatenshasanextr
3、emeabilitytotoleratesaltanddroughtTherefore,PpatenshasbeenbecominganimportantmodelorganismTillMarch2007,麗t11thecompletionofchloroplastgenome,mitochondriongenomeandgenomedraftsequencing,PpatensentersthegenomicagemiRNAsare
4、aclassofnoncodingendogenoussmallRNA、析tllalengthof21~24nucleotidesTheyhavebeendiscoveredbothinanimalsandplants,andplaya麗derangeofbiologicalfunctionsmiRNAsarenowbelievedtosharethesameimportantrolesingeneexpressionregulatio
5、nastranscriptionfactorsSincethesequencesofmostmiRNAsarehighlyconservedamongcloserelatedspecies,andmiRNAsdisplayperfectoralmostperfectsequencecomplementtotheirtargetmRNAsequences,itisfeasibletopredicttheplantmiRNAtargetsu
6、smgbioinformaticapproachesInthepresentwork857plantmiRNAswereusedtosearch27546PpatensmRNAswinlPatScanforcomplementaryhits162miRNAfamilieshadpotentialtargetsinPpatensnlenumberoftargetsandthepositioninmiRNACOregulationnetwo
7、rkbomindicatedthatmiR482andmiRl168mayplaycrucialrolesin只patens52ChlamydomonasreinhardtiispecificmiRNAsandmanyfloweringplantmiRNAssimultaneouslyhavingtargetsinPpatenssuggestedthemossoccupiedauniquephylogeneticpositionfrom
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