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文檔簡(jiǎn)介
1、【研究背景】:
冠心?。╟oronary artery disease, CAD)是危害人類健康的主要疾病,其發(fā)病率和死亡率居所有疾病之首。CAD的發(fā)生主要是由于冠狀動(dòng)脈粥樣硬化所致,受遺傳因素和環(huán)境因素影響,其中遺傳因素起主導(dǎo)作用。高膽固醇是CAD的獨(dú)立危險(xiǎn)因素之一,其在細(xì)胞中的蓄積與膽固醇的細(xì)胞代謝調(diào)控有關(guān)。三磷酸腺苷結(jié)合盒轉(zhuǎn)運(yùn)體G1( ATP-binding cassette transporter G1, ABCG1)
2、是三磷酸結(jié)合盒(ATP-binding cassette, ABC)轉(zhuǎn)運(yùn)體超家族中的成員之一,參與細(xì)胞內(nèi)膽固醇和磷脂向高密度脂蛋白膽固醇(high density lipoprotein cholesterol, HDL-C)轉(zhuǎn)運(yùn)的過(guò)程,從而避免膽固醇嚴(yán)重沉積于外周細(xì)胞,在膽固醇逆向轉(zhuǎn)運(yùn)( reverse cholesterol transport, RCT)中起重要作用。既往研究顯示ABCG1基因內(nèi)或啟動(dòng)子區(qū)的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(si
3、ngle nucleotide polymorphisms, SNPs)與CAD的易感性有關(guān)。啟動(dòng)子區(qū)的SNPs能導(dǎo)致ABCG1的表達(dá)水平改變,從而導(dǎo)致個(gè)體對(duì)CAD易感性的差異,致使啟動(dòng)子活性下降的SNPs降低CAD的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),其主要機(jī)制可能是誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞的凋亡所致。然而ABCG1存在多個(gè)轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)(promoter region A, B, C等),對(duì)于啟動(dòng)子A中的SNPs是否與CAD的易感性有關(guān)也有研究報(bào)道,且與早發(fā)心肌梗死和冠脈病
4、變血管數(shù)相關(guān)。但rs1378577是否影響ABCG1啟動(dòng)子活性,以及在啟動(dòng)子A區(qū)是否存在其它與CAD易感性有關(guān)的SNPs尚不清楚,本研究擬通過(guò)Sanger測(cè)序和雙螢光素酶報(bào)告基因系統(tǒng)鑒定ABCG1啟動(dòng)子A區(qū)與CAD易感性相關(guān)的SNPs和單倍型,進(jìn)一步揭示ABCG1參與CAD發(fā)生發(fā)展的分子遺傳機(jī)制。
【研究目的】:
1.探討ABCG1基因啟動(dòng)子A近轉(zhuǎn)錄啟始位點(diǎn)區(qū)域的多態(tài)性對(duì)基因轉(zhuǎn)錄活性的影響。
2.探討 AB
5、CG1啟動(dòng)子 A近轉(zhuǎn)錄啟始位點(diǎn)區(qū)域的多態(tài)性與中國(guó)南方漢族人群CAD易感性的關(guān)系。
【研究方法】:
1.采用病例-對(duì)照研究,收集217例經(jīng)冠脈造影證實(shí)的CAD患者和142例對(duì)照者的血樣,提取基因組DNA;同時(shí)收集研究對(duì)象的詳細(xì)臨床資料。
2.對(duì)ABCG1啟動(dòng)子A轉(zhuǎn)錄啟始位點(diǎn)上游約1000 bp核苷酸序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增和Sanger法測(cè)序,計(jì)算SNPs位點(diǎn)基因型和等位基因型在各組中的頻率,并對(duì)序列進(jìn)行進(jìn)化分析,
6、分析SNPs組成的單倍型及單倍型頻率分布。
3.構(gòu)建ABCG1的組成型和突變型啟動(dòng)子單倍型螢光素酶報(bào)告基因載體,轉(zhuǎn)染Hela和HCAEC,利用雙螢光素酶報(bào)告基因系統(tǒng)檢測(cè)不同單倍型的螢光素酶活性。
4.統(tǒng)計(jì)分析:比較分析組或亞組間SNPs等位基因頻率、基因型頻率及其所形成的單倍型頻率差異。
【結(jié)果】:
1.在ABCG1基因啟動(dòng)子A轉(zhuǎn)錄啟始位點(diǎn)上游約1000 bp序列中發(fā)現(xiàn)3個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)[-384(A
7、/G)、-204(A/C)和-134(T/G)],可形成ACG、GAT和GCG3種單倍型,3個(gè)SNPs間強(qiáng)連鎖不平衡,Tajima’s D=2.655(P<0.001)。
2.三種組成型單倍型(ACG、GAT和 GCG)的轉(zhuǎn)錄活性無(wú)顯著性差異。將GAT進(jìn)行點(diǎn)突變,得到兩種突變單倍型GAG和GCT,GAG單倍型的轉(zhuǎn)錄活性較組成型單倍型的轉(zhuǎn)錄活性升高約2倍,而GCT單倍型的轉(zhuǎn)錄活性與組成型單倍型無(wú)顯著差異。
3. ABC
8、G1啟動(dòng)子A區(qū)SNP位點(diǎn)[-384(A/G)、-204(A/C)和-134(T/G)]的等位基因頻率、基因型頻率及其形成的單倍型的頻率在CAD和對(duì)照組中分布無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,與早發(fā) CAD及 CAD病變數(shù)量的嚴(yán)重程度亦無(wú)顯著相關(guān)性。
【結(jié)論】:
1. ABCG1啟動(dòng)子A區(qū)的3個(gè)SNPs[-384(A/G)、-204(A/C)和-134(T/G)]形成的三種組成型單倍型的啟動(dòng)子活性沒(méi)有顯著差異。
2. ABCG1
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