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文檔簡介
1、第一部分
應(yīng)用生物信息學(xué)預(yù)測GR mRNA是mmu-miR-30a的可能靶基因
目的:預(yù)測miRNA靶基因是否為糖皮質(zhì)激素受體(Glucocorticoid Receptor,GR) mRNA。
方法:使用miRBase(http://www.mirbase.org)獲得miR-30a基因序列;使用Pubmed(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)獲得基因NR3C1序列;分別
2、使用miRanda、TargetScan、PicTar生物信息學(xué)軟件對mmu-miR-30a的靶基因進(jìn)行尋找與預(yù)測。
結(jié)果:miRanda、TargetScan和PicTar均預(yù)測到mmu-mir-30a的靶基因為糖皮質(zhì)激素受體(Glucocorticoid Receptor,GR)mRNA。
結(jié)論:GR mRNA是mmu-miR-30a的可能靶基因
第二部分
小鼠
3、足細(xì)胞中GRα及mmu-miR-30a的表達(dá)變化
目的:探討GRα與mmu-miR-30a在小鼠足細(xì)胞系MPC5(mouse podocyte clone5,MPC5)中的表達(dá)變化。
方法:
條件永生型小鼠足細(xì)胞系MPC5培養(yǎng):將復(fù)蘇MPC5細(xì)胞于33℃中增殖培養(yǎng),平均3~4天達(dá)90%以上融合傳代。換于37℃中培養(yǎng),10~14天分化為成熟,此時為分化態(tài)MPC5;將以上兩種細(xì)胞分為兩組,通過反轉(zhuǎn)錄
4、酶-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)、免疫蛋白印跡(Western-blot)、免疫熒光顯微鏡檢測Nephrin、Synaptopodin、GRα在未分化態(tài)與分化態(tài)MPC5中的表達(dá),觀察變化:通過實時熒光定量PCR反應(yīng)(qRT-PCR)檢測mmu-miR-30a在未分化態(tài)與分化態(tài)MPC5中的表達(dá),觀察變化;
結(jié)果:
MPC5細(xì)胞在33℃有γ-INF的1640培養(yǎng)液中生長,細(xì)胞體小而突起,細(xì)胞間排列緊密,呈鵝卵石樣
5、,部分區(qū)域有管腔樣結(jié)構(gòu),足突樣結(jié)構(gòu)少見,平均3~4天即達(dá)到90%融合,在37℃無γ-INF條件培養(yǎng)下的足細(xì)胞較33℃的胞體透明,呈多角形,細(xì)胞間相對疏松,管腔樣結(jié)構(gòu)增多,生長速度明顯減緩,3~4天后細(xì)胞即停止增殖,1周后星型細(xì)胞樣細(xì)胞形成,樹枝狀的足突結(jié)構(gòu)明顯,可見細(xì)胞間足突互相接觸,10~14天分化成熟。RT-PCR、Western-blot、免疫熒光顯微鏡顯示,nephrin在33℃未分化足細(xì)胞和37℃分化足細(xì)胞中均有表達(dá),37℃分
6、化足細(xì)胞中表達(dá)顯著增加(P<0.01);Synaptopodin在33℃未分化足細(xì)胞中幾乎未見表達(dá);而在37℃分化足細(xì)胞中表達(dá)明顯(P<0.01)。GRα在33℃未分化足細(xì)胞和37℃分化足細(xì)胞中均有表達(dá),37℃分化足細(xì)胞中表達(dá)顯著增加(P<0.01);qRT-PCR檢測顯示,mmu-miR-30a在33℃未分化足細(xì)胞和37℃分化足細(xì)胞中均有表達(dá),37℃分化足細(xì)胞中表達(dá)顯著增加(P<0.01)。
結(jié)論:
GRα
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