腸炎沙門(mén)氏菌感染引起的白來(lái)航蛋雞脾臟全基因組表達(dá)譜分析.pdf

1、沙門(mén)氏菌屬腸桿菌科，為革蘭氏染色陰性桿菌，對(duì)蛋雞生產(chǎn)和食品安全造成重大影響。蛋雞沙門(mén)氏菌病主要是由沙門(mén)氏菌引起的一種以蛋雞出現(xiàn)零星死亡，產(chǎn)蛋率下降的慢性消耗疾病，時(shí)間一長(zhǎng)，容易引起蛋雞消化道功能紊亂，雞群抗病力下降，繼發(fā)感染其它疾病。一些沙門(mén)氏菌含有攜帶耐藥因子的遺傳質(zhì)粒，耐藥因子傳遞的對(duì)多種抗生素的耐藥性，給治療沙門(mén)氏菌污染造成困難。從雞本身出發(fā)，研究其對(duì)沙門(mén)氏菌感染抗性的分子機(jī)制是緩解沙門(mén)氏菌病對(duì)蛋雞生產(chǎn)危害的有效途徑之一。

2、　　 本研究以開(kāi)產(chǎn)蛋雞為研究對(duì)象，用腸炎沙門(mén)氏菌感染后，采集血液，用全血自動(dòng)分析儀分析腸炎沙門(mén)氏菌對(duì)血液生理指標(biāo)的影響，利用Agilent雞4*44K V2全基因組表達(dá)芯片檢測(cè)感染后8天和16天脾臟組織的基因表達(dá)，篩選出由沙門(mén)氏菌感染引起表達(dá)差異的基因，并對(duì)篩選出來(lái)的差異表達(dá)基因進(jìn)行聚類(lèi)分析，同時(shí)利用DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)其進(jìn)行生物學(xué)功能分析。此外，我們利用QRT-PCR方法對(duì)芯片結(jié)果做了驗(yàn)證，同時(shí)把篩選出來(lái)的差異表達(dá)基因與免疫相關(guān)基岡進(jìn)

3、行關(guān)聯(lián)分析。并把兩個(gè)時(shí)間點(diǎn)篩選出來(lái)的差異基因進(jìn)行了對(duì)比。結(jié)果顯示:
　　 (1)對(duì)照組和試驗(yàn)組的血液樣品中白細(xì)胞的數(shù)量都普遍高于正常值，但同一時(shí)間點(diǎn)試驗(yàn)組和對(duì)照組的比較差異不顯著;感染后8天的試驗(yàn)組紅細(xì)胞數(shù)量明顯高于對(duì)照組，但在感染后16天這種差異未達(dá)到顯著性水平。
　　 (2)為了驗(yàn)證芯片結(jié)果的可靠性，選擇了11個(gè)差異表達(dá)基因進(jìn)行QRT-PCR。對(duì)芯片數(shù)據(jù)和QRT-PCR的結(jié)果進(jìn)行了相關(guān)性分析，得出相關(guān)系數(shù)為r=0.8

4、04。 QRT-PCR驗(yàn)證結(jié)果與芯片試驗(yàn)結(jié)果一致，所以本研究所獲得的芯片結(jié)果是準(zhǔn)確可靠的。
　　 (3)成功篩選出感染后8天脾臟樣品中差異表達(dá)基因1371個(gè)，包括已知的和免疫相關(guān)的基因33個(gè);感染后16天脾臟樣品差異表達(dá)基因692個(gè)，其中和免疫相關(guān)的基因28個(gè)。
　　 (4)聚類(lèi)分析結(jié)果顯示同一時(shí)間點(diǎn)試驗(yàn)動(dòng)物具有更相似的表達(dá)模式;部分和免疫相關(guān)的基因存在相似的調(diào)節(jié)功能，在聚類(lèi)分析中聚在一塊。
　　 (5) GO和