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1、延胡索酸還原酶(fumarate reductase,EC1.3.1.6),主要催化延胡索酸還原生成琥珀酸,是很多生物厭氧呼吸系統(tǒng)中的關(guān)鍵酶。該酶廣泛存在于革蘭氏陰性菌、兼性厭氧革蘭氏陽(yáng)性菌以及一些綠藻、原生動(dòng)物、寄生蠕蟲(chóng)和低等海洋等真核生物中。不僅可應(yīng)用于多種人類(lèi)疾病治療,且其產(chǎn)物琥珀酸也有廣泛的工業(yè)應(yīng)用價(jià)值。本研究主要研究了從廣西北部灣海洋微生物宏基因組文庫(kù)中得到的一個(gè)具有延胡索酸還原酶功能的陽(yáng)性克隆(pGXAR313G),其攜帶的
2、外源DNA片段包含一個(gè)可能編碼延胡索酸還原酶的新基因,該基因被命名為frd1A。
通過(guò)生物信息學(xué)分析表明,frd1A基因含有444個(gè)堿基對(duì),編碼147個(gè)氨基酸,理論等電點(diǎn)為5.59,相對(duì)分子質(zhì)量為16.11 kDa。通過(guò)與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),在核苷酸水平上沒(méi)有發(fā)現(xiàn)已知的基因存在相似性,但是在氨基酸水平卻與一種延胡索酸還原酶(Runellaslithyformis YP_004658175)的B亞基相似性為82%,一致
3、性為69%。在第56-64個(gè)氨基酸中,有一個(gè)2Fe-2S鐵氧還蛋白結(jié)合位點(diǎn),推測(cè)是其保守結(jié)構(gòu)域。
利用DNA重組技術(shù),將frd1A基因片段與表達(dá)質(zhì)粒pETBlue-2重組后導(dǎo)入到Escherichia coli Tuner(DE3)pLacI細(xì)胞中,得到重組表達(dá)菌株E.coli Tuner(DE3)pLacI/pGXAR313G。并在最適條件下誘導(dǎo)培養(yǎng),得到重組產(chǎn)物蛋白Frd1A,利用鎳柱親和層析技術(shù)完成了重組蛋白的分離純
4、化,完成了重組蛋白的功能鑒定和生化性質(zhì)研究。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,目標(biāo)蛋白的最適反應(yīng)溫度為28℃,最適作用pH為7.0;最適條件下的酶活力為9.59 U/mL,比活力為10.644 U/mg。通過(guò)Lineweaver-Burk雙倒數(shù)作圖法,測(cè)得其Km值為0.227 mM,Vmax為29.94 mM/min,kcat值為12.35 s-1;Zn2+、Mg2+對(duì)酶反應(yīng)有促進(jìn)作用,Cu2+、Fe2+、Fe3+、Ca2+、SDS和EDTA則表現(xiàn)為抑制作
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