不同地區(qū)傳統(tǒng)乳制品中腸膜明串珠菌的多位點(diǎn)序列分型研究.pdf

1、本研究通過(guò)選取分離自傳統(tǒng)乳制品中的的136株腸膜明串珠菌（蒙古國(guó)14株、四川阿壩州30株、甘肅甘南州27株、內(nèi)蒙古赤峰市28株、內(nèi)蒙古錫林郭勒盟22株、內(nèi)蒙古呼倫貝爾盟15株）為研究對(duì)象，采用多位點(diǎn)序列分型方法對(duì)9個(gè)持家基因(dnaA、pyrG、pepN、rpoB、murE、uvrC、murC、groEL、pheS)的核苷酸序列進(jìn)行分析，進(jìn)而對(duì)腸膜明串珠菌的多態(tài)性分析和遺傳進(jìn)化展開(kāi)研究。對(duì)獲取的持家基因的核苷酸序列進(jìn)行雙向測(cè)序，對(duì)其進(jìn)行

2、拼接、核對(duì)后繪出等位基因圖譜，確定了不同的序列型，排除基因突變和基因的重組交換。通過(guò)對(duì)9個(gè)持家基因的G+C含量、dN/dS等分析得出，所選取的持家基因較為保守，可以滿足后續(xù)MLST分析。通過(guò)對(duì)其ST型進(jìn)行分析，對(duì)136株腸膜明串珠菌進(jìn)行分型，得出如下結(jié)論:
　　(1)136株腸膜明串株菌共分為68個(gè)ST型，其中ST-14包含的菌株最多（13株）。這些STs經(jīng)eBURST分析后，其中52個(gè)ST型構(gòu)成了8個(gè)分型組，其余16個(gè)ST型為獨(dú)

3、特型。8個(gè)分型組各自為一個(gè)CC復(fù)合體，分別為CC55、CC61、CC29、CC16、CC45、CC35、CC28、CC9，其中CC55所包含得STs最多(16個(gè)STs)，且以ST-55為中心，因此ST-55被認(rèn)為是較原始的序列型。
　　(2)136株腸膜明串珠菌之間的遺傳進(jìn)化關(guān)系，大部分與菌株分離地之間的距離呈現(xiàn)正相關(guān)性。同時(shí)不同地區(qū)的分離株大部分是由分離自甘肅甘南州的菌株進(jìn)化而來(lái)的。
　　(3)來(lái)自甘肅甘南州和四川阿壩州地