MMP2及COL9A2基因與400例漢族病理性近視的相關(guān)性研究.pdf

1、目的:1.研究基質(zhì)金屬蛋白酶-2(matrix metallopeptidase2,MMP2)及Ⅸ型膠原蛋白A2(Collagen Type IXAlpha2,COL9A2)基因的單核甘酸多態(tài)性與中國漢族病理性近視人群的關(guān)聯(lián);
　　2.對MMP2及COL9A2基因進(jìn)行突變分析。
　　方法:本研究運(yùn)用病例-對照研究對400例無親緣關(guān)系的病理性近視患者和400名健康對照進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。對MMP2基因區(qū)域內(nèi)的20個(gè)標(biāo)簽單核甘酸多態(tài)性

2、(tag SNP),采用SNaPshot法在所有受試者中進(jìn)行基因分型;通過Sanger測序技術(shù)對其中200例病理性近視患者及200名健康對照組的MMP2基因進(jìn)行突變分析,對其外顯子編碼區(qū)及其側(cè)翼進(jìn)行測序。
　　同時(shí),本研究組運(yùn)用Sanger測序技術(shù)對其中200例病理性近視患者(病例1組)及200名健康對照組(對照1組)的COL9A2基因進(jìn)行突變分析,對全部外顯子及其側(cè)翼進(jìn)行測序;對檢測到的突變位點(diǎn)用SNaPshot方法在另外200

3、例病理性近視患者(病例2組)和200名健康對照組(對照2組)中進(jìn)行基因分型。
　　結(jié)果:本研究對MMP2基因區(qū)域內(nèi)的20個(gè)標(biāo)簽 SNP的等位基因頻率在病理性近視組與健康對照組中的差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。通過Sanger測序,在200例病理性近視患者及200名健康對照組的MMP2基因外顯子編碼區(qū)及其側(cè)翼檢測到7個(gè)變異位點(diǎn)。在79例病理性近視患者中,檢測到MMP2基因第7外顯子c.1287G>A堿基改變(14個(gè)純合子和65個(gè)

4、雜合子),同時(shí)在84名健康對照中檢測到此變異(17個(gè)純合子和67個(gè)雜合子),該變異為新變異。在3例病理性近視患者中,檢測出 MMP2基因第9外顯子 c.1810G>A雜合錯(cuò)義突變,其他病理性近視患者及對照組中未檢測出。在病例組與對照組中,檢測到5個(gè)已知核苷酸變異。
　　對COL9A2基因全部外顯子進(jìn)行Sanger測序,在200例病理性近視患者(病例1組)及200名健康對照組(對照1組)中未檢測到已報(bào)道的D281fs,但在1例病理性

5、近視患者中,檢測出 COL9A2基因第2外顯子 c.143G>C雜合錯(cuò)義突變,另外1例患者檢測出COL9A2基因第17外顯子c.884G>A雜合錯(cuò)義突變,其他病理性近視患者及對照組中未檢測出c.143G>C和c.884G>A突變。同時(shí)在外顯子編碼區(qū)檢測到COL9A2基因rs2228564 SNP位點(diǎn),其等位基因頻率在病例組與對照組間的差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。用SNaPshot方法對這些位點(diǎn)在另外200例病理性近視患者組(病例2

6、組)和200名健康對照組(對照2組)中進(jìn)行驗(yàn)證,1例患者檢測出COL9A2基因第2外顯子c.143G>C雜合錯(cuò)義突變,2例患者檢測出COL9A2基因第17外顯子c.884G>A雜合錯(cuò)義突變,rs2228564 SNP位點(diǎn)的等位基因頻率在兩組間的差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
　　結(jié)論:本研究檢測的MMP2基因的20個(gè)標(biāo)簽SNPs與中國漢族病理性近視患者無關(guān)聯(lián)性,MMP2基因第9外顯子c.1810G>A雜合錯(cuò)義突變可能與中國漢族