EB病毒相關(guān)胃癌組織中EB病毒基因亞型的檢測與分析.pdf_第1頁
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1、青島大學(xué)碩士學(xué)位論文EB病毒相關(guān)胃癌組織中EB病毒基因亞型的檢測與分析姓名:紀(jì)靜申請學(xué)位級別:碩士專業(yè):病原生物學(xué)指導(dǎo)教師:羅兵20080601DetectionandanalysisofEpstein—BarrvirusgenotypesinEBVassociatedgastriccarcinomasAbstractobjective:ToelucidatevariationsoftypeslandII,BamHIFand£BamHI

2、IandiandthepolymorphismofEBVLMP1geneinEBVassociatedgastriccarcinomas(EBVaGC),andtoexplorethecorrelationbetweenthegenevariationsandEBVaGCMethods:EBVDNAgenomewastestedin185gastriccarcinomatissuesandcorrespondingadjacenttis

3、suesbypolymerasechainreaction(PCR)一SouthernblottingEBVencodedsmallRNAl(EBER1)inPCRpositivesampleswastestedbyinsituhybridization(ISH)inparaffin—embeddedsectionsGastriccarcinomawithpositiveEBERlsignalswasconfirmedEBVaGCcas

4、esPCRandrestrictionfragmentlengthpolymorphism(RFLP)analysiswasusedtodetectthevariationsoftypes1and2,BamHIF‘a(chǎn)ndfandBamHIIandiinchineseEBVaGCcasesfromShandongProvinceTheC—terminiofLMP1in12and8EBVaGCcasesfromShandongProvinc

5、eandJapanrespectivelywereanalyzedbyPCRandsequencingThesequenceswerecomparedwithpreviouslypublishedstrainsandwerecharacterizedonaphylogenetictreeThedifferencebetweenChineseandJapaneseisolateswascharacterizedResults:QThere

6、were13EBVpositivesamplesin185gastriccarcinomas(703%),butnoEBVpositivesampleincorrespondingpara—carcinomasThedifferenceofEBVpositiveratebetweengastriccarcinomaandcorrespondingparacarcinomatissueswassignificant()C2=110769,

7、P=O0009)Inourseries,age,pathologicaldifferentiation,clinicalstages,lymphnodemetastasisandlocationofcancerwerenotdifferentbetweenEBVnegativegastriccarcinomas(EBVnGC)andEBVaGC(P=0669,O141,0259,0818,0064,respectively),while

8、sexwassignificantlydifferentbetweenthetwogroups(∥=39404,t9=_00471)②A1lof12EBVaGCweregroupedintotype1andprototypeE11outof12EBVaGCcasesbelongedtotypei,andonlyonebelongedtotypeI③lOof12ChineseGCisolates(833%)andallofthe8(100

9、%)JapaneseEBVaGCisolatesbelongedtotheChina1strainAlso,B95—8typeisolateswerefoundin2of12ChineseGCInthe18China1typeisolates,additionalmutationsoutsidethesignaturesequencechangeswerefoundAllJapaneseisolates(1oo%)hadtwoormor

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