非小細胞肺癌腦轉(zhuǎn)移腦脊液蛋白質(zhì)譜診斷模型的建立及其應(yīng)用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、研究背景和目的:
   隨著多學科綜合治療的開展,化療藥物和放療技術(shù)的進步,非小細胞肺癌( non-small cell lung cancer,NSCLC)患者的生存期有所延長,腦轉(zhuǎn)移的發(fā)生率也越來越高。目前腦轉(zhuǎn)移的診斷主要依靠影像學方法,如MRI和CT,對于影像學上沒有表現(xiàn)的腦部微小轉(zhuǎn)移病灶目前還沒有有效的診斷方法。腦部微小轉(zhuǎn)移病灶可能會分泌腫瘤相關(guān)蛋白到腦脊液中,通過檢測腦脊液中的腫瘤蛋白標志物,有可能實現(xiàn)腦轉(zhuǎn)移早期診斷的

2、目的。表面增強激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜技術(shù)(surface-enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)是近年發(fā)展起來的一種新的蛋白質(zhì)分離鑒定技術(shù),它具有快速、簡便、微量和高通量等特點,非常符合臨床體液蛋白質(zhì)組學研究的需要,被廣泛應(yīng)用于分離各種疾病相關(guān)的特異性標志物。已有報道用SELDI技術(shù)通過檢測血清來診斷肺癌,檢

3、測腦脊液來診斷腦膠質(zhì)瘤,但目前還沒有報道采用SELDI技術(shù)檢測腦脊液來診斷NSCLC腦轉(zhuǎn)移。本研究的目的是通過分析NSCLC腦轉(zhuǎn)移患者、非腫瘤患者和早期NSCLC無腦轉(zhuǎn)移患者腦脊液的蛋白質(zhì)譜,找出差異蛋白峰,建立NSCLC腦轉(zhuǎn)移的蛋白質(zhì)潛診斷模型,為肺癌腦轉(zhuǎn)移的診斷提供新的方法。
   材料與方法:
   收集2007年3月2008年6月廣東省人民醫(yī)院住院患者的腦脊液標本,其中NSCLC腦轉(zhuǎn)移患者腦脊液標本29例,早期N

4、SCLC無腦轉(zhuǎn)移患者腦脊液標本10例,非腫瘤患者腦脊液標本23例。所有患者未行腦部和椎體放射治療和手術(shù)。采用美國Ciphergen Biosystems公司的CM10芯片和PBS II蛋白質(zhì)芯片閱讀機對腦脊液標本進行檢測和數(shù)據(jù)讀取。采用Biomarker Wizard軟件統(tǒng)計分析3組標本的蛋白質(zhì)峰,運用Biomarker pattems軟件的決策樹模型進行差異蛋白峰的比較和判別,建立分類決策樹診斷模型。用由學習集建立的診斷模型對測試集進

5、行盲法測試,評價其診斷和應(yīng)用價值。
   結(jié)果:
   1、肺癌腦轉(zhuǎn)移組和非腫瘤組之間有8個顯著差異性表達蛋白質(zhì)峰,有7個在腦轉(zhuǎn)移組中高表達,荷質(zhì)比( mass/charge,m/z)分別為:3400.41,4420.40,4966,32,6437.45,6634.73,8564.52,8693.23;有1個在腦轉(zhuǎn)移組中低表達,其m/z為4586.03。進一步應(yīng)用數(shù)據(jù)建立分類決策樹狀模型,發(fā)現(xiàn)只要一個m/z為6634.7

6、3蛋白質(zhì)峰就可以把兩組標本分開,在學習集中其靈敏度(sensitivity)為89.66%,特異度(specificity)為86.96%,總的診斷準確率為88.46%,陽性似然比6.87。
   2、肺癌腦轉(zhuǎn)移組與早期無腦轉(zhuǎn)移組有5個顯著差異性表達蛋白質(zhì)峰,在腦轉(zhuǎn)移組中都高表達,其m/z分別為:8698.00,6634.72,3400.40,4630.44,6427.96。運用數(shù)據(jù)建立分類決策樹狀模型,包括m/z為8698.0

7、0、1215.32和1245.70蛋白質(zhì)峰組成。在學習集中其靈敏度( sensitivity)為100.00%,特異度(specificity)為100.00%,總的診斷準確率為100.00%。
   3、肺癌腦轉(zhuǎn)移組和非腫瘤組標本各取10例進行盲法測試。結(jié)果顯示其靈敏度( sensitivity)為80.00%,特異度(specificity)為70.00%,總的診斷準確率為75.00%,陽性似然比2.67。
   結(jié)

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