并行生物計算集群的構(gòu)建及性能評價和腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)基因的基因組聚類及功能注釋.pdf

1、目的：研究并行計算集群的構(gòu)建策略和實現(xiàn)方法，生物信息學(xué)并行軟件的配置和安裝以及在生物信息學(xué)方面的應(yīng)用。并且探討并行計算集群的性能，在加快生物信息學(xué)研究方面的意義。 結(jié)論：我們已經(jīng)實現(xiàn)并行生物計算集群的構(gòu)建，其計算性能達到了超線性加速。該生物計算集群可以在局域網(wǎng)范圍內(nèi)實現(xiàn)計算任務(wù)提交，對本實驗室的生物學(xué)研究具有巨大的推動作用。 課題二腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)基因的基因組聚類和功能注釋及新的腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)基因的高通量虛擬篩選 研究

2、背景及目的：研究目前所有已知腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)基因的功能聚類及注釋，研究人類基因組上腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)基因的編碼熱區(qū)及功能組成。并以已知的腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)基因核酸序列為基礎(chǔ)，利用并行生物計算平臺，從人類EST數(shù)據(jù)庫挖掘新的腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)基因。以期發(fā)現(xiàn)基因功能與基因組定位間的內(nèi)在聯(lián)系，進一步闡明腫瘤轉(zhuǎn)移的分子機理和尋找更多的腫瘤轉(zhuǎn)移阻斷靶點。 結(jié)論：采用生物信息學(xué)方法成功鑒定了腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)基因的基因組編碼熱區(qū)。采用模糊聚類算法表明有9組基因?qū)δ[瘤轉(zhuǎn)