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文檔簡介
1、目的:大腸癌是全球最常見的消化系統(tǒng)惡性腫瘤之一。EDNRB是一個新發(fā)現(xiàn)的潛在的腫瘤抑制基因,它曾被報道在多種腫瘤中通過啟動子甲基化引起基因表達沉默。然而,EDNRB基因在大腸癌的功能尚不清楚。在本研究中,我們研究了 EDNRB在大腸癌組織及對照組織中的DNA甲基化狀態(tài)、mRNA表達水平,及其與臨床數(shù)據(jù)的關(guān)聯(lián)。
方法:1、大腸癌組織樣本收集:本研究收集了2012年6月至2013年4月之間在某醫(yī)院胃腸外科、肛腸外科及腫瘤外科接受手
2、術(shù)治療的大腸癌患者的癌組織及正常組織各42例。切取標本時,正常組織標本距離腫瘤至少5cm。組織被切下后立即放入液氮中凍存,之后轉(zhuǎn)移到-80℃冰箱保存。2、MSP:使用離心柱法提取42對大腸癌組織和正常對照組織的DNA,檢測 DNA的濃度和質(zhì)量,采用亞硫酸氫鹽修飾法進行甲基化轉(zhuǎn)化,修飾后的DNA用于 PCR擴增模板。最后,將 PCR產(chǎn)物進行凝膠電泳。3、qRT-PCR:使用TRIzol試劑提取42對大腸癌組織和正常對照組織的RNA,檢測
3、RNA的濃度和質(zhì)量,進行逆轉(zhuǎn)錄,合成的cDNA根據(jù)兩步法行 qRT-PCR擴增,記錄下儀器中的擴增曲線、溶解曲線、Ct值,并且將 qRT-PCR產(chǎn)物行凝膠電泳,以鑒定產(chǎn)物的特異性。4、統(tǒng)計學(xué)分析:EDNRB啟動子甲基化的比較采用卡方檢驗的校正公式。2–ΔCt法用于分析qRT-PCR的結(jié)果。采用配對 t檢驗進行兩組相關(guān)數(shù)據(jù)間比較。兩組獨立樣本不符合正態(tài)性檢驗,則采用Mann-Whiteney U檢驗比較。認為p<0.05有統(tǒng)計學(xué)顯著差異。
4、
結(jié)果:通過 MSP檢測,42例大腸癌組織的EDNRB基因啟動子甲基化率(陽性率為92.86%)明顯高于42例正常對照組織 EDNRB基因啟動子甲基化率(陽性率為59.52%)。大腸癌組織 EDNRB甲基化率與大腸正常組織甲基化率相比,差異有顯著意義(p=0.001)。另外我們研究了 EDNRB基因甲基化狀態(tài)和大腸癌患者的臨床特征之間的關(guān)聯(lián),結(jié)果顯示它們之間均沒有顯著關(guān)聯(lián)。
通過qRT-PCR檢測,42例大腸癌組織的
5、EDNRB mRNA表達水平(0.31±0.91)明顯低于42例正常對照組織 EDNRB mRNA表達水平(0.70±1.18)。大腸癌組織 EDNRB mRNA表達水平與大腸正常組織 EDNRB mRNA表達水平相比,差異有顯著意義(p=0.032)。另外我們研究了 EDNRB基因 mRNA表達水平和大腸癌患者的臨床特征之間的關(guān)聯(lián),結(jié)果顯示它們之間均沒有顯著關(guān)聯(lián)。
結(jié)論:
本研究工作以大腸癌組織、正常對照組織為研究
6、對象,研究大腸癌組織中EDNRB基因啟動子甲基化狀態(tài)及 mRNA表達水平,得出以下結(jié)論:
1、大腸癌組織中 EDNRB基因啟動子甲基化率較高,而正常對照組織 EDNRB基因啟動子甲基化率較低。
2、大腸癌組織中 EDNRB基因啟動子甲基化水平與大腸癌患者的臨床特征之間無明顯相關(guān)性。
3、大腸癌組織中 EDNRB mRNA表達水平較低,而正常對照組織 EDNRB mRNA表達水平較高。
4、大腸癌組
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