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文檔簡介
1、本研究的基本目標為利用RNAi方法研究N-RAS基因在凋亡信號傳導通路中的作用。實驗研究分為三個部分:首先以從人類紅白血病細胞株K562細胞為模型,以正常人外周血白細胞為對照,研究K562細胞株中N-RAS基因的表達情況,為RNA干擾實驗的可行性提供實驗依據(jù);在上述實驗基礎上,在K562細胞中進行N-RAS基因干擾實驗,并分別在mRNA及細胞水平觀察N-RAS基因表達缺失的細胞表型;在研究N-RAS基因功能的同時,進行RNA干擾實驗條件
2、優(yōu)化的探索,具體研究mRNA二級結構對RNA干擾效果的影響,為提高RNA干擾效果提供實驗依據(jù)。 本研究主要針對以下方面開展研究: 1.對N-RAS基因在K562細胞中的表達情況進行研究。針對N-RAS基因組保守區(qū)域設計PCR特異性引物。擴增特異性片段,純化PCR產(chǎn)物,連接T載體并轉化;提取重組質粒,雙向測序鑒定,利用美國國家生物技術信息中心(NCBI)提供的BLAST分析軟件,與NCBI所提供N-RAS基因序列進行比對,
3、檢測突變位點;以正常人外周血白細胞為對照,看家基因GAPDH為內參照,用RT-PCR方法對N-RAS基因表達水平進行測定。 2.進行siRNA的篩選與干擾的初步研究。特異性siRNA可在不同程度抑制目的基因的表達,而靶基因mRNA二級結構可能是引起這種程度差異的原因之一,因此在進行RNAi實驗中,siRNA的設計應將二級結構的因素考慮在內。根據(jù)測定序列設計siRNA。預實驗確定產(chǎn)生抑制效應后,利用RNAstructure3.5軟
4、件對N-RAS基因mRNA二級結構進行分析,并分別針對其二級結構與非二級結構區(qū),利用網(wǎng)絡在線工具設計共4對siRNA,分別轉染K562細胞,轉染48及72h后,分別采用RT-PCR、MTT及流式細胞檢測等方法在mRNA及細胞水平檢測干擾效果差異。對不同時間和不同靶序列的干擾效果進行橫向及縱向比較,以探討時間及靶序列對干擾效果的影響。 上述研究的實驗結果表明,K562細胞中N-RAS基因無突變,其表達水平較正常細胞高。因而可推斷,
5、在K562細胞中進行N-RAS基因的RNAi實驗可行性高,實驗結果易于檢測。siRNA導入后,可引起mRNA表達水平的降低以及細胞不同程度的凋亡。誘導凋亡的效果在72h的干擾效果大于48h,針對非二級結構區(qū)靶序列的siRNA干擾效果優(yōu)于針對二級結構區(qū)的siRNA。抑制N-RAS基因在腫瘤細胞中的表達可誘導腫瘤細胞的凋亡,證實N-RAS基因在腫瘤細胞信號轉導中起到重要作用。 綜上所述,本研究對白血病細胞株K562細胞中的N-RAS
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