利用生物信息學(xué)手段對(duì)糖尿病和前驅(qū)糖尿病進(jìn)行判別分析的相關(guān)研究.pdf

1、目的:
　　II型糖尿病(T2D)是一種世界性的疾病。據(jù)估計(jì)，全世界有3.47億人患有糖尿病。因此本研究探討用全血白細(xì)胞分子譜系的方法來鑒別、正常人和前驅(qū)糖尿病患者的可行性，試圖找出差異性基因來更深層次的研究糖尿病的發(fā)病機(jī)制。
　　方法:
　　總共收集了167個(gè)血液樣本，其中包括T2D患者87人，正常人56人，前驅(qū)糖尿病患者24人。T2D診斷標(biāo)準(zhǔn)為體重指數(shù)（Body mass index, BMI）明顯增高以及空腹血糖

2、含量大于126mg/dl，或口服葡萄糖耐量實(shí)驗(yàn)中2h血糖含量大于200mg/dl。用含約20,000個(gè)基因的安捷倫Oligo芯片對(duì)所有樣本進(jìn)行基因表達(dá)譜分析。用Gene Spring10.0軟件對(duì)基因芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，找到倍數(shù)變化值大于2，p值小于0.05的基因，并利用DAVID在線分析工具對(duì)差異基因進(jìn)行染色體定位和功能分析。用spss16.0整合樣本的所有參數(shù)構(gòu)建判別模型，最后用判別模型對(duì)樣本進(jìn)行分類。
　　結(jié)果:
　　倍

3、數(shù)變化值大于2的基因有79個(gè)，差異基因染色體定位分析發(fā)現(xiàn)1個(gè)差異基因未知其定位，其余78個(gè)差異基因在1號(hào)染色體上分布最多，有9個(gè)，其次有7個(gè)差異基因在2染色體上。從差異基因功能分類看，調(diào)控細(xì)胞增殖的差異基因最多。79個(gè)差異基因結(jié)合年齡、性別、種族共82個(gè)參數(shù)，得出最優(yōu)判別模型，該模型可以確認(rèn)95.1％的樣本，其中T2D組正確率95.9%，正常對(duì)照組正確率91.5%，前驅(qū)糖尿病組正確率100%。
　　結(jié)論:
　　差異基因散在分