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文檔簡介
1、本文對PTEN基因與肝細胞肝癌發(fā)生發(fā)展的相關性進行了研究。本研究分為兩個部分:
第一部分:PTEN基因多態(tài)性與肝細胞肝癌遺傳易感性的相關性研究。
目的:PTEN是一個抑癌基因,它控制許多生物學進程,包括細胞的增殖、遷移和死亡。本課題詣在探討PTEN基因的遺傳多態(tài)性對肝細胞肝癌(Hepatocellularcarcinoma,HCC)患病風險的影響。
方法:通過文獻報道和生物軟件的預測,我們篩選出
2、PTEN基因的四個多態(tài)性位點,它們分別為rs34421660、rs10490920、rs532678和rs701848。接著我們采用病例-對照的研究方法,在中國漢族人群的134例肝細胞肝癌患者和215例年齡、性別與之相匹配的正常對照中,對PTEN基因上的這四個多態(tài)性位點進行基因分型。其中多態(tài)性位點rs34421660利用PCR的方法直接進行基因分型,另外三個單核苷酸多態(tài)性位點利用限制性酶切片段多肽性(PCR-RFLP)方法對其進行基因分
3、型。利用SHEsis生物學軟件和SPSS13.0統(tǒng)計軟件對數(shù)據(jù)資料進行分析,驗證PTEN基因的多肽性是否與肝細胞肝癌的發(fā)生有關。
結果:PTEN基因的四個多肽性位點的等位基因和基因型頻率在病例組和正常對照組之間都沒有統(tǒng)計學的差異,接著根據(jù)它們的基因型數(shù)據(jù)和連鎖不平衡性構建了PTEN基因單倍型,統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn)單倍型T-C-C-del和T-T-T-ins與肝細胞肝癌的發(fā)生有一定的相關性。
結論:PTEN基因的單個核
4、酸多態(tài)性與肝細胞肝癌易感性無關,但是它們組成的單倍型可能與中國漢族人群的肝細胞肝癌的發(fā)生有一定的關聯(lián)性。
第二部分:PTEN基因剪接變異體與肝細胞肝癌發(fā)生的相關研究。
目的:研究PTEN基因在肝細胞肝癌組織中是否存在新的剪接變異體,探討PTEN基因在肝細胞肝癌發(fā)生發(fā)展中的作用。
方法:提取61例肝細胞肝癌組織中的總RNA,逆轉成cDNA。根據(jù)Genbank上的PTEN基因cDNA序列,設計六對不
5、同的引物并以肝細胞肝癌組織cDNA為模板分別擴增外顯子1-2、1-3、2-4、3—5、4-6和5-7之間的片段,得到的PCR產(chǎn)物進行3%瓊脂糖凝膠電泳,比較不同樣本擴增出來的目的條帶異同。
結果:每對引物分別做了61例肝細胞肝癌患者組織,3%瓊脂糖凝膠電泳后發(fā)現(xiàn)每對引物擴增出來的目的條帶大小相同,與野生型剪接體一致。
結論:PTEN基因在肝細胞肝癌中不存在新的剪接變異體,說明在肝細胞肝癌發(fā)生發(fā)展中PTEN可能
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