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文檔簡(jiǎn)介
1、研究背景
肝細(xì)胞肝癌(肝癌)是一種高度異質(zhì)的惡性腫瘤,嚴(yán)重危害中國(guó)人民的健康,其發(fā)生發(fā)展是一種多基因、多環(huán)境因素協(xié)同作用的過(guò)程,需要經(jīng)歷多個(gè)病理階段,涉及多種分子事件。近幾年對(duì)于肝癌非編碼。RNA(ncRNA)的有限研究雖然得到了一些有提示意義的數(shù)據(jù),但是尚未達(dá)到大規(guī)模轉(zhuǎn)錄組學(xué)水平,特別是small ncRNA和mRNA-like ncRNA在肝癌中差異表達(dá)的報(bào)道幾乎為空白。本研究擬通過(guò)用芯片研究新ncRNA在肝癌中的差異
2、表達(dá),填補(bǔ)肝癌相關(guān)ncRNA高通量研究的空白,首次建立肝細(xì)胞特定長(zhǎng)度范圍的ncRNA高通量測(cè)序模型,成為國(guó)際領(lǐng)先的研究領(lǐng)域。另一方面,中國(guó)的肝癌絕大多數(shù)發(fā)生于慢性乙型肝炎(乙肝)、肝硬化的基礎(chǔ)之上。雖然乙肝在中國(guó)無(wú)論是絕對(duì)數(shù)量還是相對(duì)比例在世界上都居前列,但是由于慢性乙肝的并發(fā)癥通常要幾十年才能觀察到,大陸地區(qū)頗具說(shuō)服力的大宗前瞻性隊(duì)列研究乙肝與肝癌相關(guān)的報(bào)告稀缺,尚缺乏直接針對(duì)臨床轉(zhuǎn)歸結(jié)果的長(zhǎng)期隨訪研究證據(jù)。
目的
3、> 發(fā)現(xiàn)肝癌特異表達(dá)的新非編碼基因。
發(fā)現(xiàn)肝癌早期診斷標(biāo)記物。
探索肝癌發(fā)生機(jī)制,輔助肝癌基因分型、治療方案選擇和預(yù)后預(yù)測(cè)。
探索乙型肝炎病毒感染狀態(tài)與肝癌發(fā)生的相關(guān)性。
方法:
研究一:計(jì)算處理構(gòu)建大型ncRNA數(shù)據(jù)庫(kù)。收集不同分化程度的HCC及相應(yīng)癌旁組織標(biāo)本,系統(tǒng)性記錄患者的臨床病理特征,構(gòu)建特異性ncRNA文庫(kù)。用新發(fā)現(xiàn)的small ncRNA和mRNA
4、-1ike ncRNA制備芯片,通過(guò)與芯片雜交,尋找肝癌中差異表達(dá)的靶基因,并用RT-PCR和Northern印跡驗(yàn)證。整合已有芯片數(shù)據(jù),建立肝癌相關(guān)ncRNA數(shù)據(jù)庫(kù)。
研究二:回顧性分析北京協(xié)和醫(yī)院和佑安醫(yī)院收治的接受肝切除術(shù)、并經(jīng)病理確診的乙肝相關(guān)性肝癌患者的病歷資料,以及協(xié)和醫(yī)院體檢中心的乙肝相關(guān)檢查結(jié)果。
結(jié)果:
研究一構(gòu)建了4個(gè)大型ncRNA數(shù)據(jù)庫(kù):NONCODE,antiCODE,H
5、Ptaa和HPtam。在肝癌標(biāo)本中識(shí)別出30條差異表達(dá)的新ncRNA,選擇其中6條進(jìn)行并獲得Northern印跡驗(yàn)證。
研究二共納入371名乙肝相關(guān)性肝癌患者,男/女:317/54;中位年齡53歲;ALT中位值41 U/L,48.5%在診斷時(shí)ALT水平正常;HBsAg攜帶者87.6%,乙肝大三陽(yáng)15.9%,小三陽(yáng)65.5%,HBsAg血清清除12.4%。與普通人群相比,乙肝相關(guān)性肝癌患者的大小三陽(yáng)之比無(wú)顯著性差異(P=0.
6、1460)。139人檢測(cè)了HBV DNA水平,拷貝數(shù)<103/mL、103-104/mL以及>104/mL的比例分別為51.1%、8.6%和40.3%。體檢結(jié)果中HBsAg攜帶率為2.74%(3,548/129,568)。單位組織體檢者(136/810)和個(gè)人體檢者(283/1,333)大小三陽(yáng)之比存在顯著性差異(P=0.0383)。
結(jié)論:
研究一表明,肝癌中存在諸多特異性表達(dá)的新非編碼RNA,它們?cè)诟伟┫?/p>
7、關(guān)領(lǐng)域的研究中頗具希望。需要進(jìn)一步探索其功能;分析它們與臨床病理特征之間的關(guān)系,用于肝癌診治及分型;構(gòu)建肝癌轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),理解肝癌發(fā)生發(fā)展機(jī)制;并可探索新的靶向治療基因來(lái)幫助阻止癌變。
研究二提示,乙肝小三陽(yáng)患者發(fā)生肝癌的風(fēng)險(xiǎn)可能與大三陽(yáng)患者相似;HBVDNA拷貝數(shù)低于103/mL者依然可能有較高的肝癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)。目前亟需匯集各主要醫(yī)療機(jī)構(gòu)和流行病監(jiān)控機(jī)構(gòu)的資料,進(jìn)行大規(guī)模臨床調(diào)查,為真正意義上的乙肝一級(jí)、二級(jí)和三級(jí)預(yù)防提供
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